穿山甲可能不是新型冠状病毒的中间宿主

当前，新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情仍在全球范围内肆虐，新冠肺炎的防控工作依然是重中之重。研究表明新型冠状病毒与中菊头蝠携带的Bat-CoV-RaTG13 冠状病毒全基因组核苷酸一致性高达96%，推测该病毒可能起源于蝙蝠，再由中间野生动物宿主进一步传播，但目前中间宿主仍然未知。

病毒通过在中间宿主内加速进化，通常具有与人类病毒更近的亲缘关系，如人SARS 冠状病毒与自然宿主中华菊头蝠和中间宿主果子狸病毒全基因组核苷酸一致性分别为95%和99.8%，中东MERS冠状病毒与自然宿主蝙蝠（Neoromicia capensis）和中间宿主骆驼病毒全基因组核苷酸一致性分别为85.5% 和99.9%。近期，《PLoS Pathogens》以当期封面发表了“Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus（SARS-CoV-2）?”的研究论文。该研究以新型冠状病毒全基因组序列（MN908947.3）为参考，对穿山甲携带的冠状病毒进行了重新拼接，获得了全长29 521 bp 的穿山甲冠状病毒基因组。系统亲缘进化关系分析表明马来穿山甲携带的冠状病毒为β 冠状病毒，其与新型冠状病毒（SARSCoV-2）全基因组序列一致性为90.3%，而蝙蝠冠状病毒与SARS-CoV-2 全基因组序列一致性为96.2%。这是首次获得穿山甲携带的冠状病毒的全长基因组序列，并且该冠状病毒与来源于其它宿主的冠状病毒具有明显的遗传距离，表明穿山甲感染的是不同于SARS-CoV-2 的另一种新的冠状病毒。

S 蛋白是冠状病毒与宿主细胞受体结合的重要区域，分析发现穿山甲冠状病毒受体结合域（Receptorbinding domain）与SARS-CoV-2 相应区域氨基酸序列的一致性为96.80%，其中重要结合位点（Receptorbinding motif）仅有一个氨基酸的变异。鉴于新型冠状病毒对人类有极强的感染能力，而穿山甲冠状病毒与新型冠状病毒重要结合位点的氨基酸序列极为相似，因此该研究推测马来穿山甲携带的冠状病毒对人也具有潜在的感染性。

无论从冠状病毒全基因组还是单个功能基因序列的进化分析, 该研究不支持SARS-CoV-2 直接来源于穿山甲或者穿山甲起到中间宿主的作用。但进一步对穿山甲冠状病毒的监测可以提高对穿山甲冠状病毒谱的认知。除了保护野生动物外，减少人类与野生动物的接触对于降低野生动物冠状病毒对人类的溢出风险也至关重要。