科学数据出版在我国的实践研究

2024-04-20 10:08刘娴
出版与印刷 2024年1期

摘要:通过对《图书馆杂志》科学数据出版实践进行分析,为我国科学数据出版发展提供参考和借鉴。文章梳理科学数据出版的发展历程,归纳科学数据出版的三种主要模式:独立数据出版、论文辅助资料数据出版、数据论文出版。文章深入分析《图书馆杂志》科学数据出版模式、科学数据出版流程和数据出版管理平台的服务功能,对《图书馆杂志》科学数据出版业务的未来进行展望,认为《图书馆杂志》数据出版尚处于探索阶段,还需对标国际知名出版机构的科学数据出版经验,完善科学数据出版的各个环节,以期更好地服务科研群体,助力我国学术期刊科学数据出版高质量发展。

关键词:科学数据出版;数据出版模式;数据出版流程;数据管理平台;期刊融合发展

DOI:10.19619/j.issn.1007-1938.2024.00.003

作者单位:上海图书馆《图书馆杂志》编辑部

科学数据是指通过基础研究、应用研究、试验开发等产生的数据,以及通过观测监测、考察调查、检验检测等方式取得并用于科学研究活动的原始数据及其衍生数据。科学数据是科学研究的重要组成部分,是知识发现与科技创新的基础。同时,科学数据也是重要的科研产出,具有可重复使用的特性。

科学数据出版,又称数据出版,是提高科学数据质量、规范科学数据使用、提高研究过程透明度、推动科学数据长期保存的有效方式之一。在相关政策文件的引导与规范下,我国科学数据出版发展迅速,相关理论及实践研究不断得到丰富。学者张小强等[1]在梳理国内外科学数据出版理论研究热点和焦点的基础上,厘清了科学数据出版涉及的关键问题与出版理论研究的发展动向。黄国彬等[2]34-40对科学数据出版的模式进行了分类思考和对比分析。秦顺等[3]调研分析了欧美地区科学数据开放存取出版平台的建设经验。秦长江等[4]对国内外的数据出版政策进行了研究。习妍等[5]196-223对国内外数据出版实践与进展进行了总体研究。涂志芳等[6]对数据出版的质量控制进行了研究。孔丽华等[7]237-243分析了数据出版的趋势、机制与挑战。许洁等[8]分析了数据出版的现实问题并提出对策。程娅[9]对数据出版的版权困境与应对策略进行了分析和解答。刘凤红等[10]对施普林格·自然(SpringerNature)、泰勒-弗朗西斯(Taylor & Francis )、威立(Wiley)以及爱思唯尔(Elsevier)等国际出版集团的数据出版政策进行了调研。伏安娜等[11]对数据论文的国内外发展、出版流程、与期刊论文的关联、元数据标准等进行了研究。具体到各专业领域的科学数据出版,刘颖等[12]对医学领域国际学术期刊的数据出版政策进行了分析;汪汇源等[13]研究了国内外英文农业科技期刊的数据出版政策;还有一些学者分别分析了地球科学领域[14]、生命科学领域[15]、空间科学领域[16]、图书情报学领域[17]1081-1086的数据出版实践。

通过梳理相关文献发现,科学数据出版的研究内涵在不断丰富,显示出科学数据出版发展的广阔前景。当前,科研活动跨学科、跨机构、跨系统趋势日益明显,科学研究对数据资源的依赖与日俱增,科研人员对科学数据共享和重用的需求也日趋强烈。科学数据出版作为一种新的科学数据共享模式,在降低科研资源的重复投入、提高科研效益、促进科学研究发现与知识创新方面发挥着重要作用。但已有研究中关于科学数据出版的理论与政策研究较多,具体实践应用研究较少。基于此,本文以《图书馆杂志》为案例,对其数据出版实践进行重点分析,以期为我国的科学数据出版提供参考和借鉴。

一、科学数据出版发展历程概述

21世纪以来,科学数据出版受到各国政府和科研教育机构的高度重视,各类数据仓储和数据共享平台不断涌现,这些平台可直接发布科学数据或者存储传统期刊论文的支撑数据。此外,新型数据期刊也陆续创刊。

当前,国际上主要的科研机构和学术期刊基本都已制定了与科学数据开放、共享和利用相关的政策。美国生态学会(Ecological Society of America,英文缩写 ESA)创办的期刊自2000年起要求作者将与论文相关的数据发布到由该学会创建的数据仓储库中。欧盟提出在欧洲的公共资助研究中,要确保科学出版物的开放获取,并促进科学数据的开放获取。[18]欧洲核子研究中心明确规定,研究数据集及其支持文档需尽快提交到指定的数据存储库中,并根据项目要求提供开放共享。科学数据论文的出版则从2009年起受到期刊界的广泛关注,2012年开始进入科学数据期刊的集中创刊期,2014年国际学术期刊《自然》(Nature)创立科学数据期刊《科学数据》(Scientific Data)要求投稿作者必须向期刊证明与论文相关的科学数据已存储到可公开访问的相关数据库中,[19]并且要求自科学数据出版当日起提供免费获取。

在我国,2015年国务院发布的《促进大数据发展行动纲要》明确提出:积极推动由国家公共财政支持的公益性科研活动获取和产生的科学数据逐步开放共享,构建科学大数据国家重大基础设施,实现对国家重要科技数据的权威汇集、长期保存、集成管理和全面共享。[20]在学术期刊界,先后有《中国科学数据》《全球变化数据学报》等科学数据期刊陆续创刊。《中国科学数据》要求作者优先将数据存储在科学数据银行,《全球变化数据学报》要求作者将数据提交到其自建存储库“全球变化科学研究数据出版系统”中。[5]207传统学术期刊也开始注重对科学数据的管理,如《图书馆杂志》建立数据出版管理平台( www.libraryjournal.com.cn ),将数据出版作为期刊的重要发展方向之一;《中華外科杂志》明确论文一经录用,支撑研究结论的数据都要提交到相关数据存储平台,按照平台规则进行共享。2017年,《信息技术科学数据引用》国家标准(GB/T 35294 —2017)正式发布,规定了科学数据引用元素描述方法、引用元素详细说明、引用格式等方面的内容。[21]2018年,国务院办公厅出台《科学数据管理办法》,提出“主管部门和法人单位应积极推动科学数据出版和传播工作”,体现了国家对科学数据出版和传播的重视。2019年,《中国科学院科学数据管理与开放共享办法(试行)》发布,明确要求科研人员应及时向指定的科学数据管理机构汇交数据。同年8月,中国科协等四部门联合印发《关于深化改革培育世界一流科技期刊的意见》,提出探索增强数字出版、数据出版等新型出版模式。[22]2020年,中共中央、国务院发布《关于构建更加完善的要素市场化配置体制机制的意见》,将数据与土地、劳动力、资本、技术并举,将科学数据的共享利用提升到了新的高度。2023年,《数据论文出版元数据》国家标准(GB/T 42813—2023)发布,对规范科学数据出版、推动科学数据开放共享生态建设具有重要意义。

二、科学数据出版主要模式

科学数据出版模式,也称为科学数据出版类型,现有研究对科学数据出版的模式划分主要包括以下几种:劳伦斯(Lawrence)等[23]提出的独立数据出版、学术论文辅助数据出版、附录数据出版、期刊数据档案出版、数据论文出版五种模式;张静蓓等[24]归纳的数据独立出版、数据论文出版、合作出版、期刊自行出版四种模式;何琳等[25]总结的数据仓储出版、机构库出版和期刊自行发表三种主要模式;黄国彬等[2]35-37根据科学数据产生的情形,将科学数据出版归纳为科学数据集成出版与独立出版两种模式。

基于以上几种分类,本研究认为科学数据出版模式总体上可归为以下三种。

1.独立数据出版

独立数据出版是指科研人员自主或者按照项目资助方要求,将数据单独提交到开放存取数据知识库进行发布,并为数据集分配唯一标识符,以便检索和使用[7]238,是一种独立于出版物的数据出版模式。

2.论文辅助资料数据出版

论文辅助资料数据出版是一种附属于出版物的数据出版模式,它要求将数据作为论文的附件、附录而出版或存储到期刊指定的数据仓库,并建立论文和数据之间的关联。

3.数据论文出版

数据论文指经过同行评议的专门对具有科学价值的数据集进行描述的论文,一般采用结构化的模式,说明数据集的目的、产生与处理的过程,数据内容以及使用方式等。[7]241数据论文出版模式将科学数据作为一种文本文献进行出版,包括发表在数据期刊的数据论文和综合性期刊的数据论文。[26]

独立数据出版有利于数据的保存、获取、共享及检测统计。在论文辅助资料数据出版中,数据与论文密切相关,论文对数据有一定的说明,便于用户理解和利用。数据论文则是以论文的形式对数据进行详细的阐述,并经过同行专家评议,数据论文描述的数据以论文的形式公开发表,更有利于对数据的可靠性、可用性、可追溯性进行验证,从而为数据的引用和重用提供更大的可能性和便利性。[5]196

三、《图书馆杂志》科学数据出版实践

《图书馆杂志》是我国图书馆学情报学专业优秀学术期刊,是《中文核心期刊要目总览》(简称北核)收录期刊、《中文社会科学引文索引》(简称 CSSCI)来源期刊、《中国人文社会科学期刊 AMI 综合评价报告》(简称 AMI)核心期刊。随着科学数据价值的凸显,科学数据已经被图书馆学情报学专业领域的研究者认为是一种新的信息资源。在此背景下,《图书馆杂志》于2016年开始了数据出版实践探索,由主管单位上海图书馆(上海科学技术情报研究所)自主研发建立了数据出版管理平台。

1.《图书馆杂志》科学数据出版模式

《图书馆杂志》数据出版与单纯的数据仓储不同,具备同行评审、编辑加工、公开发布、查询引用等多项功能,是我国学术期刊数据出版的典型代表。《图书馆杂志》对不同的数据类型采取不同的数据出版模式,能够较好地满足研究者的不同数据出版需求。

(1)富媒体数据出版

科研人员运用计算机技术开展的合作性、跨学科研究对学术出版影响深刻。具体表现为学术成果不再仅仅是文字表述,相关的图表、音频、视频越来越多。由于印刷技术和印刷成本的关系,在传统出版模式中很难将所有图表数据一一呈现,至于音频、视频更是传统学术出版的难点。《图书馆杂志》数据出版管理平台的建立,很好地解决了这些难题,将必要的图片、表格随论文在纸刊出版,拓展阅读的图片、表格、音频、视频则在数据出版管理平台增强出版。

富媒体数据出版的优点是文章可直接链接音频、视频等富媒体数据资源,增强了论文的可读性;缺点是富媒体数据属于论文附加增强内容,不会被其他论文引用。

(2)支撑论文研究结论的数据出版

由于论文中呈现的多为结论性数据,原始数据以及推演过程中产生的数据无法呈现。为了将这些数据保留下来增加论文结论的科学性与合理性,《图书馆杂志》数据出版管理平台提供了永久存储空间,供数据的存储和下载验证。作者在投稿时,系统平台提醒作者将数据上传到数据出版管理平台,供同行专家随论文一起评审,待论文在纸刊出版后,支撑论文研究结论的数据同时在数据出版管理平台出版。

支撑论文研究结论的数据出版的优点是数据能够与论文一起接受评审,整体质量较高;缺点是与结论相关的数据集复用价值有限。

(3)数据论文出版

数据论文是科研人员通过对数据的描述以帮助读者更好地获取、理解和使用数据。[17]1083数据论文在纸刊出版,数据论文描述的数据集在数据出版管理平台出版,论文与数据之间通过 Handle标识符(数字资源全球唯一标识符)关联。数据论文出版的优点是数据论文格式规范,对数据的描述清晰明确,利于共享复用;缺点是数据的版权问题没有得到有效解决,学界对数据论文学术价值的认可度有待提高。

(4)独立数据出版

由于国內外学术期刊和数据出版平台的国际影响力差距悬殊,科研人员在发表论文时倾向于将论文优先发表到国外权威期刊,其研究数据也偏重在国外平台出版。为有效促进数据共享、避免数据外流,《图书馆杂志》鼓励研究人员将已在国内外期刊发表的研究论文中的研究数据、数据集另行投递上传至其数据出版管理平台,数据经审核通过后可作为研究数据成果单独录用发表,并与原论文出处或地址实现双向互链访问。[27]

独立数据出版的优点是数据规范、质量高,能够避免数据丢失和数据外流;缺点是研究人员上传数据的积极性有待提高。

2.《图书馆杂志》科学数据出版流程

《图书馆杂志》的数据出版与传统论文出版一样,具有规范的出版流程,具体包括以下步骤。

(1)上传数据

在向导式投稿流程中,平台系统提醒作者上传数据,要求作者按照规定对数据进行描述,并将高清晰度的富媒体格式文件和数据集上传到数据出版管理平台,同时将上传后的数据链接地址添加到文末。

(2)评审数据

作者上传数据后,进入数据评审环节,主要包括:对数据的评审,审查并核验数据的完整性、真实性;对数据论文的评审,审查数据论文结构是否规范,数据论文的基本信息、数据集信息、辅助信息是否齐全;对数据与数据论文相关性的评审,审查数据论文与数据集的相关性、一致性。

(3)发布数据

对于通过编辑部审核、同行专家评审,符合刊发要求的数据与数据论文进行公开发布。数据发布在《图书馆杂志》数据出版管理平台,数据论文刊发在《图书馆杂志》纸刊。

(4)引用数据

《图书馆杂志》要求作者在数据论文中提供关于数据可用性的声明以规范对数据的使用,并列出数据引用格式与数据论文引用格式。声明内容如下:“本数据集可以通过在网站注册登录获取,可以用于科学研究和教学目的,需标注引用信息,禁止二次分发和商业演绎。”

3.《图书馆杂志》数据出版管理平台的服务功能

《图书馆杂志》数据出版管理平台除了具有规范的数据出版功能外,还支持多项数据服务功能,具体如下。

(1)数据长久保存

支持用户通过注册登录,按照要求自助完成数据存储。平台采取多种方式确保数据长期、安全保存:遵循公认标准、采用通用数据格式保存数据并进行备份;实时监控数据安全,及时发现潜在问题并采取应对措施;注重对软硬件系统的维护,定期对平台系统进行检查,以确定软硬件是否需要更新。

(2)数据分级管理

平台严格遵守相关法律和行业标准,制定安全可靠的数据分级管理政策,按照层次划分层级,并设定不同的数据访问角色和权限,使用户减少因数据共享而可能产生的顾虑,如知识产权损害、数据隐私泄露等。

(3)数据权限管理

平台对数据集、课题、数据文件定义的访问控制权限可分为:创建权限、读取权限、更新权限、删除权限、定义数据采集、导出采集结果等。不同的角色具有不同的操作权限,如管理员具有所有权限,用户具有创建和编辑自己课题的权限,编辑拥有发布课题的权限。

(4)数据版本管理

平台自动记录数据的更新,并对历史版本进行保存,记录内容包括修改的时间和具体修改内容等,同时还能提供对各个版本的差异比较,便于需要使用数据的研究人员进行查证。

(5)数据浏览与导航

用户可浏览平台中的所有公共数据资源。平台为用户提供数据集导航,包括自定义的分类导航和依据 A—Z 字母顺序导航两种,并允许用户创建不同形式的课题集导航,如静态导航、动态导航、链接导航。

(6)数据检索

用户无需注册即可检索平台中所有已发布的数据资源,也可以在单个数据集中检索数据资源。已发布数据集中的受限制数据也会出现在检索结果中,并以带“锁”的图标标注出来以作区分;未发布的数据集中的数据资源则不在检索范围内。

(7)数据分析

平台提供一种基于 R 语言的计算统计工具,并提供广泛的统计分析模型,支持用户在浏览数据资源时利用可视化的功能选择变量,生成图表,并将图表与选择的数据文件一起打包下载。平台还支持多种在线分析工具的集成,支持对数据进行多层次、多角度的可视化分析。

(8)数据精选

平台能够基于数据下载热度、数据搜索热度、自定义精选数据等,将优质数据通过图片滚动等方式进行展示,通过点击图片即可直接浏览。

(9)数据素养培训

平台提供数据论文模板供作者参考;制作数据出版相关知识介绍的小视频,供用户观看学习;制作数据出版管理微课堂系列课程,供用户学习实践。

四、《图书馆杂志》科学数据出版业务的未来展望

《图书馆杂志》科学数据出版业务经过几年的探索实践,取得了良好成效,在数据出版方面技术领先、类型多样、出版流程规范、服务功能齐全,逐步与国际数据出版接轨。当前,《图书馆杂志》科学数据出版业务在我国图书情报界和期刊出版界已具备一定影响力,《图书馆杂志》数据出版管理平台项目获得上海市新闻出版局专项资金资助以及上海科学技术情报成果和华东科学技术情报成果多种奖项,但对标国际知名出版机构的数据出版经验,还需完善数据出版的各个环节,创新数据出版机制和服务功能,从而更好地服务科研群体。

(1)突破专业限制,服务更多用户

《图书馆杂志》科学数据出版在推动图书馆学情报学专业学术期刊论文数据出版的科学化、规范化方面的积极探索,促进了图书馆学情报学研究领域的理论创新与实践发展。但是目前平台存储与出版的数据多为《图书馆杂志》投稿作者的论文研究数据,其他学术期刊和科研机构的数据较少,数据出版平台的价值没有得到充分体现。

(2)规范评审标准,提高数据质量

数据评审是数据质量控制的重要环节,虽然《图书馆杂志》数据出版管理平台目前已经形成了较为完备的数据评审机制,但在细节方面仍需加强,包括需要制定详细的数据评审指南,以进一步规范数据论文的审稿流程,确保数据集的可靠性与数据论文的规范性等。

(3)加强国际合作,提升平台影响力

《图书馆杂志》数据出版管理平台目前已初具规模,在国内具有一定的影响力,今后应争取在国际知名数据知识库系统(如FAIRsharing、re3data)上进行注册,通过CoreTrustSeal国际认证,服务全球科研用户和国际合作项目,实现平台在国际上的影响力,进而吸引更多科研人员上传数据,提高科学数据出版传播的国际影响力。

(4)多渠道筹措资金,实现可持续发展

《图书馆杂志》数据出版管理平台在上海市新闻出版局和上海图书馆的大力支持下,迎来了强劲的发展动能和广阔的发展空间。但是目前平台的资金来源较为单一。今后一方面可以考虑专门针对外部机构提供付费服务,维持持续运营;另一方面争取在现有基金项目结束后能够获得社会组织或专业学會的资金支持,实现平台的可持续发展。

(5)籌建数据出版团队,明确数据编辑职责

数据出版管理平台中涉及的数据量庞大、结构复杂,数据及数据论文审核对专业知识和实践经验要求高,因此对评审人员是一个巨大的挑战。数据出版管理团队成员除了熟知行业发展的评审专家外,还应包括国内外知名数据管理和数据技术专家。《图书馆杂志》数据出版管理平台应尽快筹建一支人员构成合理的科学数据出版团队,同时还需明确数据编辑的职责。

(6)协同培训,提高科研人员数据素养

国内数据出版管理平台较少关注数据管理计划(data management plan,英文缩写 DMP)服务,即提供针对科研人员的数据管理计划培训,内容包括元数据著录规范、数据生命周期管理、数据监护、数据收集方法和工具等。《图书馆杂志》数据出版管理平台可考虑与其他数据期刊一起开展协同培训,加强与科研群体的沟通,提高科研群体的数据共享意识与数据素养。

五、结语

科学数据出版是促进科学数据开放共享的重要手段,可以规范科学数据共享标准、推动科学数据长期保存、提高科学数据共享质量、实现科学数据的再利用,是开放科学运动的重要组成部分。科学数据出版是一项长期艰巨的任务,需要对科学数据出版中的各个环节和存在的问题进行深入、细致、全面的研究和探讨。当前我国的科学数据出版实践还处于探索阶段,理论研究滞后于科研活动的发展;我国的科学数据出版实践,如仓储库建设和科学数据期刊出版,与欧美国家存在较大的差距,今后需要对标国际知名出版机构的科学数据出版经验,不断完善提高,从而推动我国科学数据出版的高质量、可持续发展。

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Practical Research of Scientific Data Publishing in China: Taking Library Journal as An Example

LIU Xian

Abstract: By analyzing the practice of scientific data publishing in Library Journal, this paper provides reference for the development of scientific data publishing in China. This paper reviews the development process of scientific data publishing, and summarizes three main models of scientific data publishing: independent data publishing, paper auxiliary data publishing and data paper publishing. This paper deeply analyzes the scientific data publishing mode, the scientific data publishing process and the service functions of the data publishing management platform of Library Journal, and looks forward to the future development of the scientific data publishing business of Library Journal. It is believed that the data publishing of Library Journal is still in the exploratory stage, and it is necessary to benchmark the scientific data publishing experience of internationally renowned publishing institutions and improve all aspects of scientific data publishing so as to better serve the scientific research community and help the high-quality development of scientific data publishing of academic journals in China.

Keywords: scientific data publishing; data publishing mode; data publishing process; data management platform; journal integration development

Author Affiliation: Editorial Department of Library Journal, Shanghai Library

引文格式:劉娴.科学数据出版在我国的实践研究——以《图书馆杂志》为例[J].出版与印刷,2024(1):53-60.