汤嘉慧 王新东 董其美
1.南京中医药大学第三临床医学院心血管内科,江苏 南京 210028;2.南京中医药大学附属中西医结合医院心血管内科,江苏 南京 210028
流行病学表明射血分数保留型心力衰竭(heart failure with preserved ejection fraction,HFpEF)已成为全球心力衰竭(heart failure,HF)的主流[1],它是指左室射血分数≥50%,以左室等容舒张延长、左室舒张末压增加和左室充盈缓慢为特征的HF[2]。目前尚无确切治疗显示可以降低HFpEF 患者发病率或病死率,因此降低HFpEF 患者的发病率或病死率成为现代医学研究的热点。
中医古籍中并未记载“射血分数保留型心力衰竭”这一病名,参考其临床表现可归类于中医“心力衰竭病”的范畴。HF 是以气喘、心悸、水肿等为主症的一种病证,是许多心系疾病的最终归宿[3]。中医药因其显著优势获得社会认可,被广泛应用于治疗HF。
平阳益心饮由白茅根、丹参、枸杞子、红景天、焦栀子、鹿衔草、路路通、桑叶、丝瓜络9 味中药组成,是南京中医药大学附属江苏省中西医结合医院治疗HFpEF 的经验方,已在临床应用多年,但其具体分子机制尚未明确。本研究基于网络药理学挖掘平阳益心饮治疗HFpEF 的药效靶点和信号通路,系统阐述平阳益心饮治疗HFpEF 的科学内涵。
通过HERB 数据库(http://herb.ac.cn/)获得平阳益心饮化学成分和化合物结构,将化合物结构导入Swiss ADME平台(http:/www.swissadme.ch/)。设置纳入标准:①肠胃吸收(gatrointestinal absortion;GIabsortion)为“ High”;②5 类药性(Egan、Lipinski、Ghose、Muegge、Veber)中≥2 个为“ Yes”,将鉴定出的化学成分分子结构图上传至SwissTarget Prediction 数据库(http:/www.swisstargetprediction.ch/),按Probability>0 筛选靶点,获取相关的潜在靶点。
在PhamGKB(https://www.pharmgkb.org/)、OMIM(https://omim.org/)、GeneCards(https://www.genecards.org/)数据库中检索“ HFpEF”的相关靶点,去除重复值,得到HFpEF 的疾病靶点。
运用Venny 2.1.0(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)取药物和疾病的交集靶点并绘制韦恩图。
以平阳益心饮内含有的药物名称、有效成分及疾病靶点为节点,构建“成分-疾病靶点”网络。
在STRING 数据库(https://string-db.org/)输入平阳益心饮和HFpEF 的交集靶点,构建PPI 拓扑网络。运用CytoHubba 插件筛查核心靶点,筛查条件包括Degree 值、Closeness 值、Network 值、Betweenness 值、Eigenvector 值和LAC 值。
在Metascape 平台导入交集靶点,分别进行京都基因组百科全书通路富集分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)和基因本体功能富集分析(gene ontology,GO)分析,应用微生信平台(http://www.Bioinformatics.com.cn)绘制通路富集分析图和生物功能分析图。
运用HERB 数据库预测平阳益心饮相关的活性成分的作用靶点,去重后得到566 个活性成分和1309 个靶点。
从OMIM、PhamGKB 及GeneCards 数据库获取HFpEF 靶点,去重后获得3199 个HFpEF 靶点。
将上述获取的成分靶点与疾病靶点导入Venny 2.1.0中,共得到交集靶点524 个,韦恩图见图1。
图1 平阳益心饮药物-HFpEF 疾病靶点交集韦恩图
使用Cytoscape 3.9.0 软件将524 个候选治疗靶点进行“成分-疾病靶点”网络可视化(图2)。
图2 成分-疾病靶点网络图
利用STRING 对2.3 项中得到的524 个候选治疗靶点构建PPI 网络,筛选后得到524 个节点和10 371 条边的互作网络(图3)。
图3 候选治疗靶点的PPI 图
对交集靶点做核心靶点筛查:将524 个蛋白输入Cytoscape 3.9.0 软件中,利用CytoHubba 插件进行筛选。首先以Betweenness>21.28、Closeness>0.03、Degree>6.56、Eigenvector>833.26、LAC>0.04、Network>9.36,进行第一次筛选,由524 个蛋白筛选至54个,接下来再以Betweenness>75.85、Closeness>0.11、Degree>18.54、Eigenvector>3543.57、LAC>0.18、Network>34.89 进行第2 次筛选,由54 个蛋白筛选得到12 个,推测这12 个蛋白为平阳益心饮治疗HFpEF 的核心治疗靶点,依次为STAT3、SRC、AKT1、MAPK1、MAPK3、HRAS、GRB2、RELA、JUN、FYN、ESR1、EGFR。
借助Metascapes 平台进行GO 分析及KEGG通路分析。GO 分析中筛选出生物过程(biological processes,BP)、分子功能(molecular functions,MF)和细胞成分(cellular components,CC)的前10 位进行制图(图4)。结果提示,平阳益心饮可能参与细胞对氮化合物的反应、系统进程调节、循环系统过程、磷酸化的正调控等过程;在膜筏、突触后、细胞体、受体复合物等细胞组分中起作用;激活了蛋白激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、激酶结合、神经递质受体活性等分子功能。KEGG 共富集到235 条通路,前20 条通路用气泡图展示(图5),包括癌症相关通路、cGMP-PKG 信号通路、cAMP 信号通路、脂质与动脉粥样硬化等。
图5 KEGG 通路富集分析气泡图
平阳益心饮具有平肝潜阳、利水消肿的作用,能显著改善HFpEF 的症状。通过PPI 网络分析,验证了AKT1、SRC、STAT3 等靶点是平阳益心饮治疗HFpEF 的核心靶点。AKT1 的激活证实其可以促进心肌细胞的生长和增殖,从而强化心脏修复[4-5]。AKT1 蛋白的缺失可能导致早期收缩功能障碍,进而形成HF[6]。SRC 是一种在细胞黏附、细胞更迭和细胞迁移等过程中发挥作用的非受体酪氨酸激酶,研究表明,SRC 激酶在纠正心脏肥大及重塑中发挥至关重要的作用[7]。SRC 磷酸化能改善细胞间通讯,降低心律失常诱导性,改善HF 症状[8]。STAT3 是一种转导蛋白和活性因子,研究发现STAT3 及其相关的信号通路在心血管系统中也起着关键的调节作用[9-10]。研究表明,STAT3 的激活可以减少心肌细胞凋亡,促进心肌分化,从而改善心肌重塑和纤维化[11]。
平阳益心饮治疗HFpEF 主要参与调控癌症相关通路、cGMP-PKG 信号通路、cAMP 信号通路、脂质与动脉粥样硬化信号通路等,主要涉及细胞对氮化合物的反应、磷酸化的正调控和循环系统等生物过程,膜筏、突触后和细胞体是参与反应的重要细胞组分,分子功能主要包括蛋白激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性和激酶结合等。
循证医学证实,癌症与HF 具有共同的危险因素和信号通路,并且相互促进发展[12]。动脉粥样硬化是心血管疾病的危险因素之一,能参与血管内皮损伤、心脏结构或功能改变等病理过程。因此,抗动脉粥样硬化治疗有助于修复血管内皮损伤和对抗心肌重构,在HF 的发展过程中发挥着重要作用[13]。cAMP 的增加可以维持心肌钙稳态及心肌收缩舒张功能,减少心肌细胞凋亡[14]。cGMP-PKG 信号通路通过调控炎症、氧化应激和钙离子浓度来减少血管硬化,从而影响心室重构,改善HF[15]。
综上所述,平阳益心饮治疗HFpEF 可能是作用于AKT1、SRC、STAT3 等靶点来调节癌症相关通路、cGMP-PKG 信号通路、cAMP 信号通路和脂质与动脉粥样硬化等信号通路,主要涉及细胞凋亡、细胞增殖等机制,主要集中于膜筏、突触后、细胞体等区域。这为进一步深入探讨其作用机制提供了参考依据,目前仍需进一步实验证实。