研究发现蛋白异常“液液相分离”导致人类发育性疾病新机制

近日，中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员朱继东课题组与研究员刘聪课题组合作，在Cell 上发表了研究论文。该研究发现非受体酪氨酸磷酸酶SHP2 在人类发育性疾病（如努南综合症和豹皮综合症）中的基因突变导致SHP2蛋白的异常“液液相分离”，并将野生型SHP2 蛋白招募至相分离体系中，激活SHP2的磷酸酶活性和下游的MAPK 信号通路。该研究解答了努南综合症和豹皮综合症中不同类别的SHP2 突变导致相似临床表型的分子机制，并为小分子药物治疗与SHP2突变相关的人类疾病提供新的治疗策略。

生物大分子的“液液相分离”（liquid-liquid phase separation，LLPS）是近年来生命科学领域重要的发展方向。越来越多的研究表明，蛋白质相分离广泛存在于细胞中，驱动多种生物学功能。“液液相分离”在生物学上提供一个审视生命运行规律的新视角，阐明若干以往较难解释的生物学现象，并在生理过程中起重要作用，与人类多种疾病的病理过程相关，包括肿瘤、自身免疫性疾病和神经退行性疾病等。阐释相分离在病理过程中的作用将为治疗疾病提供新的治疗策略和手段。

非受体酪氨酸磷酸酶SHP2 在RAS/MAPK 信号通路传导中起关键作用。SHP2 磷酸酶活性受其自身构象变化调节，蛋白处于“关闭”状态时，磷酸酶活性被抑制；蛋白处于“打开”状态时，磷酸酶活性被激活。SHP2 蛋白的突变与多种人类疾病有关，50%的努南综合症（NS）和90%的豹皮综合症（NS-ML）患者携带SHP2 的胚系杂合突变。努南综合症中的SHP2 突变使SHP2 处于“打开”的构象，导致SHP2酶活性被激活，而豹皮综合症中的突变位于SHP2催化结构域上，使SHP2 磷酸酶功能失去活性。然而，努南综合症和豹皮综合症两种发育障碍的患者却有较为相似的临床症状。酶活缺失的SHP2 突变与酶活增强的SHP2 突变导致临床表型相似疾病的原因，是生物学上尚未解决的难题，解决这一问题或将助于开发治疗此类疾病的小分子药物。

研究团队发现在努南综合症和豹皮综合症中存在的SHP2突变，均能促进SHP2 蛋白在体外和细胞中发生异常的“液液相分离”。突变的SHP2 蛋白相分离由磷酸酶催化结构域表面电荷的静电相互作用介导，且SHP2 相分离的能力受蛋白的构象变化调控。同时，SHP2 突变体的相分离对于RAS-MAPK 通路的活化较为重要，SHP2 突变体形成的相分离可招募野生型的SHP2 蛋白，在局部提高酶浓度，促进SHP2磷酸酶功能，从而激活MAPK 信号通路。该研究揭示磷酸酶蛋白能够发生相分离现象，暗示相分离可能是细胞调节磷酸酶活性的重要调控方式；基因突变可改变蛋白的相分离能力，进而改变蛋白功能，导致人类疾病的发生，揭示相分离在人类疾病发生发展中的重要性。此外，研究还发现SHP2变构抑制剂ET070通过将SHP2蛋白锁定在“关闭”构象，抑制SHP2 突变蛋白的相分离能力，为小分子药物调控磷酸酶功能和相关疾病治疗提供新策略