基于SDS-PAGE与荧光标记检测技术的黄淮麦区小麦品种(系)HMW-GS组成分析

2019-11-21 02:52贾琳琳王永霞靳晓杰
河南农业科学 2019年11期
关键词:亚基位点荧光

贾琳琳,王永霞,靳晓杰

(河南省农业科学院 作物设计中心,河南 郑州 450002)

随着我国经济的发展和人民生活水平的不断提高,人们对小麦品质的要求越来越高,小麦品质改良已成为小麦育种工作的重要研究方向。在影响小麦品质的众多因素中,高分子质量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)对小麦面粉加工品质起关键作用[1-2],其组成已成为品质育种中亲本选配和杂交后代选择的重要依据。HMW-GS由第一部分同源染色体长臂上的Glu-A1、Glu-B1、Glu-D1位点编码[3]。每个位点都含有2个紧密连锁基因,分别编码分子质量较大的x型和分子质量较小的y型亚基。到目前为止,已经发现并命名的亚基超过40种。公认的优质HMW-GS有1、2*、7+8、14+15、13+16、5+10等,优质亚基组合有1/14+15(13+16)/5+10、1/7+8/5+10、1/17+18/2+12等[4-8]。研究表明,我国小麦品种的HMW-GS组成较丰富,但优质亚基频率较低,同时含有多个优质亚基组合的品种也较少,品质仍较差[9-11]。因此,筛选含有优质HMW-GS和亚基组合的材料成为提高小麦面粉加工品质的关键。

检测小麦HMW-GS的方法主要有SDS-PAGE[5]、分子标记[12]和高效毛细管电泳[13]等。其中,SDS-PAGE是最常用的方法,并得到了广泛应用,分子标记可辅助SDS-PAGE有效鉴定HMW-GS多样性。分子标记可以直接对HMW-GS 基因进行检测,不受植株发育时期、取材部位的限制,具有其独特的优越性。编码HMW-GS的基因具有高度的同源性,每个基因位点都存在大量的等位变异,不同等位基因之间的差异由DNA序列的重复和缺失造成。国内外诸多学者根据其特点设计出特异性、保守性引物,可快速、准确地检测HMW-GS基因[14-17]。LEI等[14]针对Glu-B1位点编码区域DNA序列变异设计出特异性引物,可有效鉴定By7、By8、By9基因。LIU等[15]在前人研究的基础上,在Glu-A1、Glu-D1位点上设计出共显性标记UMN19、UMN25、UMN26,可分别鉴定Ax2*、Ax1、null,Dx2、Dx5,Dy10、Dy12基因。此外,已开发分子标记的基因还有Bx7*、Bx7OE、By8*、By16等[16]。毛细管电泳荧光标记检测法是一种快速、准确、高效的分子标记检测方法,能极大提高工作效率,增强试验结果的稳定性和可重复性。郑永胜等[17-18]利用该方法建立了小麦品种DNA指纹鉴定体系,并利用81个SSR标记对96份小麦品种进行了相似度分析。目前,将凝胶电泳与分子标记相结合进行小麦HMW-GS检测的研究很少,且分子标记检测的方法均为琼脂糖凝胶电泳[19-21],而同时使用SDS-PAGE和毛细管电泳荧光标记检测的研究尚未见报道。为此,利用SDS-PAGE和荧光标记法同时对91份黄淮麦区小麦品种(系)的HMW-GS组成进行分析,以期为黄淮麦区小麦品质改良提供理论依据。

1 材料和方法

1.1 试验材料

供试材料为91份黄淮麦区小麦品种(系),包括68份品种和23份品系(表1),分别来自河南省、河北省、山东省等地,以中国春(Null/7+8/2+12)、师栾02-1(1/7+9/5+10)、石4185(1/14+15/2+12)为对照材料。其中,师栾02-1和石4185由河北省农林科学院张颖君惠赠,其余材料均由河南省农业科学院作物设计中心提供。

表1 小麦品种(系)名称及来源Tab.1 Wheat varieties(lines) name and source

续表1 小麦品种(系)名称及来源Tab.1(Continued) Wheat varieties(lines)name and source

1.2 试验方法

1.2.1 HMW-GS 提取 HMW-GS样品提取参考PENG等[22]的方法。每份样品取10粒种子磨粉后,称取20 mg 置于2 mL 离心管中,加入1 mL样品提取液[62.5 mmol/L Tris-HCl (pH值6.8)、0.002%溴酚蓝、10%甘油、1.5%二硫苏糖醇、2% SDS]65 ℃水浴浸提30 min,涡旋5 min,取出冷至室温,9 000×g离心5 min,取上清保存于4 ℃冰箱。

1.2.2 SDS-PAGE电泳 采用10%(pH值 8.8)的分离胶和4%(pH 值6.8)的堆积胶,用甘氨酸溶液为电极缓冲液,单板电流15 mA,电压100 V,电泳8 h,用考马斯亮蓝R250染色液染色过夜,蒸馏水脱色至条带清晰,拍照保存。参照 PAYNE等[23]的亚基命名及编号方法对亚基进行记录。

1.2.3 毛细管电泳荧光标记检测 采用CTAB法从幼苗叶片中提取供试材料的基因组DNA。PCR反应体系总体积为10 μL:dNTPs(25 mmol/L)0.15 μL、上游引物(10 μmol/L)0.15 μL、下游引物(10 μmol/L)0.3 μL、M13荧光标记引物(10 μmol/L)0.15 μL、Taq酶 0.15 μL、10×Buffer 1 μL、模板60 ng,用去离子水补足至10 μL。本研究涉及的引物为UMN19、UMN25、UMN26,其中上游引物前端加有M13的尾巴序列(5′-CACGACGTTGTAAAACGAC-3′),由生工(上海)生物工程有限公司合成,M13荧光标记引物由英潍捷基(上海)贸易有限公司合成(表2)。

表2 荧光标记引物信息Tab.2 The information of fluorescent labeled primers

PCR扩增反应在Eppendorf Mastercycler®pro 384扩增仪上进行,PCR扩增程序参照LIU等[15]的方法。PCR结束后,每孔加7 μL甲酰胺于95 ℃变性5 min,在ABI 3500XL上进行荧光检测,结果利用Genograper 2.1软件进行分析。

1.2.4 品质评分和聚类分析 HMW-GS评分标准参照宋建民等[24]的方法,目的条带存在时赋值为1,不存在时赋值为0,根据1、0数据构建矩阵,计算遗传相似系数,利用软件NTSYS 2.1中UPGMA进行聚类分析。

2 结果与分析

2.1 基于SDS-PAGE检测的小麦品种(系)HMW-GS组成分析

SDS-PAGE检测结果显示,供试小麦材料共含有14种HMW-GS类型,表现出丰富的变异(表3—4)。Glu-A1位点上共有1、Null、2*三种亚基类型,出现频率分别为59.34%、37.36、3.30%。Glu-B1位点上共有5种亚基类型,分别为7、7+8、7+9、13+16、14+15。其中,7+8的频率最高(52.75%),其次为7+9(25.27%),携带稀有亚基7、13+16、14+15的材料有19份。Glu-D1位点亚基变异较丰富,共出现6种亚基类型,除所占比例较高的2+12和5+10亚基外,还有10、12、3+12、4+12稀有亚基,特别是3+12和4+12亚基,累计出现比例高达21.98%,说明近年来更多的亚基类型被用于小麦品质改良育种。

2.2 基于荧光标记检测的小麦品种(系)HMW-GS组成分析

荧光标记检测结果(部分结果见图1)显示,91份供试小麦材料中含Ax1、Null基因的材料较多,含Ax2*基因的材料有3份;含Dx2、Dx5基因的材料各有42、27份,比例分别为46.15%、29.67%;周麦18等63份材料含有Dy12基因,28份材料含有Dy10基因。综上,荧光标记检测结果与SDS-PAGE检测结果相吻合,说明亚基特异性分子标记可准确、快速地检测小麦中HMW-GS基因。

表3 基于SDS-PAGE检测的91份小麦品种(系)的HMW-GS组成分析

续表3 基于SDS-PAGE检测的91份小麦品种(系)的HMW-GS组成分析

表4 基于SDS-PAGE检测的小麦品种(系)HMW-GS等位变异及频率分析Tab.4 Allelic variation and frequency analysis of HMW-GS in 91 wheat varieties (lines) based on SDS-PAGE

1—18为品种(系)编号(同表1)1—18 are varieties(lines)number(the same as Tab.1)

2.3 小麦品种(系)HMW-GS组合及其频率、品质分析

由表5可知,在91份供试小麦材料中,共检测出28种HMW-GS组合,表现出丰富的HMW-GS组成多样性。其中,适合制作面包的优质亚基组合类型1/7+8/5+10出现频率最高,为14.29%;其次是适合制作优质手工馒头的亚基组合1/7+8/2+12和Null/7+8/2+12,均为12.09%;15个亚基组合出现频率较低,均为1.10%。

由表5可知,供试材料得分介于5.5~11.0,平均得分为7.78,由于10、12亚基的品质评分未见报道,暂不对含有这些亚基的组合进行评分,且含有这2个亚基的材料均只有1份,对总体评分影响不大。Null/13+16/5+10组合得分最高(11.0分),分别来自泉麦28、小偃6号、龙科1109。品质评分在9分及以上的亚基组合有1/13+16/2+12、1/7+8(7+9)/5+10、Null/13+16/2+12、Null/14+15/5+10。

表5 供试小麦品种(系)HMW-GS组合类型及其频率、品质得分

2.4 基于HMW-GS的小麦品种(系)聚类分析

由图2可知,在遗传相似系数为0.42时,可以将供试材料分为4大类:第Ⅰ类包括03中42、衡562、沧麦6001、泉麦28,小偃6号和龙科1109等6份材料,其Glu-B1位点上的亚基类型为13+16,亚基组合所得品质评分相对较高;第Ⅱ类包括2份材料,分别为良星66和平安11,其Glu-B1位点上的亚基类型为稀有亚基14+15;第Ⅲ类包括22个材料,其Glu-D1位点上的亚基类型为优质亚基 5+10,该类集中了大部分强筋小麦材料,如新麦26、郑麦7698和郑麦366等;第Ⅳ类可以分为3个亚类,第一亚类包括28份材料,第二亚类包括7份材料,第三亚类包括23份材料。

图2 基于HMW-GS的91个小麦品种(系)的聚类分析

3 结论与讨论

黄淮麦区是我国小麦的主产区,该区域小麦HMW-GS等位基因和亚基组合的多态性较丰富,但分布均严重不均。优质亚基5+10和14+15所占比例有所提高,但优质亚基组合所占比例仍然很低[25]。麻珊珊等[26]对参加黄淮麦区南片冬、春小麦预备试验的143个小麦新品种(系)HMW-GS组成进行分析,发现了10种等位基因和15种亚基组合,对加工品质具有正效应的优质亚基1出现的频率为59.44%,14+15出现频率为13.99%,5+10出现频率为37.06%,谢科军等[27]、李立等[28]研究结果与之相似。本研究也得到相似的结果,在随机选取来源不同的小麦品种(系)中,优质亚基1(59.34%)和5+10(29.67%)出现频率依然较高,14+15出现频率则没有提高。本研究中除检测到1、7+8、2+12、5+10等所占比例较高的亚基外,还发现一些稀有优质亚基,如2*、13+16、14+15等,极大地丰富了黄淮麦区小麦的HMW-GS类型,说明近年来人们开始注重不同优质亚基材料的引进、筛选和利用。供试材料的平均品质得分较张瑞奇等[29]研究结果有所提高,品质评分在9.0分及以上的亚基组合有1/13+16/2+12、1/7+8(7+9)/5+10、Null/13+16/2+12、Null/14+15/5+10。其中,Null/13+16/5+10亚基组合出现频率较低(3.30%),但它们的品质评分最高(11.0分);优质亚基组合1/7+8/5+10出现品频率最高(14.29%),其品质评分高达9.5分。小麦的品质育种过程中应加强对优异种质的利用,本研究所筛选出来的含有1、2*、5+10、13+16、14+15等优质亚基和亚基组合的品种(系)可作为杂交亲本和转育材料,用于黄淮麦区小麦定向品质改良育种。

SDS-PAGE是分离检测HMW-GS最常用的方法,在国内各育种单位得到了广泛应用,对加速小麦品质育种做出很大的贡献。SDS-PAGE法具有一定的局限性,如需要用收获后的籽粒作为材料,且电泳图谱上亚基的迁移率与分子质量并不总是一致,从而混淆分子质量不同而迁移率相似的亚基等。利用分子标记进行HMW-GS鉴定,克服了SDS-PAGE方法的局限性,可在不同的生育时期进行取样,可以快速大量地检测相关基因,因而受到了广泛的重视。白升升等[21]利用分子标记有效鉴定了迁移率相近的7、7*与7OE,8与8*亚基,准确分析了小麦HMW-GS类型。本研究中分子标记检测结果与SDS-PAGE检测结果相吻合,说明利用分子标记技术可有效鉴定材料中HMW-GS。此外,本研究采用的毛细管电泳荧光标记检测技术,相比之前的琼脂糖凝胶电泳和普通的SDS-PAGE,具有高通量、高灵敏度、分析过程自动化等优点,适用于大规模材料的分析研究。试验过程中合理搭配扩增片段差异较大的同种荧光标记,实现多荧光多目的片段PCR产物的同时检测,提高基因型鉴定效率,有效降低了鉴定成本。

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