双重实时荧光定量PCR法检测腹泻中病毒的价值

2021-04-03 16:20樊永慧
中国卫生标准管理 2021年8期
关键词:定量粪便试剂盒

樊永慧

近年来研究表明[1],引起人类非细菌性胃肠炎的重要病原是诺如病毒,其引起严重的食品安全、公共卫生问题,据不完全统计[2],≥95%急性病毒性胃肠炎暴发,是由诺如病毒导致的,传染性较高,传播方式有:粪便-口途径传播、人-人之间直接传播,严重影响世界公共卫生。经调查研究显示[3],腹泻是临床常见的消化内科疾病,是指:与平日习惯频率比较,排便次数增加、粪质稀薄及水分增加等,排便量≥200 g/d,或者含有未消化食物、黏液及脓血等,患病后常有排便急迫感、肛门不适及失禁等症状表现,发病机制较复杂,可能与病毒、细菌及寄生虫引起肠道感染等因素有关,其中引起感染的主要病毒是GⅠ型、GⅡ型诺如病毒,因此探寻经济、有效及可行的检测方法,逐渐成为医学界研究热点。张濛等[4-5]认为,采用双重实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR,polymerase chain reaction)法能控制疾病进展、改善患者预后,具有操作简便、快速及特异性强等优势,临床应用较广泛,得到患者的青睐、认可,基于上述背景,本研究分析腹泻患者粪便中诺如病毒(GⅠ+GⅡ)行双重实时荧光定量PCR法检测的价值,报道如下。

1 资料和方法

1.1 基线资料

研究2019年1月—2020年3月我市人民医院送检的腹泻患者的粪便标本共400份,其中男性有210例,女性有190例,年龄41~68岁,均值(52.39±6.42)岁;体质量19~26 kg/m2,均值是(23.29±5.47)kg/m2。(1)采集粪便的标准:腹泻病程≥2周;排便次数≥3次/日,粪便呈稀便、水样便、脓血便及黏液便等;患者表现为不同程度排便次数增加、腹痛等不适症状[6];体征平稳、意识清晰;患者知情并签署“知情同意书”;医院伦理委员会审核同意。(2)排除标准:心肝肾功能障碍者;细菌性感染后的腹泻粪便标本;伴恶性肿瘤者;认知、精神障碍者;临床资料不完整者。

1.2 方法

1.2.1 粪便采集 采集患者粪便标本5~10 g,未加入任何培养基、试剂,等待30 min后冻存于零下20℃的冰箱,尽量≤1个月内完成检测。采用0℃冰壶运送标本,阳性粪便标本:经江苏省句容市疾病预防控制中心复核后,确认为诺如病毒GⅠ和GⅡ阳性的粪便样本,采用PBS稀释为10%病毒悬浊液,冷存于零下80℃等待检测[7]。

1.2.2 仪器及试剂 涉及仪器有:高速台式冷冻离心机(德国Sigma,2~16K)、荧光定量AB7500 PCR仪(美国ThermoFisher分析仪器股份公司)、病毒核酸提取试剂盒及PCR检测试剂盒。

1.2.3 提取RNA病毒 利用病毒核酸提取试剂盒+快速柱式提取法,提取粪便标本的病毒核酸,严格按照试剂盒说明书操作。

1.2.4 双重实时荧光定量PCR法 涉及试剂有:诺如病毒(GⅠ+GⅡ))双重实时荧光定量PCR检测试剂盒(上海之江公司),PCR反应按照试剂盒说明书操作,总体积是20 μl,划分为 18 μl荧光反应液、1 μl酶混合物和 1 μl内部对照,将样品RNA处理后,荧光反应利用荧光定量PCR仪进行。(1)条件:温度45℃、持续10 min、反转录,进行1个循环;(2)预变性:温度为94℃、持续2 min、进行1个循环;(3)PCR扩增:温度为94℃、持续15 s、进行40个循环,60℃延伸时,对荧光信号进行收集;(4)报告基团:具体设置成FAM、VIC,其中GⅠ型诺如病毒采用FAM基团监测,GⅡ型诺如病毒采用VIC基团监测[8-9]。

1.3 观察指标

(1)试验有效性:①试验有效:阴性对照的FAM、VIC通道均为阴性;②阳性对照的FAM、VIC通道均呈扩增。

(2)FAM通道:Ct值<38,GⅠ型诺如病毒核酸呈阳性,Ct值若显示为无,则表示样本呈阴性,说明GⅠ型诺如病毒核酸呈阴性,Ct值处于38~40时,表示再次进行试验,重复扩增曲线呈扩增,表示GⅠ型诺如病毒呈阳性,反之呈阴性。

(3)VIC通道:Ct值<38,GⅡ型诺如病毒核酸呈阳性,Ct值若显示为无,则表示样本呈阴性,说明GⅡ型诺如病毒核酸呈阴性,Ct值处于38~40时,表示再次进行试验,重复扩增曲线呈扩增,表示GⅡ型诺如病毒呈阳性,反之表示样本呈阴性[10]。

2 结果

本研究选择400份腹泻患者的粪便标本,实行双重实时荧光定量PCR法检测发现,GⅠ型诺如病毒感染有15例,检出率是3.75%;GⅡ型诺如病毒感染有59例,检出率是14.75%;GⅠ型、GⅡ型诺如病毒混合感染有6例,检出率是1.50%,诺如病毒的总检出率是20.00%。

3 讨论

腹泻是临床常见症状,俗称为“拉肚子”,常因细菌性痢疾、败溃疡性结肠炎、血吸虫病、病毒性肠炎及麦角性肠病等疾病引起的,具有起病急、迁延难愈及反复发作等特点,发病时常有排便急迫感、肛门失禁及肛门不适等症状表现,未及时治疗影响患者预后效果、甚至危及生命,因此早期合理的检测方法,受到临床高度重视。近年来研究表明[11-12],诺如病毒是引起腹泻的重要原因,传播途径有:食物、水源及人群接触等,是诱导急性病毒性胃肠炎、食源性疾病暴发的重要原因,具体分析如下:(1)急性病毒性胃肠炎其属于自限性疾病,患病后患者常有恶心呕吐、腹泻等症状表现,一般情况下呈脓血、水样便等,一年四季均可能发病,其中秋冬季较多见,发病率较高,极易被误诊,若患者多次、大量腹泻,引起严重脱水、电解质紊乱,部分群体产生休克、昏迷及心跳停止等,甚至危及生命;(2)食源性疾病常见疾病类型是食物中毒,是指:食用生物性、化学性有害物质污染的视频,出现急性、亚急性食源性疾病,在气温较高的夏秋季发病率就较高,具体划分成:细菌性食物中毒、非细菌性食物中毒,具有发病率高、迁延难愈等特点,患病后患者常表现为恶心呕吐、腹泻及腹痛等胃肠炎症状,未及时治疗引起脱水、酸中毒及休克等,甚至危及生命,因此王强等[13]认为,选择操作简便、特异性较强、重复性良好及时效性强等优势的检测方法迫在眉睫。

有研究报道[14],双重实时荧光定量PCR法检测GⅠ型、GⅡ型诺如病毒具有较高的时效性,其中GⅠ型诺如病毒特异性采用Taqman探针的5’端标记为FAM,GⅡ型诺如病毒特异性采用Taqman探针的5’端标记为VIC,将相关标本放置于同一反应管,同期开展标本检测、分型,确保数小时内获得诺如病毒的病原体型别、缩短检测时间,将错综复杂的检测步骤简化,提高诺如病毒检测效率,具备较高的临床应用价值。

经调查研究显示,检测诺如病毒是疾病监测体系的重要组成部分,回顾分析患者既往饮食调查史,结合病毒病原体检测数据、网络上报体系,实施追溯疾病诱因、传染源,及时发现并控制病毒引起的疾病暴发,有效治疗、预防并控制诺如病毒引起的疾病,改善患者预后效果、稳定病情。

本研究示:选择400份腹泻患者的粪便标本,实行双重实时荧光定量PCR法检测发现,GⅠ型诺如病毒感染有15例,检出率是3.75%;GⅡ型诺如病毒感染有59例,检出率是14.75%;GⅠ型、GⅡ型诺如病毒混合感染有6例,检出率是1.50%,诺如病毒总检出率是20.00%,与陆芸等[15-16]文献结果接近。

综上所述,腹泻患者的粪便采用双重实时荧光定量PCR法检测具有较高的临床应用价值,为后期治疗提供可靠性保障、改善预后效果。

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