刘 琳,郝晓明,董 会,欧 元,赵兴春,叶 健
(1.中国人民公安大学,北京100038;2.重庆市公安局巴南区分局,重庆401320;3.法庭科学生物芯片工程实验室,北京 100038;4.公安部物证鉴定中心,北京 100038)
自20世纪90年代以来,以PCR-STR技术为代表的第二代法医DNA分型技术在司法实践中的应用日益广泛,整个DNA分型过程包括DNA提取、定量、PCR扩增和电泳检测与分析,其中DNA提取与PCR扩增是两个重要的限速步骤,常规方法难以满足DNA数据库规模不断扩大和紧急案件检验的需求。本文选用AmpFℓSTRIdentifilerPlus试剂盒与TaKaRa公司的快速PCR试剂盒联合建立快速直接PCR(Rapid Direct PCR[1])反应体系,采用免提取的方式,以FTA血卡为模板,采用经优化的热循环参数在快速PCR仪上完成扩增,对如何缩短DNA分型检测的时间进行了初步探讨。
FTA血卡样本(公安部物证鉴定中心提供)
1.3.1 快速直接PCR扩增
实验分为四组,第一组:10 μL反应体系,直径0.5 mm FTA血卡为模板;第二组:10 μL反应体系,直径1.0mm FTA血卡为模板;第三组:20 μL反应体系,直径0.5 mm FTA血卡为模板;第四组:20 μL反应体系,直径1.0mm FTA血卡为模板。
四组所用热循环参数:95℃ 3 min;95℃ 10 s,59℃ 15 s,72℃ 20 s,29 个循环;72℃ 3 min;25℃保存。扩增总用时55min。
1.3.2 常规直接PCR扩增
取上述各PCR扩增产物1μL分别与10μL上样混合物(20μL GeneScan LIZ500内标 +1000μL去离子甲酰胺)混合,用3130XL遗传分析仪,按标准流程进行电泳分离,采用GeneMapper ID V 3.2软件进行基因分型。
图1 10μL反应体系,直径0.5mm FTA血卡为模板
如何缩短DNA分型检测时间一直是法医界学者们研究的焦点之一,例如,Verheij[2]等在 2012年将Thermo快速PCR试剂盒与AmpFℓSTRSGM PlusTM、AmpFℓSTRIdentifiler、AmpFℓSTRSEfilerPlusTM、AmpFℓSTRNGMTM分别组合,探索快速直接PCR扩增在法庭科学领域的应用。
图2 10μL反应体系,直径1.0mm FTA血卡为模板
图3 20μL反应体系,直径0.5mm FTA血卡为模板
参考文献:
[1]Aboud M,Oh HH,McCord B.Rapid Direct PCR for Forensic genotyping in under 25 minutes[J].Electrophoresis,2013,34(11):1539-1547.
[2]Verheij S, Harteveld J, Sijen T.A protocol for direct and rapid multiplex PCR amplification on forensically relevant samples[J].Forensic Science International: Genetics, 2012,6(2):167-75.