陈灵芝,王兰兰,魏兵强
茄子种质资源数据库的建立
陈灵芝,王兰兰,魏兵强
(甘肃省农业科学院蔬菜研究所,甘肃兰州,730070)
采用动态web数据库的策略,执行浏览器/服务器(B/S)的体系结构,建立了基于Internet的甘肃茄子种质资源数据库平台,应用数据库查询茄子种质及相关性状,有利于茄子种质资源综合评价和利用。
茄子;种质资源;数据库平台
茄子品种资源研究是培育优良茄子品种的基础,新品种选育成功的关键因素之一就是选择亲本,亲本的选配有赖于育种者的学识和经验以及育种者对茄子品种资源的综合评价。从大量的茄子品种资源中选择综合性状好、具有某种特殊性状的资源并非易事,如果利用计算机查询数据,就能大大提高工作效率[1]。甘肃省农科院蔬菜研究所长期从事茄子新品种选育工作,在育种过程中,积累了一大批茄子种质资源及其相关的农艺、经济性状数据。为了便于科学地积累和管理数据,为茄子育种选配亲本提供科学依据,本研究编制了可用于贮存、管理和综合查询各种数据的甘肃茄子种质资源数据库。
茄子品种资源及各种性状数据来自甘肃省农业科学院蔬菜研究所收集、保存的茄子品种资源,包括甘肃农家品种、各省市的茄子品种、育种中间材料和国外资源等。
2.1 数据库总体设计方案
利用数据库管理和应用软件开发系统,将甘肃省农业科学院蔬菜研究所所收集的茄子资源归类整理,建立由种质资源数据管理、种质资源数据检索和种质资源互联网信息发布等模块构成的管理平台,以方便育种过程中的资源评价、筛选,加强相关育种单位的信息交流。
2.2 数据的采集和规范
在数据采集时根据茄子资源利用的基本要求,结合国家制定的自然科技资源平台茄子种质资源规范化标准,对种质资源进行描述,以茄子种质资源的收集、保存、鉴定、评价、研究利用为宗旨,实现茄子种质资源的充分共享和可持续利用。名词术语与国家或国际标准保持一致,确保数据的规范性、严密性、科学性。
2.3 数据库库表结构的设计
首先依据植物学分类,结合收集的资源情况,将茄子资源划分为三大类,分别是:长茄、圆茄、矮茄,如图1。
每个类型的性状描述共包括38个信息,分为4个部分。第1部分是基本信息,共9项,包括统一编号、品种名称、译名、原产地、类型、选育单位、选育方法、选育亲本、种子来源地,从这部分可以了解种质资源的基本状况;第2部分是性状调查信息,共22项,包括果形(扁圆、圆球、高圆、卵圆、长卵、短筒、长筒、长条、线形)、果长、果宽、单果质量评价(大、中、小)、果顶(凹、平、凸)、果面光泽(无、有)、商品果色(白、白绿、绿、橘红、浅紫、鲜紫、紫红、黑紫)、老熟果色(黄、红)、果实弯曲度(U形、镰刀形、蛇形、微弯、直)、果萼颜色(绿、绿紫、紫)、果肉色(白、黄白、绿白、绿)、花色(白、绿白、浅紫、紫)、主茎色(绿、浅紫、紫、深紫)、茎茸毛(有、无)、叶色(黄绿、浅绿、绿、深绿)、叶形(卵圆、长卵圆)、株型(直立、半直立、开展)、株高、株幅、结果性(多、中、少)、熟性(早、中、晚)等。第3部分是抗性鉴定结果表,包括茄子黄萎病、绵疫病、菌核病、炭疽病、抗寒性、抗旱性等。第4部分是多媒体数据信息,包括照片等。
2.4 网络平台的实现
远程数据访问采取动态Web数据库的策略,浏览器/服务器(B/S)体系结构,通过接口程序为用户提供一种格式统一、直观高效、易学易用、功能完备的人机交互的图形界面,使终端用户无需安装客户端界面程序,在任何一个地方只要通过一个普通的浏览器软件即可实现对数据库的访问,进行数据传输、检索与查询[2]。
①种质资源数据库平台的环境设计 选用ASP2.0做为平台的主导设计语言,Access2003做为数据库的支撑平台,网络平台采用windows2003Server操作系统,Internet Information Server5.1提供Web服务,动态网页采用MacromediaDreamweaver MX创建ASP程序。
②种质资源平台的数据库结构 利用Access2003软件,将茄子资源的多种性状集成在一个数据库中,内含多张数据表,这种数据库结构与以前的数据库结构相比,具有管理集中、维护方便、数据安全等特点。
查询窗口由以上所列各信息组成,用户可根据自己的需要选择任一入口进行数据库的访问,还可提供多条件的组合查询,为选择特定性状的茄子种质提供快速查询手段,例如用户想筛选:果长≥35 cm,单果质量≥60 g,果宽≥5 cm的品种,分别在对应的性状窗口中输入查询条件,如图2,确认后,系统就会给出查询结果界面,如图3。
图1 数据库平台主界面
图2 数据查询界面
图3 数据查询结果输出界面
3.1 存在的问题
图文并茂的数据资料可以大大丰富记录内容,也可给人提供最直观的视觉效果,育种者结合田间记载资料,可进一步对材料做出正确客观的评价,但由于资料的采集、数据录入是一项费时费力的工作,常受经费、人员等条件限制。另外,建设种质资源数据库,是为了更好地利用种质资源,因此,一方面要加强现有种质资源的利用,以现有资源为材料,进行种质创新和新品种选育。另一方面,要不断丰富种质资源库和种质资源数据库,从而更好地为新品种选育服务[3]。
3.2 数据库平台应用前景
传统的数据信息只能以纸介方式管理,查询检索时只能逐页、逐行查找[4],极不适应育种、生产者对种质信息的获取和研究需求,种质资源数据库平台促进了茄子种质信息的共享,扩大了信息交流范围,提高了茄子种质的利用效率,在充分发挥品种资源数据信息优势的基础上,可更好地为育种工作者和生产部门服务。
[1]唐荣华,高国庆.花生种质资源数据库建立及应用研究[J].中国油料作物学报,2001(23):70-72.
[2]郭卫,王明霞.基于 Internet的蔬菜栽培专家系统的开发[J].河北农业大学学报,2003(26):283-284.
[3]易懋升,黎扬辉.红掌种质资源数据库的建立[J].广东农业科学,2005(1):8-11.
[4]陈伟英,王晓娟.甘肃省农作物种质资源数据库及查询系统的建立[J].甘肃农业科技,2003(4):22-24.
Establishment of Database of Eggplant Germ Plasm Resource
CHEN Lingzhi,WANG Lanlan,WEI Bingqiang
(Institute of Vegetables,Gansu Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730070)
Use the strategy of dynamic web-database and perform the architecture of Browser/server(B/S)to develop the database platform on eggplant germplasm based on internet technologies.It is favourable to utilize the database for management and comprehesive evaluation of eggplant germplasm.
Eggplant;Germ plasm resource;Database
10.3865/j.issn.1001-3547.2010.10.004
陈灵芝,女,副研究员,主要从事辣椒、茄子育种及栽培工作,电话:0931-7616788,E-mail:gschlzh38@sina.com
王兰兰,通信作者,研究员,硕导,主要从事辣椒育种及栽培工作
2010-01-06