一个为高分辨质谱代谢组学数据提供快速预鉴别服务的微信公众号

2015-01-16 10:44
质谱学报 2015年6期
关键词:负离子四物汤代谢物

一个由军事医学科学院放射与辐射医学研究所梁乾德博士开发的微信公众号,目前公益性地提供基于四类数据库(HMDB、SWTDB、SDRSDB/SDRUDB和HMUDB)的对小分子单个高分辨电喷雾离子化(ESI)质谱质荷比(m/z)数据进行快速匹配检索(预鉴别)的服务。用户将待鉴别的m/z数值冠以数据库标识和离子模式标识,形成一个字符串,发送给公众号,可立即获得预鉴别结果(即:可能的化学结构)。匹配的m/z偏差门限为10 ppm(即:待鉴别m/z值与数据库m/z值差值的绝对值除以数据库m/z值小于等于10 ppm)。

该公众号的HMDB数据库是著名的“人类代谢组数据库”(The Human Metabolome Database,网址是http:∥www.hmdb.ca/,缩写是HMDB)的衍生数据库。是将“人类代谢组数据库”(第二版)中收录的8000余种代谢物,计算出每种代谢物在ESI条件下的4种常见负离子和6种常见正离子的理论质荷比,从而形成的衍生数据库,可用于代谢物的鉴别。

该公众号的SWTDB数据库,是“四物汤相关植物化学成分理论质荷比数据库”(四物汤相关植物包括地黄属、当归属、芍药属和藁本属植物)。是对文献报道的1000余个四物汤相关植物化学成分,计算出每种化合物在ESI条件下的4种常见负离子和6种常见正离子的理论质荷比,从而形成的数据库,可用于相关植物成分的鉴别。

该公众号的SDRSDB/SDRUDB数据库,是“Sprague Dawley大鼠血清/尿液固有成分(实测m/z信号)数据库”。HMUDB数据库是“健康青年尿液固有成分(实测m/z信号)数据库”,可用于生物样品中内源性代谢物和外源性化学成分的辨别。

更详细信息可阅读公众号历史消息中的详细说明,或与开发者联系(Email: liangqiande@yeah.net)。

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