三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus) CYP4C基因的cDNA克隆及表达分析*

2014-04-16 03:29张晓燕杨爱国
海洋与湖沼 2014年1期
关键词:梭子蟹凡纳滨对虾

张晓燕 李 健 刘 萍 陈 萍 孙 铭, 3 杨爱国



三疣梭子蟹() CYP4C基因的cDNA克隆及表达分析*

张晓燕1, 2李 健1①刘 萍1陈 萍1孙 铭1, 3杨爱国4

(1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071; 2. 上海海洋大学 上海 201306; 3. 中国海洋大学 青岛 266071; 4. 青岛汇泉海洋科技开发有限公司 青岛 266071)

采用RT-PCR及Smart-TMRace技术, 首次获得三疣梭子蟹CYP4C基因cDNA全长序列。该基因全长1888bp, 编码一个由514个氨基酸组成的多肽, 预测分子量大小为59.54kDa, 理论等电点为8.08。氨基酸序列中含有CYP基因家族特有的K螺旋保守序列(ExxR)和血红素结合区(FxxGxxxCxG)。同源性及系统进化分析表明, 三疣梭子蟹CYP4C基因与岸蟹、凡纳滨对虾、日本沼虾、中国对虾、沟虾、红螯螯虾的同源性分别为88%、72%、66%、59%、60%、59%。荧光定量RT-PCR结果表明, CYP4C在肝胰腺、肌肉、眼柄、鳃和心脏中均有分布, 在肝胰腺中表达量最高。高盐(45)胁迫后, 三疣梭子蟹CYP4C的表达量显著高于对照组, 随着胁迫时间的延长出现逐渐降低的趋势, 在胁迫48h后表达量达到对照组水平; 低盐(11)胁迫条件下, CYP4C的表达水平随着胁迫时间的延长呈现逐渐下降的趋势, 且从胁迫6h开始显著低于对照组。研究推测, CYP4C基因参与三疣梭子蟹盐度适应调节, 是蜕皮机制的调控因子之一。

三疣梭子蟹(), CYP4C, 基因克隆, 表达, 盐度胁迫

细胞色素P450(cytochrome P450, CYP)酶系是一个广泛存在于动物、植物和微生物等各种生物有机体中的超基因家族, 它参与多种外源物质(药物、有机污染物等)和内源物质(蜕皮激素、脂肪酸、保幼激素等)在生物体内的转化与代谢过程(Simpson, 1997; 冷欣夫等, 2001), 是细胞色素P450家族中最古老的家族之一。在脊椎动物中, 主要参与脂肪酸及前列腺素的ω-羟基化, 参与胆汁酸的生物合成(Lundell, 2002); CYP4在昆虫中的研究较为深入, 可以被许多外源物质(烟碱、杀虫剂、外毒素等)诱导, 参与昆虫的解毒机制及蜕皮激素、保幼激素等内源物的合成、代谢(Feyereisen, 1999; 腾达等, 2004; 李秀兰等, 2005; 王燕红等, 2009)。在海洋无脊椎动物中, CYP4的研究相对较少, 甲壳动物中仅有岸蟹()、美洲螯虾()、沟虾()和凡纳滨对虾()等少数物种的CYP4基因得到克隆(Snyder, 1998; Aragon, 2002; Rewitz, 2003; 夏西超等, 2012), 主要涉及多环芳烃类、海洋污染物等外源物质对其的诱导作用及其代谢, 以及参与蜕皮激素等内源物质的合成代谢等功能的研究, 而有关三疣梭子蟹()这方面的研究尚未见报道。

三疣梭子蟹(), 属于甲壳纲(Crustacea)、十足目(Decapoda)、梭子蟹科(Portinidae), 梭子蟹属(), 广泛分布于中国近海、日本、朝鲜半岛及马来西亚群岛等海域(薛俊增等, 1997), 是我国大型海产经济蟹类, 生长快、肉味鲜美, 营养价值和经济价值都较高, 现已成为我国重要的人工养殖和海洋捕捞种类之一。

盐度是影响水生动物生理状态的主要环境因子之一, 盐度的变化对虾蟹类蜕皮、生长代谢及免疫都有显著的影响(Mu, 2005; Romano, 2006; 杨其彬等, 2008; 王冲等, 2010)。CYP4作为生长、蜕皮和调控代谢相关基因, 环境因子的急剧变化对其产生影响方面的研究, 目前尚未见报道。本研究通过克隆获得三疣梭子蟹细胞色素CYP4C基因全长序列, 并对其在急性盐度胁迫下组织表达特征进行了初步研究, 以期为三疣梭子蟹CYP4C与环境盐度适应的相关性研究及其在盐度适应过程中生理功能的研究提供依据。

1 材料与方法

1.1 材料

实验动物 本实验选择三疣梭子蟹体重在100—120g的健康个体, 于山东昌邑市海丰水产养殖有限责任公司室内水泥养殖池进行实验。

实验试剂 SMARTTMRACE Amplification Kit和Advantage 2 PCR Kit购自Clontech公司; TaKaRa LA Taq 、M-MLV、Oligo(dT)18、DNaseⅠ、PMD18-T和Top10感受态细胞购自TaKaRa公司; Trizol Reagent 购自Invitrogen公司; 实验所用引物为上海生物工程有限公司合成, 其他试剂均为国产分析纯。

1.2 总RNA的提取和cDNA的合成

取健康三疣梭子蟹的肝胰腺于液氮中研磨, Trizol试剂提取总RNA, 核酸蛋白测定仪(Biodropsis, BO-1000)与1.0%琼脂糖凝胶电泳检测其质量及完整性, DNaseⅠ去除基因组DNA后, 用M-MLV Promega产品完成第一链cDNA合成, 反转录产物于-20°C冰箱保存备用。

1.3 三疣梭子蟹CYP4C基因cDNA片段的克隆

从NCBI中搜寻沟虾()、红螯螯虾()、岸蟹()和凡纳滨对虾()的CYP4C cDNA序列, 利用ClustalX对以上序列进行同源性对比以确定其保守区域, 设计兼并引物F和R。以三疣梭子蟹肝胰腺cDNA为模板, 以F和R为引物, 进行三疣梭子蟹CYP4C基因中间片段的扩增。PCR扩增体系为50μL, 反应条件: 94℃预变性5min; 94°C 30s, 55°C 30s, 72°C 1min, 30个循环; 最后72°C延伸10min, 4°C保存。2.0%琼脂糖凝胶电泳检测所扩增的片段大小。扩增的PCR产物使用SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒进行回收纯化, 与pMD18-T载体连接, 转化大肠杆菌TOP10感受态细胞, 阳性克隆经菌落PCR鉴定后, 送往上海生物工程有限公司进行测序。

1.4 CYP4C基因全长的克隆

测序结果经NCBI比对(http://www.ncbi.nlm. nih.gov)后, 其实验所得三疣梭子蟹CYP4基因部分序列与其他物种的CYP4基因同源。以已获得的CYP4C基因片段设计3′和5′RACE特异性引物race3′和race5′(表1)。利用SMARTTMRACE Amplification Kit扩增得到cDNA全长。

表1 本研究所用引物序列

Tab.1 The sequence of primers used in this study

1.5 序列分析

使用NCBI网站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)的BLASTN和BLASTX软件对CYP4基因的同源性进行分析, 在http://www.expasy.ch/tools/pi上进行蛋白质理化性质分析。利用PredictProtein服务器对CYP4C蛋白序列进行功能位点分析(PROSITE motif search), 利用SignalP3.0(http: //www.cbs.dtu.dk/services/ SignalP/)_tool.html)工具进行蛋白信号肽分析, 采用Vector NTI Advance10.3软件和ClustalW软件将克隆的序列和已知的其他物种的氨基酸序列比对及同源性分析, 用MEGA 4.1软件构建Neighbor-joining系统进化树。

1.6 半致死盐度预实验

三疣梭子蟹的适应盐度为13—38, 最适生活盐度为20—35(季东升, 2005)。选取11、17、23、30、37、45六个盐度进行半致死盐度预实验, 在7天的预实验中发现, 盐度30的实验组死亡率为零, 在72h和96h的半致死盐度分别为45和11。因此, 本实验选择11和45为极限盐度组, 30为正常对照组。

1.7 急性盐度胁迫实验

选择11、30和45三个盐度分别作为低盐、对照和高盐3个实验处理组, 每个处理组设3个平行, 各实验组盐度由天然海水加海水晶或24h曝气自来水配置而成。三疣梭子蟹由室外养殖池塘转移到盐度为30的海水中暂养7天开始试验。每个处理每个平行分别挑选30只健康个体进行实验, 分别于胁迫后0、3、12、24、48、72h取肝胰腺组织, 液氮保存, 用于RNA的提取, 每个时间点取6只。另取3只健康三疣梭子蟹的肝胰腺、鳃、肌肉、心脏和眼柄组织, 液氮保存, 用于测定CYP4C基因在不同组织中的表达 分析。

1.8 CYP4C基因mRNA Real-time PCR定量检测

取三疣梭子蟹各个组织和经盐度胁迫后的不同时间点的肝胰腺组织的cDNA, 用DEPC水稀释10倍作为模板, 进行CYP4C基因的表达量检测。荧光定量PCR扩增体系为25μL, 包括: SYBR Premix Ex TaqTM II(2×) 12.5μL, ROX Reference Dye II 0.5μL, cDNA模板2μL, PCR正反引物(10μmol/L)各1μL, DEPC水8μL。以三疣梭子蟹18S rRNA为内参基因(表1), 以F1和R1为引物(表1), 进行CYP4C基因荧光定量分析。PCR反应条件: 95°C 30 s; 95°C 5 s, 60°C 34 s, 40个循环, 每个样品采取三个平行。实验使用Applied Biosystems 7500 Real-Time PCR荧光定量PCR仪, 采用2-DDCT法进行数据分析, 用SPSS 11.0软件进行显著性分析(<0.05)。

1.9 数据分析

所得数据均表示为平均数±标准误(mean±SE), 采用SPSS统计软件进行单因素方差分析, 并进行Duncan 氏多重比较(<0.05)。

2 结果

2.1 CYP4C基因全长cDNA序列分析

采用RACE方法扩增获得三疣梭子蟹CYP4C基因全长cDNA序列, GenBank登录号: JN835470。CYP4C基因全长1888bp, 其中, 开放阅读框(ORF)为1545bp, 5′和3′的非编码区分别为122bp和223bp, 编码一个由514个氨基酸组成的多肽, 预测分子量大小为59.54kDa, 理论等电点为8.08。3′端含有一个终止密码子(TGA), 并含有多腺苷酸信号ATTAAA和poly(A)尾。

利用Predictprotein对三疣梭子蟹CYP4C蛋白序列进行功能位点分析(PROSITE motif search), 发现该蛋白序列具有多个功能位点, 包括3个N端糖基化位点(296-299, 329-332和482-485); 5个酪蛋白磷酸化位点: (206-209, 258-261, 305-308, 361-364, 484-487); 3个肉蔻酰基位点: (125-130, 197-202, 459-464); 8个蛋白激酶K磷酸化位点: (105-107, 130-132, 136-138, 161-163, 356-358, 413-415, 483-485, 511-513); 2个酰胺化位点: (130-133, 282-285); 1个P450家族特有的亚铁血红素结合区(450-459)。

图1 三疣梭子蟹CYP4C基因的核甘酸序列及其推导的氨基酸序列

方框内的ATG为起始密码子, 终止密码子由*表示, 双划线为CYP4家族特征序列, 位于保守的I螺旋区; 方框内是K螺旋保守区, 黑粗线为血红素结合区保守序列(FxxGxxxCxG)

2.2 CYP4C基因多序列比对及系统进化树分析

使用Clustal W1.8软件对三疣梭子蟹CYP4C氨基酸序列进行同源序列分析, 结果如图3所示。三疣梭子蟹CYP4C基因与岸蟹()、凡纳滨对虾()、日本沼虾()、中国对虾()、沟虾()、红螯螯虾()的同源性分别为88%、72%、66%、59%、60%、59%。利用MEGA 4.1软件进行系统进化分析, 结果表明, 三疣梭子蟹CYP4C基因与甲壳动物中的青蟹紧密聚为一支, 之后又与凡纳滨对虾和日本沼虾聚为一支(图2)。

2.3 CYP4C基因在三疣梭子蟹各组织中的表达

Real-time PCR结果表明: CYP4C基因在心脏、肌肉、肝胰腺、眼柄和鳃中都有表达。其中, 在肝胰腺中表达量最高, 其次是鳃, 在心脏中表达最少(图4)。

Real-time PCR检测三疣梭子蟹肝胰腺在盐度胁迫(高盐、低盐)下的各个时间点CYP4C基因转录表达的变化如图5所示。结果发现, 高盐胁迫后, 三疣梭子蟹CYP4C的表达量显著高于对照组, 随着胁迫时间的延长出现逐渐降低的趋势, 在胁迫48h后表达量达到对照组水平; 低盐胁迫条件下, CYP4C的表达水平随着胁迫时间的延长呈现逐渐下降的趋势, 且从胁迫6h开始显著低于对照组(<0.05)。

3 讨论

本研究首次克隆了三疣梭子蟹CYP4C基因全长cDNA序列, 全长1888bp, 编码一个由514个氨基酸组成的多肽。通过与已知的P450家族的氨基酸序列比对发现, 该基因的氨基酸序列中含有典型的P450蛋白保守序列。这些区域包括: P450最具有特征的血红素结合区(FxxGxxxCxG)和绝对保守的半胱氨酸(Cys); 位于螺旋K中的绝对保守序列(ExxR), 以及疏水螺旋I区的中心部分(GxxT)。其蛋白序列还包含糖基化、磷酸化、酞基化等多个功能位点, 有助于进一步研究蛋白质的主要定位、稳定性结构以及功能作用的发现。系统进化分析发现, 三疣梭子蟹CYP4C基因与甲壳动物的青蟹、凡纳滨对虾和日本沼虾的亲缘关系最近。

图2 不同物种的CYP4C基因系统进化树

图3 三疣梭子蟹CYP4C氨基酸序列与其他甲壳动物CYP4的氨基酸序列比对

相同的氨基酸用暗色背景表示; 缺失的氨基酸用“.”表示; 所使用CYP4基因的GenBank登录号见图2

图4 三疣梭子蟹CYP4C基因在器官/组织中表达量

细胞色素P450是一种广泛存在于生物界的多功能酶系, 不仅具有显著的种属差异性, 还表现出组织、器官的差异性。如在脊椎动物中, P450在肝脏中的含量最丰富, 其他组织如皮肤、肺、肾、胃、脑、消化道、胃肠道、淋巴细胞、单核粒细胞和骨髓等组织中也有发现(Arukwe, 2002; Ortiz-Delgado, 2002; 任彭等, 2006); 在昆虫中, 中肠、脂肪体以及马氏管的P450含量比较丰富(邱立红等, 1999; 邱星辉等, 2000); 在鱼类中, 在肝、肠、肾、鳃等组织中表现出较高的转录水平(朱磊等, 2011)。本实验的研究结果表明, 三疣梭子蟹CYP4C基因在肝胰腺、鳃、肌肉、眼柄和心脏中都有表达, 在肝胰腺中表达量最高, 说明肝胰腺是CYP4C基因的主要合成场所, 在凡纳滨对虾的研究中也有类似结果(夏西超等, 2012)。许多学者认为, CYP450在组织器官中的分布具有选择性, 如肝脏作为药物代谢的主要场所, CYP450的含量也是最丰富的。鳃、皮肤等组织作为外源物质进入体内的第一道防线, 其含量也是比较高的。CYP450的这种选择性分布, 可以在生物体最大限度的发挥作用(Hodgson, 1985; 邱星辉等, 1997)。

图5 三疣梭子蟹CYP4C基因在盐度胁迫条件下不同时间点的表达量

盐度变化能够引起甲壳动物自身的渗透调节, 适当地降低盐度能够缩短甲壳动物的蜕皮周期、提高蜕皮率达到促进生长的作用(Bray, 1994; Mu, 2005; 李英等, 2010)。有节律地降低盐度可以提高中国对虾()的蜕皮率, 加快其生长(Mu, 2005)。青蟹在盐度15时退壳率明显高于盐度25实验组(于忠利等, 2010), 罗氏沼虾、斑节对虾等广盐性物种也有低盐环境加快蜕皮的现象(徐桂荣等, 1997; 杨其彬等, 2008)。甲壳动物的蜕皮活动主要受蜕皮激素的调控, CYP4家族在蜕皮激素20E代谢中发挥着重要作用, 是生长蜕皮相关基因(Simpson, 1997; Gilbert, 2009)。Aragon等(2002)发现CYP4C15基因在小龙虾Y-器官中显著表达, 岸蟹表皮部位的CYP4C39与蜕皮激素降解有关(Rewitz, 2003), 夏西超等(2012)发现KK-42可显著抑制凡纳滨对虾血淋巴CYP4V18表达, 并可诱导蜕皮激素20E的浓度升高。鉴于盐度对蜕皮活动的影响以及CYP4家族基因在蜕皮激素代谢中发挥的重要作用, 本研究探讨了盐度与CYP4C基因的相关性, 结果显示: 低盐胁迫下能够显著降低CYP4C基因在三疣梭子蟹肝胰腺中的表达, 并于6h之后达到稳定的低水平状态; 高盐胁迫下, 24h之内, CYP4C的表达量显著高于对照组, 之后略有下降。说明CYP4C能够适应盐度变化, 其表达量随盐度变化波动并于一定时间达到稳定。推断在高盐条件下诱导表达, 抑制蜕皮激素的合成, 延长蜕皮周期; 而低盐能显著降低CYP4C的表达量, 诱导蜕皮激素的合成, 提高蜕皮率。

本研究首次成功克隆了三疣梭子蟹CYP4C基因cDNA全长, 通过分析急性盐度胁迫下的三疣梭子蟹肝胰腺中CYP4C基因的表达特征, 可以进一步认定CYP4C参与了三疣梭子蟹的盐度适应性调节过程, 推断CYP4C是盐度影响蜕皮的重要调控因子之一, 为深入研究三疣梭子蟹CYP4C基因在甲壳动物蜕皮机制中的作用奠定了基础。

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CLONING AND EXPRESSION OF CYP4C GENE IN

ZHANG Xiao-Yan1, 2, LI Jian1, LIU Ping1, CHEN Ping1, SUN Ming1, 3, YANG Ai-Guo4

(1. Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao 266071, China; 2. Ocean University of Shanghai, Shanghai 201306, China; 3. Ocean University of China, Qingdao 266071, China; 4. Qingdao Huiquan Ocean Science and Technology Development Company Limited, Qingdao 266071, China)

A complete cDNA sequence of CYP4C gene inwas first cloned in RT-PCR and Smart-TMRace technology. The length of the CYP4C gene is 1888bp encoding a protein of 514 amino acids. Bioinformatics analysis deduced that the CYP4C gene protein molecular weight is 59.54kDa with a theoretical pI 8.08. The amino acid sequence has CYP conserved domains of helix K (ExxR) and heme-binding motif (FxxGxxxCxG). Blast analysis revealed that the similarities of CYP4C with,,,,,were 88%, 72%, 66%, 59%, 60%, 59%, respectively. Real-time fluorescent quantitative PCR was used to assess the mRNA expression of CYP4C in different tissues and its expression level of CYP4C in salinity stress. The results show that CYP4C could be expressed in all tested tissues of, including hepatopancreas, muscle, eyes, gills, and heart, among them the highest expression level was observed in hepatopancreas, while the lowest in heart. The expression level of CYP4C was up-regulated distinctly in the hepatopancreasat salinity 45, and then gradually reduced with time to the level of control group after 48 h, while at salinity 11, the CYP4C expression dropped significantly below that of the control group 6 h later. The results imply that CYP4C is involved in the accommodation to salinity change and play an important role in its molting.

; CYP4C; gene cloning; expression; salinity stress

10.11693/hyhz2012122700121212272

* 国家863计划课题, 2012AA10A409号; 中央级公益性科研院所基本科研业务费项目资助, 20603022012021号。张晓燕, 硕士研究生, E-mail: yanerzhang2006@163.com

李健, 研究员, E-mail: lijian@ysfri.ac.cn

2012-12-27,

2013-03-15

Q78

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