两株高效耐盐菌的分离鉴定及生长特性研究

2015-01-20 18:52单德鑫李海统黄河
湖北农业科学 2014年22期
关键词:分子鉴定生长特性盐碱土

单德鑫 李海统 黄河 等

摘要:从大庆不同利用类型的盐碱土地区取土样,经驯化、分离筛选出两株高效耐盐菌,分别命名为A和B。经形态特征观察、生理生化试验、扫描电镜观察和16S rDNA鉴定得知,菌种 A 为脱氮嗜盐芽孢杆菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌种 B为咸鱼芽孢杆菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),均为芽孢杆菌属。经过单因素试验,得出A、B的最适生长条件均为温度30 ℃,pH 7~9,盐浓度20%,这将为以后该地区微生物资源开发利用提供理论依据。

关键词:盐碱土;高效耐盐菌;分离;分子鉴定;生长特性

中图分类号:X172 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2014)22-5395-03

松嫩平原盐渍土分布十分广泛,是我国盐渍化土壤的最大分布区,其地处半湿润半干旱区,具有广泛的闭流区和矿化度很高的无尾河,年降水量约450 mm[1],该区盐渍土主要分布在平原西部的半干旱和干旱地区,主要包括吉林西部的松原和白城地区,黑龙江的三肇、安达、大庆和齐齐哈尔等地区[2]。其中大庆的盐碱化土地面积为13.69×104 hm2,占其土地总面积的28.3%[3]。土壤盐渍化导致大量土壤资源丧失,农业生产条件恶化,严重阻碍了当地农业和农村经济的持续健康发展。因此本试验从大庆盐碱地区取样,分离筛选耐盐菌种,对当地盐碱土中微生物资源状况进行初步探索,为以后该地区微生物资源开发利用提供理论依据,为研发更加成熟的菌剂提供基础和依据。

1 材料和方法

1.1 材料

分别从大庆的盐碱地区的农田、农田秸秆还田结合区、农田休耕结合区、湖边、碱泡地、石油区取得土样,具体地点如表1所示。

培养基的组成如下。牛肉膏蛋白胨培养基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,蒸馏水1 000 mL,pH 调至7.2~7.4。牛肉膏蛋白胨琼脂培养基:牛肉膏3.0 g,蛋白胨10.0 g,NaCl 5.0 g,琼脂15.0 g,蒸馏水1 000 mL,pH调至7.2~7.4。LB培养基:酵母膏 5.0 g,蛋白胨 10.0 g,NaCl 10.0 g,蒸馏水1 000 mL,pH调至7.2~7.4。所有培养基在121 ℃,0.1 Mpa下灭菌20 min备用[4]。

1.2 菌种的分离纯化及筛选

将土壤样本分为6组,每组各取0.1 g置于100 mL三角瓶中,加入50 mL蒸馏水,加玻璃珠充分打散,于120 r/min摇床中培养3 d[5]。各取1 mL悬液稀释浓度至10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7,分别涂布到牛肉膏蛋白胨琼脂培养基培养3 d,用划线法纯化培养,然后把已经纯化得到的菌种接种到NaCl浓度分别为5%、10%、15%、20%、25%、30%和32% 的牛肉膏蛋白胨的液体培养基里[6-8],置30 ℃下培养,观察生长情况,以确定细菌耐盐程度[9]。

参考《常见细菌系统鉴定手册》,通过对菌种进行形态学观察及相关生理生化试验,从而对菌种A、B进行初步鉴定[10],扫描电镜观察进一步鉴定。而后进行耐盐菌的分子鉴定,即提取菌种的DNA,然后采用细菌16S rDNA的通用引物进行PCR扩增。BSF8/27:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′;BSR

1510/1492:5′-GGTTACCTTCTTACGACTT-3′。

PCR反应体系(50 μL):5 μL 10 × Buffer,4 μL 2.5 mmol/L dNTP,2 μL BSF8/27 引物(0.1 nmol/μL),2 μL BSR1510/1492引物(0.1 nmol/μL),0.5 μL Taq酶(5 U/μL),1 μL模板DNA,35.5 μL双蒸水。反应条件如下:

94 ℃ 预变性 5 min

94 ℃ 变性 45 s

55 ℃ 退火 90 s

72 ℃ 延伸 2 min

72 ℃ 延伸 10 min

PCR反应产物的纯化以及测序由上海生工完成。16S rDNA同源性比较与系统发育学分析将所测得的序列于Genbank上进行Blast比对,利用MEGA 4.0软件构建系统发育树[11]。

1.3 菌种的生长特性研究

为研究菌种的最适生长条件,进行单因素试验。

1.3.1 温度 向液体牛肉膏蛋白胨培养基中接入2 mL菌悬液,分别在15、20、25、30、35、40 ℃条件下培养,均做3个平行试验,120 r/min振荡24 h后,测定培养基内菌液OD值。

1.3.2 pH 将菌悬液分别接入pH为3、5、7、9、12的牛肉膏蛋白胨液体培养基内,其他条件同上,测定24 h后培养基内菌液OD值。

1.3.3 盐浓度 将菌悬液分别接入盐浓度为10%、15%、20%、25%、30%的牛肉膏蛋白胨液体培养基内,其他条件同上,测定24 h后培养基内菌液OD值。

2 结果与分析

2.1 菌种的分离纯化及筛选

将取样地样本进行初筛,共获得34株菌。再经富集培养、梯度稀释的菌液涂布于筛选培养基培养,将其纯化后转接到筛选培养基上,30 ℃培养2~5 d。在平板培养基上选取高浓度区域以外分散的单菌落,根据菌落大小、形状、颜色、隆起程度、表面光泽、透明程度、边缘形状和在高盐浓度下生长情况等差别,最终分离出2株菌落,分别命名为菌种A、B。

2.2 菌种鉴定

2.2.1 菌种形态特征观察 菌种A呈米黄色,菌体表面光滑并且湿润,单一菌落形状为长圆形,边缘平滑,在液体培养基生长浑浊,容易被挑起,没有菌膜形成,无沉淀。菌种B呈乳脂状,呈现乳白色,透明,单一菌落形状为圆形,边缘为锯齿状,菌体表面光滑且湿润,不容易被挑起;在液体培养基生长浑浊,没有菌膜形成,无沉淀。

2.2.2 菌种生理生化鉴定 菌种A、B均能进行葡萄糖氧化产酸,在生长温度测定试验中均有浑浊,无沉淀物和悬浮物产生。生长物有穿刺线向四周呈云雾状扩散,表示菌种均有运动性。其他结果见表2。

2.2.3 扫描电镜观察 菌种A和菌种B都是杆状菌,菌种A和B的扫描电镜的照片见图1,照片的放大倍数是10 000倍。菌体大小分别为(1.0~1.5) μm×(0.5~1.0) μm和(0.5~2.0) μm×(0.5~1.5) μm,均无芽孢,无鞭毛。

2.2.4 菌种的分子鉴定 菌种A及菌种B的完整基因序列长度分别是1 452 bp和1 451 bp。将菌种A的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中的数据比对发现该耐盐菌的基因序列与Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037同源性达到了99%。根据比对结果建立系统发育树,见图2。由分子鉴定结果可知,高效耐盐菌A属芽孢杆菌属。

将菌种B的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中的数据比对,该菌基因序列与Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1同源性达99%。根据比对结果建立系统发育树,见图3。由分子鉴定结果可知,高效耐盐菌B属芽孢杆菌属。

2.3 菌种的生长特性研究

2.3.1 温度对菌种生长的影响 由图4可知,菌种A和B的最适生长温度均为30 ℃,温度升高至35 ℃时,菌液的浓度降低,菌种生长十分缓慢。

2.3.2 pH对菌种生长的影响 由图5可知,菌种A在pH为7~9时生长状态良好,pH为3~5时生长十分缓慢。菌种B在pH为7~9时生长情况较好,pH为12时仍能生长。综上所述,菌种A、B的最适pH值范围为7~9,强酸的条件不适合菌种的生长,强碱性的条件菌种能够生长。

2.3.3 盐浓度对菌种生长的影响 由图6可知,盐浓度为10%~15%时,菌种A和B生长缓慢,盐浓度为15%~25%时,菌种A和B生长迅速,盐浓度为25%~32%时,菌种A和B仍能生长,但生长缓慢,综上所述,菌种A和B耐盐范围比较大,可耐受较高盐浓度。

3 小结与讨论

1)以大庆盐碱地取得的土壤样本为菌源,利用采用牛肉膏蛋白胨培养基,稀释平板法分离纯化,最终筛选得到能够最高耐受盐浓度32%的菌种A和菌种B。

2)经一系列生理生化试验鉴定和16S rDNA测序比对,菌种A 为脱氮嗜盐芽孢杆菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌种 B 为咸鱼芽孢杆菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),菌种A和B均属芽孢杆菌属。

3)通过单因素试验可知,菌种A、B最优条件组合均为:温度30 ℃,pH在7~9,盐浓度20%。在此条件下,菌种生长最好。

参考文献:

[1] 刘兴土.松嫩平原退化土地整治与农业发展[M].北京:科学出版社,2001.

[2] 宋长春,何 岩,邓 伟.松嫩平原盐渍土壤生态地球化学[M].北京:科学出版社,2003.

[3] 李取生,李秀军,李晓军,等.松嫩平原苏打盐碱地治理与利用[J].资源科学,2003(1):17-22.

[4] 周德庆,徐德强.微生物学实验教程[M].第三版.北京:高等教育出版社,2013.

[5] 姜朵朵.耐盐苯酚降解菌的筛选鉴定及其降解特性研究[D].镇江:江苏科技大学,2013.

[6] 米 琴,张玉琴,陈义光,等.青海盐环境下革兰氏阳性中度嗜盐细菌的分离及其生物学特性[J].陕西师范大学学报(自然科学版),2005,33(3):86-90.

[7] 韦 娜,张前前,杜宗军,等.极端嗜盐菌Halomonas elogata的分离鉴定及其降解偶氮染料活性兰BRF的条件优化研究[J].环境科学学报,2012,32(9):2091-2096.

[8] 程丽娟,薛泉宏.微生物学实验技术[M].西安:世界图书出版公司,2000.

[9] YOICHI K, MAKOTO O, TAKANORI I, et al. Varietal and seasonal differences in oxalate content of spinach [J]. Scientia Horticulturae,2003,97:203-210.

[10] 东秀珠,蔡妙英.常见细菌系统鉴定手册[M].北京:科学出版社,2001.

[11] 刘旭光,张 杰.分子生物学软件应用[M].北京:北京大学医学出版社,2007.

(责任编辑 彭西甜)

2.2.2 菌种生理生化鉴定 菌种A、B均能进行葡萄糖氧化产酸,在生长温度测定试验中均有浑浊,无沉淀物和悬浮物产生。生长物有穿刺线向四周呈云雾状扩散,表示菌种均有运动性。其他结果见表2。

2.2.3 扫描电镜观察 菌种A和菌种B都是杆状菌,菌种A和B的扫描电镜的照片见图1,照片的放大倍数是10 000倍。菌体大小分别为(1.0~1.5) μm×(0.5~1.0) μm和(0.5~2.0) μm×(0.5~1.5) μm,均无芽孢,无鞭毛。

2.2.4 菌种的分子鉴定 菌种A及菌种B的完整基因序列长度分别是1 452 bp和1 451 bp。将菌种A的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中的数据比对发现该耐盐菌的基因序列与Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037同源性达到了99%。根据比对结果建立系统发育树,见图2。由分子鉴定结果可知,高效耐盐菌A属芽孢杆菌属。

将菌种B的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中的数据比对,该菌基因序列与Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1同源性达99%。根据比对结果建立系统发育树,见图3。由分子鉴定结果可知,高效耐盐菌B属芽孢杆菌属。

2.3 菌种的生长特性研究

2.3.1 温度对菌种生长的影响 由图4可知,菌种A和B的最适生长温度均为30 ℃,温度升高至35 ℃时,菌液的浓度降低,菌种生长十分缓慢。

2.3.2 pH对菌种生长的影响 由图5可知,菌种A在pH为7~9时生长状态良好,pH为3~5时生长十分缓慢。菌种B在pH为7~9时生长情况较好,pH为12时仍能生长。综上所述,菌种A、B的最适pH值范围为7~9,强酸的条件不适合菌种的生长,强碱性的条件菌种能够生长。

2.3.3 盐浓度对菌种生长的影响 由图6可知,盐浓度为10%~15%时,菌种A和B生长缓慢,盐浓度为15%~25%时,菌种A和B生长迅速,盐浓度为25%~32%时,菌种A和B仍能生长,但生长缓慢,综上所述,菌种A和B耐盐范围比较大,可耐受较高盐浓度。

3 小结与讨论

1)以大庆盐碱地取得的土壤样本为菌源,利用采用牛肉膏蛋白胨培养基,稀释平板法分离纯化,最终筛选得到能够最高耐受盐浓度32%的菌种A和菌种B。

2)经一系列生理生化试验鉴定和16S rDNA测序比对,菌种A 为脱氮嗜盐芽孢杆菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌种 B 为咸鱼芽孢杆菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),菌种A和B均属芽孢杆菌属。

3)通过单因素试验可知,菌种A、B最优条件组合均为:温度30 ℃,pH在7~9,盐浓度20%。在此条件下,菌种生长最好。

参考文献:

[1] 刘兴土.松嫩平原退化土地整治与农业发展[M].北京:科学出版社,2001.

[2] 宋长春,何 岩,邓 伟.松嫩平原盐渍土壤生态地球化学[M].北京:科学出版社,2003.

[3] 李取生,李秀军,李晓军,等.松嫩平原苏打盐碱地治理与利用[J].资源科学,2003(1):17-22.

[4] 周德庆,徐德强.微生物学实验教程[M].第三版.北京:高等教育出版社,2013.

[5] 姜朵朵.耐盐苯酚降解菌的筛选鉴定及其降解特性研究[D].镇江:江苏科技大学,2013.

[6] 米 琴,张玉琴,陈义光,等.青海盐环境下革兰氏阳性中度嗜盐细菌的分离及其生物学特性[J].陕西师范大学学报(自然科学版),2005,33(3):86-90.

[7] 韦 娜,张前前,杜宗军,等.极端嗜盐菌Halomonas elogata的分离鉴定及其降解偶氮染料活性兰BRF的条件优化研究[J].环境科学学报,2012,32(9):2091-2096.

[8] 程丽娟,薛泉宏.微生物学实验技术[M].西安:世界图书出版公司,2000.

[9] YOICHI K, MAKOTO O, TAKANORI I, et al. Varietal and seasonal differences in oxalate content of spinach [J]. Scientia Horticulturae,2003,97:203-210.

[10] 东秀珠,蔡妙英.常见细菌系统鉴定手册[M].北京:科学出版社,2001.

[11] 刘旭光,张 杰.分子生物学软件应用[M].北京:北京大学医学出版社,2007.

(责任编辑 彭西甜)

2.2.2 菌种生理生化鉴定 菌种A、B均能进行葡萄糖氧化产酸,在生长温度测定试验中均有浑浊,无沉淀物和悬浮物产生。生长物有穿刺线向四周呈云雾状扩散,表示菌种均有运动性。其他结果见表2。

2.2.3 扫描电镜观察 菌种A和菌种B都是杆状菌,菌种A和B的扫描电镜的照片见图1,照片的放大倍数是10 000倍。菌体大小分别为(1.0~1.5) μm×(0.5~1.0) μm和(0.5~2.0) μm×(0.5~1.5) μm,均无芽孢,无鞭毛。

2.2.4 菌种的分子鉴定 菌种A及菌种B的完整基因序列长度分别是1 452 bp和1 451 bp。将菌种A的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中的数据比对发现该耐盐菌的基因序列与Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037同源性达到了99%。根据比对结果建立系统发育树,见图2。由分子鉴定结果可知,高效耐盐菌A属芽孢杆菌属。

将菌种B的16S rDNA基因序列与GenBank数据库中的数据比对,该菌基因序列与Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1同源性达99%。根据比对结果建立系统发育树,见图3。由分子鉴定结果可知,高效耐盐菌B属芽孢杆菌属。

2.3 菌种的生长特性研究

2.3.1 温度对菌种生长的影响 由图4可知,菌种A和B的最适生长温度均为30 ℃,温度升高至35 ℃时,菌液的浓度降低,菌种生长十分缓慢。

2.3.2 pH对菌种生长的影响 由图5可知,菌种A在pH为7~9时生长状态良好,pH为3~5时生长十分缓慢。菌种B在pH为7~9时生长情况较好,pH为12时仍能生长。综上所述,菌种A、B的最适pH值范围为7~9,强酸的条件不适合菌种的生长,强碱性的条件菌种能够生长。

2.3.3 盐浓度对菌种生长的影响 由图6可知,盐浓度为10%~15%时,菌种A和B生长缓慢,盐浓度为15%~25%时,菌种A和B生长迅速,盐浓度为25%~32%时,菌种A和B仍能生长,但生长缓慢,综上所述,菌种A和B耐盐范围比较大,可耐受较高盐浓度。

3 小结与讨论

1)以大庆盐碱地取得的土壤样本为菌源,利用采用牛肉膏蛋白胨培养基,稀释平板法分离纯化,最终筛选得到能够最高耐受盐浓度32%的菌种A和菌种B。

2)经一系列生理生化试验鉴定和16S rDNA测序比对,菌种A 为脱氮嗜盐芽孢杆菌(Virgibacillus halodenitrificans strain DSM 10037),菌种 B 为咸鱼芽孢杆菌(Piscibacillus salipiscarius strain RBU1-1),菌种A和B均属芽孢杆菌属。

3)通过单因素试验可知,菌种A、B最优条件组合均为:温度30 ℃,pH在7~9,盐浓度20%。在此条件下,菌种生长最好。

参考文献:

[1] 刘兴土.松嫩平原退化土地整治与农业发展[M].北京:科学出版社,2001.

[2] 宋长春,何 岩,邓 伟.松嫩平原盐渍土壤生态地球化学[M].北京:科学出版社,2003.

[3] 李取生,李秀军,李晓军,等.松嫩平原苏打盐碱地治理与利用[J].资源科学,2003(1):17-22.

[4] 周德庆,徐德强.微生物学实验教程[M].第三版.北京:高等教育出版社,2013.

[5] 姜朵朵.耐盐苯酚降解菌的筛选鉴定及其降解特性研究[D].镇江:江苏科技大学,2013.

[6] 米 琴,张玉琴,陈义光,等.青海盐环境下革兰氏阳性中度嗜盐细菌的分离及其生物学特性[J].陕西师范大学学报(自然科学版),2005,33(3):86-90.

[7] 韦 娜,张前前,杜宗军,等.极端嗜盐菌Halomonas elogata的分离鉴定及其降解偶氮染料活性兰BRF的条件优化研究[J].环境科学学报,2012,32(9):2091-2096.

[8] 程丽娟,薛泉宏.微生物学实验技术[M].西安:世界图书出版公司,2000.

[9] YOICHI K, MAKOTO O, TAKANORI I, et al. Varietal and seasonal differences in oxalate content of spinach [J]. Scientia Horticulturae,2003,97:203-210.

[10] 东秀珠,蔡妙英.常见细菌系统鉴定手册[M].北京:科学出版社,2001.

[11] 刘旭光,张 杰.分子生物学软件应用[M].北京:北京大学医学出版社,2007.

(责任编辑 彭西甜)

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