云南环境微生物资源数据化及其应用

云南省微生物研究所

云南省微生物研究所在云南省生物医药重大专项“生物资源数字化开发应用” 202002AA100007项目经费的支持下，在多组学水平上，进行了系统的微生物资源数据的整理，截至目前，建立了云南大学云南省微生物所菌种保藏中心网站(yimcc.cn)，已完成17 000多株微生物菌株的可共享数据在云南省生物资源数据化大数据中心上链。联合云南省农科院，云南省微生物发酵工程研究中心有限公司，共同构建了拮抗云南高原特色农作物主要病原菌的活性筛选平台及相关本土微生物资源功能性菌剂/菌肥产学研平台，已完成3000多株菌的活性筛选，开展了7个功能性菌剂的田间试验示范；参与云南宏斌食品有限公司申报并于2021年获批的云南省发酵蔬菜重点实验室，开展了云南发酵食品乳酸菌资源的收集，并从中筛选出2株乳酸菌，开展了以核桃蛋白为原料的乳酸菌饮料、纯植物基风味发酵乳、气泡乳酸菌饮料产品研发，通过昆明雪兰牛奶有限责任公司的测试，具有转化商品的价值，为云南核桃产业的健康发展，提供了一个解决思路。

同时，系统开展了从放线菌新物种资源收集到新药研发的系统研究。联合云南大学化工学院/医学院、昆华医院，构建了拮抗临床超级耐药菌的活性筛选平台，以完成2500株菌的活性筛选，部分高活性菌株已开展代谢产物研究。通过数据整理发现，1358个放线菌记录种，占全球已生效发表物种的34.60%，而在产生抗生素最多的链霉菌、拟无枝菌酸菌、小单孢菌三类放线菌种，共发现519、55、46个记录种，分别占全球已生效发表物种的74.2%、63.95%、41.4%。同时在基因组学水平，开展了云南环境放线菌菌株的分类鉴定，发现大量的放线菌潜在新物种资源。新物种资源具有新功能基因，是获得原创药物分子的重要保障。这些宝贵的放线菌资源发现及应用开发，必将加速原创药物分子的发现。

图1 丰富的云南放线菌物种多样性

图2 巨大潜力的云南链霉菌物种资源

图3 巨大潜力的云南拟无枝菌酸菌物种资源

图4 发现新物种