基因组研究

科学院北京基因组研究所宋述慧研究员和鲍一明研究员受邀在国际学术期刊The Innovation在线发表题为“MPoxVR - A comprehensive genomic resource for monkeypox virus variants surveillance”的评论文章，系统比较并介绍了猴痘病毒信息库MPoxVR的数据资源及特色功能。1970年在刚果民主共和国发现首例猴痘病毒感染者以来，猴痘疫情先后多次在中西非国家爆发。自2022年5月至今

量学的烟草基因组研究知识图谱分析张玉婵1，田嘉树1，王晓丽2，景艺卓1，黄五星1，韩丹1*，许自成11河南农业大学烟草学院，河南郑州 450002；2湖北省烟草公司襄阳市公司，湖北襄阳 441003【目的】明确烟草基因组领域研究现状、发展历程、重点前沿及未来研究的方向。【方法】运用文献计量学，结合CiteSpace文献可视化软件，对中国知网（CNKI）和Web of Science两个数据库中的烟草基因组研究文献进行数据挖掘。【结果】（1）近年来关于烟草基

科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）慈维敏团队和北京大学第三医院泌尿外科马潞林团队合作，解析肿瘤组织和配对癌栓组织的肿瘤生态系统。该研究通过全景式地刻画肾透明细胞癌原发肿瘤和癌栓的肿瘤微环境差异，为进展期肾癌治疗和缩减癌栓提供潜在的治疗通路及靶点。该研究还发现组织驻留型CD8+T细胞可作为潜在肾癌免疫治疗标记物，进一步为肾癌和癌栓免疫治疗提供理论依据。相关研究成果以“Decoding the multicellular ecosystem of ve

。至此，古基因组研究新纪元正式开启。目前，古基因组数据已有六千余个，但这些数据也只能让我们初步了解人类演化史。受限于保存状况，目前大部分古基因组数据来源于寒冷干燥的地区，而亚洲南方、非洲、美洲、大洋洲等地区的古基因组数据还较为有限，这个问题在“年龄”超过三万年的个体基因组上尤为突出。因此，未来古DNA领域可以着重对这些地区进行一些有针对性的研究。（Science, 2021, 373(6562)）古基因组数量

印第安人的基因组研究表明，事实确实如此。7月8日，《自然》发表的一项研究提出了新证据，证明美洲与波利尼西亚东部在史前时代即有航海接触。对现代和古代个体的遗传数据分析，闡明了波利尼西亚的历史，帮助解决了一个长期悬而未决的争论：美洲原住民对于波利尼西亚人有何影响。在这项研究中，墨西哥生物多样性基因组学国家实验室的Andrés Moreno-Estrada、Alexander Ioannidis和同事分析了800多名波利尼西亚人和美洲原住民的基因组，并推断二者应

和深圳农业基因组研究所在The Plant Cell 在线发表了一篇题为“Genetic regulation of ethylene dosage for cucumber fruit elongation”的研究论文，揭示了乙烯剂量依赖的黄瓜果实伸长的遗传和分子机制。在这项研究中，研究人员以2个黄瓜短瓜材料（sf1突变体和acs2 突变体）为对象，研究了乙烯剂量精细调控黄瓜果实伸长的分子机制。sf1突变体表现为果实细胞分裂减弱并且产生过量乙烯，acs2

发颜色的全基因组研究，由中国科学院、伦敦国王学院、荷兰伊拉斯姆斯大学联合其他国家的研究人员合作进行。科学家通过问卷和专家评估结合的方式，精确量化了近30万人的头发颜色状况，并分析了800多万个遗传位点和头发颜色的关系，最终新发现超过100个新的遗传位点和头发颜色存在显著关联。该研究的共同第一作者、中科院北京基因组研究所的刘凡研究员说，此发现深入解析了头发颜色的遗传力，揭开人类色素表型表达变異的分子基础。基于新发现位点的人类头发颜色预测有更高的准确性，在法医

华大公司的基因组研究所培育出了一种微型猪。它们由小品种的巴马猪基因改造而来，体重15公斤，与中型犬差不多大，一开始它们是作为人体疾病的动物模型而培育的。专家预计这些微型猪的售价每头最少要1万元。为了培育这种微型的巴马猪，科学家通过干扰基因生长因子的表达克隆出公猪，再将之与母猪进行交配。相比之下，原来的巴马猪重量在35～50公斤之间，而家养的猪体重一般都超过110公斤。在不久的将来，通过基因编辑技术，购买微型猪的消费者或许还能选择不同的肤色和样式。（资料来源

中科院北京基因组研究所杨猛团队历时5年攻关，破译了橡胶树全基因组，发现了一个可能促使橡胶树进化出高产胶特性的基因组，并提出了乙烯刺激增产机制的新观点。2016年5月23日国际植物学顶级期刊《Nature Plants》（《自然-植物》）在线发表了唐朝荣团队的研究成果。2016年6月2日出版的最新一期《Nature》（《自然》）杂志在研究亮点栏目中也介绍了该研究成果，体现了国际学术权威对该项成果的关注。唐朝荣博士表示，橡胶树产胶潜力的发掘空间很大，即使是产量

院深圳农业基因组研究所、中国科学院遗传与发育研究所以及英国《自然·遗传学》杂志等单位共同主办，国内外300多名知名学者围绕农业基因组学、种子资源与育种等展开学术交流。中国农业科学院深圳农业基因组研究所所长钱前研究员介绍说，我国已经完成水稻、小麦、玉米及黄瓜等大概70%～80%重要的作物基因组测序完成，初步掌握了这些作物遗传基因的功能性状，研究水平已走在国际前列。

院深圳农业基因组研究所、中国科学院遗传与发育研究所以及英国《自然·遗传学》杂志等单位共同主办，国内外300多名知名学者围绕农业基因组学、种子资源与育种等展开学术交流。中国农业科学院深圳农业基因组研究所所长钱前研究员介绍说，我国已经把水稻、小麦、玉米以及黄瓜等大概70%～80%重要的作物基因组测序完成，初步掌握了这些作物遗传基因的功能性状，研究水平已走在国际前列。

会 ——以基因组研究为例对于中国来说非常重要的一点就是注重发展基础科学，而不是一味地强调应用科学。如果中国有强大的基础科学研究，那么中国就有无穷的潜力。基础科学的重要性不言而喻，比如生物基础科学可以让人们清楚人类疾病发生的基因原因。基因组研究仅仅刚开始，我们还需要研究基因组与整个生理学的关系，这需要数年时间，是基因组研究的一个好机会。让我惊讶的是，其他国家的政府，比如美国、欧洲并没有意识到我们所面临的巨大机会。幸运的是中国正在逐渐加大对基础科学的研究投入，

共同启动驴基因组研究项目。该研究将绘制驴基因组精细图谱，从分子水平上解码阿胶特殊药效的成因，鉴定出影响驴皮、肉、奶、生长速度、繁殖力等性状的DNA标记，通过基因测序培育优质毛驴。启动大会上，东阿阿胶与山东省农科院、华大基因三方签订了“驴基因组研究协议”。自2002年起，东阿阿胶先后在新疆、内蒙古、甘肃等地陆续建立了20个毛驴药材养殖示范基地，今年8月，又会同26家单位成立了“国家驴产业技术创新战略联盟”。目前，位于东北的百万头毛驴养殖项目也已初步启动。

澳大利亚的基因组研究机构■刘晴近日，受到基因组数据集持续高速增长的驱动，澳大利亚基因组研究机构正在它的整个网络中部署一个高性能的博科10GbE核心网络，其中墨尔本节点将率先采用新的博科交换基础架构。澳大利亚非营利组织——基因组研究机构（AGRF）是澳大利亚最大的基因组服务提供者，在布里斯班、悉尼、墨尔本、阿德莱德和珀斯都设有实验室，每个实验室为全国性的先进设备、技术和专业知识网络提供一个网关。AGRF利用尖端技术，为学术、应用研究和商业市场提供合约制的基因

中国微生物基因组研究作者：喻子牛，邵宗泽，孙明ISBN：9787030357236定价：190开本：16装帧：平装页码：692初版时间：2012-10-1专业分类：微生物学读者对象：《中国微生物基因组研究》内容属微生物学科前沿领域，可供从事医学、农业、工业、环境、生态、动物医学、植物病原微生物研究的研究人员、教师和研究生参考。内容介绍《中国微生物基因组研究》由我国从事微生物基因组研究的专家们结合自己的研究领域撰写的综述论文组成，反映了我国微生物基因组研究的

科学院北京基因组研究所孙英丽研究员。孙英丽，中国科学院北京基因组研究所“百人计划”研究员、博士生导师，研究方向包括癌症表观基因组和癌症基因组的研究、肿瘤细胞中表观遗传调控和DNA通路损伤修复通路的关系研究、针对肿瘤细胞特异表观遗传调控的药物设计和筛选、针对肿瘤细胞DNA通路的药物设计和筛选。2000年获得北京大学生命科学学院博士学位之后，她先后在麻省理工学院和哈佛大学医学院从事博士后研究和讲师工作，进行肿瘤与细胞凋亡、DNA损伤修复的研究。2010年回国后

成的“番茄基因组研究国际协作组”，经过8年多的艰苦努力，完成了对栽培番茄全基因组的精细序列分析。该成果于2012年5月31日以封面文章发表在国际权威学术期刊《自然（Nature）》上。茄科植物包含了世界上最多最重要的蔬菜作物，在世界农业中的地位仅次于禾本科和豆科，选择代表蔬菜和水果果实发育和成熟过程的模式植物并对其基因组进行精细序列分析是我国乃至世界农业的迫切需求。而番茄作为茄科植物的代表，是研究果实发育和成熟过程的经典模式植物。此次科学家通过国际合作获得

00个番茄基因组研究计划”，这是中荷科学家在基因组学领域携手合作的又一重要研究项目，该项目将由来自中国和荷兰的多家科研机构或企业共同完成。该研究项目计划用1年的时间完成100个番茄基因组的测序和组装工作，并基于测序所获得的大量的数据进行信息分析和深度挖掘，解析番茄基因组序列，为培育高产、优质、抗病虫害等优良性状的新品种奠定坚实的基础。据了解，该项目预计花费100万欧元并于2011年5月中旬正式启动。签约仪式上，双方还就100个番茄基因组学研究与市场转化、植

度国家植物基因组研究所培育出一种转基因土豆，其蛋白质和氨基酸含量均明显高于普通土豆。苋菜是一种种子很小的阔叶植物，AMA1（Amaranth Albumin 1）可以使苋菜及其种子富含蛋白质以及几种基本氨基酸。研究人员将AMA1基因植入几种土豆的基因组中，终于在两年后培育出一种富含蛋白质的转基因土豆。由于苋菜属于可食用植物，该种转基因土豆可能相对容易被人体接受，其蛋白质含量比普通土豆高35%～60%，赖氨酸、酪氨酸以及硫的含量也有显著提高。研究人员用转基因

中科院北京基因组研究所与浪潮宣布,为加速我国基因科学研究的进程,他们将共同研制国产第三代基因测序仪,预计3年内问世。这一重大装备的成功研制,不仅将填补我国在基因测序基础装备领域的空白,同时也将使国内生命科学研究机构能够获得低成本、高效率的测序工具,加速我国基因战略的发展。据介绍,第三代基因测序仪,将由中科院北京基因组研究所与浪潮“高效能服务器和存储技术国家重点实验室”成立的“中科院北京基因组所-浪潮基因组科学联合实验室”联合各领域科研力量承担研发工作。当前

献的第三大基因组研究成果。这也是迄今为止我国科学家利用霰弹法测序完成的最大的生物种基因组，共注释获得了16948个完整基因，7285个基因片断。根据生物信息学的分析推断，家蚕约有两万个基因，其中约6000个基因为新发现。家蚕全基因组有4亿5千万个碱基对，约为人类全基因组的七分之一，略大于水稻基因组，但科研人员仅用了5个多月的时间就完成了从cDNA文库构建到测序和组装“框架图”的所有工作，创下了基因组研究的最快纪录，并且优化了基因组测序技术，大幅度降低了研究