贵州金花茶种质资源ISSR分析及指纹图谱库构建

2020-09-02 12:10罗在柒李荣京珍李兰
乡村科技 2020年22期
关键词:条带金花多态性

罗在柒 陆 俊 李荣京 李 治 珍李兰

(贵州省林业科学研究院,贵州贵阳550005)

贵州金花茶的模式标本于1958年由中国科学院植物研究所的曹子余先生采自贵州省册亨县山区,被鉴定为中越山茶(Camellia indochinensisMerr),1993年昆明植物所的阁天绿等将其定名为贵州金花茶[1],但张宏达等进一步将分布在册亨的论证为离蕊金花茶(Camellia liberofilamentaH.T.Chang et C.H.Yan)[2],分布于贵州省南部罗甸县大亭乡的金花茶为贵州金花茶。贵州金花茶自然分布地域狭窄、种群数量少,加之遭受人为采挖、生境破坏等影响,如今野生植株数量甚微,野生种群处于濒危灭绝的状态。

贵州金花茶除了归属金花茶组共享“植物界的大熊猫”“茶族皇后”等声誉外,其皆具观赏价值、开发应用价值和科学研究价值。其花具有极高的观赏价值,富含微量元素、氨基酸,以及黄酮、多糖等400多种人体必需的活性成分物质[3-5]。前期研究表明,贵州金花茶除具备茶饮保健功能外,还具有药用功效,尤其在眼疾、皮肤病、心脑血管类后遗症、糖尿病、高血压、高胆固醇、高血脂和肠胃消化系统等疾病康复方面均有不俗表现[6-9],具备食用和药用开发价值。

简单重复序列间区(Inter-simple Sequence Repeat,ISSR)[10]分子标记技术的引物设计简单,多态性丰富,重复性好,成本低,同时兼有扩增片段长度多态性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)、简单重复序列标记(Simple Sequence Repeats,SSR)和随机扩增多态性DNA标 记(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分子标记的优点,已被应用于植物品种鉴定、遗传图谱构建、基因定位和辅助育种等研究[11,12]。

近年来,贵州省罗甸县把金花茶产业作为发展地方经济、助力脱贫攻坚的主抓产业,但是产业发展面临种苗繁育、种植问题,尤其是急需摸清种质资源特征,因此要把好种苗源头关。因此,本研究采用ISSR分子标记技术,开展对现存资源遗传多样性和DNA指纹图谱特性的研究,对进一步深度开发和利用贵州金花茶奠定理论基础。

1 材料与方法

1.1 试验材料

贵州金花茶(Camellia guizhouensisS.Y.Liang et T.L.Ming)新鲜叶片分别采集于罗甸县冒井镇大亭社区原生地周边村寨、罗甸境内企业以及贵州省林业科学研究院树木园引种植株(见表1)。试验采用3个原生植株和8个引种植株,将普通油茶(Camellia oleiferaAbel.)作为对照。

表1供试样品采集信息

由加拿大哥伦比亚大学设计100条ISSR引物序列UBC,编号依次为UBC 001~100。DNA提取试剂盒、琼脂糖、Good View核酸染料、100 bp DNA ladder、2×Tap Master Mix和50×loading Buffer等均为BIOMIGA公司产品。

1.2 试验方法

1.2.1 DNA提取及检测。称取0.5 g新鲜叶片,液氮磨碎,使用BIOMIGA公司试剂盒提取DNA样品,经1%琼脂糖凝胶电泳,电泳条件为110 V、30 min。将成功提取的DNA样品放入-40℃冰箱保存。

1.2.2 PCR扩增及检测。使用上海生物技术有限公司合成的100对ISSR引物进行PCR扩增,选出其中多态性条带较好的20对引物进行多态性扩增。PCR反应体系为总量20μL,其中2×Tap Master Mix 10μL、引物2μL、DNA模板1μL、ddH2O 7μL。

PCR扩增程序如下:95℃预变性5 min,95℃变性30 s,52℃退火30 min,72℃延伸30 min,35个循环,72℃退火5 min。

PCR检测采用2%琼脂糖凝胶电泳对PCR扩增结果进行电泳,电泳条件为电压110 V、80 min。之后在Tanon-2500数码凝胶图像分析仪上拍照保存,进行条带分析。

1.2.3 数据分析。使用NTSYS2.1软件对各样品的PCR扩增结果进行聚类分析,做出相应聚类图,分析各品种间的遗传距离。

2 结果与分析

2.1 PCR扩增与遗传多样性分析

获得高质量的DNA为模板,对100对通用引物进行筛选,共选出22对扩增效果较好、条带清晰的引物序列。扩增出的条带大小在100~1 300 bp,共扩增出440条带,其中多态性条带为385条,多态性占比为87.5%,结果表明供试材料的ISSR多态性较丰富。

利用5条引物扩增出来的440谱带建立11个金花茶品种的遗传相似系数矩阵,见表2。各样品之间的相似系数在0.39~0.84,平均相似系数为0.66,说明贵州金花茶样品具有较高的遗传多样性。其中,田坝组1号和县城益丰缘苗圃基地相似系数最大,为0.84,表明2个样品之间的亲缘关系相对较近;五湖公司基地9号与普通油茶相似系数最小,仅为0.39,表明9号与其他样品的亲缘关系相对较远,该植株为广西引种,是否为贵州金花茶需进一步鉴定。

2.2 贵州金花茶亲缘关系聚类分析

对这22对引物做进一步筛选,共筛选出扩增效果较好、特异性强的UBC817、UBC825、UBC827、UBC844和UBC845这5对引物,共扩增出76个不同位点,其中多态性位点为63处,多态性为82.89%。Ntsys2.10软件对11种金花茶的ISSR结果进行聚类分析,结果见图1,系数为0.693时,10个贵州金花茶供试样品分为2个组,即1号、2号、3号、4号、7号为一组,5号、6号、9号、10号为另一组,8号普通油茶作为对照组。

2.3 特异条带分析与指纹图谱构建

使用选定的5个扩增条数多、条带清晰、特异性强的引物用作11供试样品的指纹图谱构建。扩增结果如图2至图6所示,U817号引物扩增的条带大小在130~700 bp,共扩增出18位点,多态性位点为14处,多态性占比77.7%,可区分1号、2号、5号、7号、11号;U825号引物扩增的条带大小在190~1 100 bp,共扩增出19条带,多态性条带为17条,多态性占比89.5%,可区分6号、9号、11号;U827号引物扩增的条带大小在200~1 250 bp,共扩增出16条带,多态性条带为12条,多态性占比75%,可区分4号;U844号引物扩增的条带大小在100~600 bp,共扩增出12条带,多态性条带为8条,多态性占比66.6%,可区分3号。U845号引物扩增的条带大小在120~830 bp,共扩增出12条带,多态性条带为8条,多态性占比66.6%,可区分3号。根据10个ISSR引物的扩增结果,筛选出引物UBC017、UBC025、UBC027和UBC045扩增的51个多态性位点构建的DNA指纹图谱,可用于鉴定供试10个贵州金花茶样本。

表2遗传相似系数矩阵

3 结论与讨论

本试验采用ISSR分子标记对10份贵州金花茶材料进行遗传多样性分析,结果表明贵州金花茶材料之间遗传变异较丰富,同时呈现地域差异小的特点。样品遗传聚类分为2组,与调查过程中发现花瓣小花和大花2个类型相吻合,小花类型相对原生性相对较强,大花类型形态与离蕊金花茶较为相似,两者之间的亲缘关系仍值得深入研究。

本研究结果表明ISSR分子标记对贵州金花茶的亲缘关系具有很好的分类效果,可为贵州金花茶育种的亲本、杂种优势选择以及苗木品质鉴别提供理论基础,对物种保护和产业化育苗种苗鉴别提供技术支持。

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