何伟平 姬怀雪 胡书群 蔡静然 唐会卓 裴冬生 杜秀平 王艳
中圖分类号 R968;R734.2 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2019)16-2258-05
DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2019.16.19
摘 要 目的:探讨DNA修复基因聚腺苷酸二磷酸核糖转移酶(ADPRT)基因rs1136410位点多态性与苏北地区汉族人群非小细胞肺癌(NSCLC)发生的相关性。方法:选取2015年11月-2018年12月于徐州医科大学附属医院就诊的苏北地区汉族原发性NSCLC患者283例,作为NSCLC组;选择同期体检的健康者210例作为对照组。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测各受试者ADPRT基因rs1136410位点的基因型,采用Logistic回归模型评价位点多态性及其与吸烟交互作用对NSCLC发生的影响。结果:两组受试者性别、年龄比较,差异均无统计学意义(P>0.05);而NSCLC组吸烟者的比例显著高于对照组(P<0.05)。共检出ADPRT基因rs1136410位点TT、TC、CC等3种基因型。其中,对照组受试者TT、TC、CC型频率分别为41.9%、44.8%、13.3%,T、C等位基因频率分别为64.3%、35.7%;NSCLC组患者TT、TC、CC型频率分别为21.6%、50.2%、28.2%,T、C等位基因频率分别为46.6%、53.4%。两组受试者各基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),但基因型及等位基因频率的组间差异明显(P<0.05)。与TT型个体比较,TC、CC型个体发生NSCLC的风险分别增加了1.179、3.122倍[比值比(OR)分别为2.179、4.122,95%置信区间(CI)分别为(1.435,3.309)、(2.401,7.075),P<0.05]。与TT型不吸烟个体比较,TC、CC型不吸烟个体发生NSCLC的风险分别增加了0.371、1.328倍[OR分别为1.371、2.328,95%CI分别为(0.927,3.428)、(1.249,4.622),P<0.05],TC、CC吸烟个体发生NSCLC的风险分别增加了0.928、2.182倍[OR分别为1.928、3.182,95%CI分别为(1.257,2.957)、(1.760,5.754),P<0.05]。结论:ADPRT基因rs1136410位点突变是我国苏北地区汉族人群罹患NSCLC的危险因素,且吸烟可进一步增加该位点突变个体发生NSCLC的风险。
关键词 ADPRT基因;rs1136410位点;单核苷酸多态性;非小细胞肺癌;相关性;吸烟;汉族;苏北地区
Correlation Analysis of ADPRT rs1136410 Polymorphism with the Occurrence of Non-small Cell Lung Cancer in Han Nationality from Northern Jiangsu
HE Weiping1,JI Huaixue1,HU Shuqun2,CAI Jingran1,TANG Huizhuo1,PEI Dongsheng3,DU Xiuping4,WANG Yan1(1. Dept. of Pharmacy, the Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University, Jiangsu Xuzhou 221002, China; 2. Institute of Emergency Rescue Medicine, Xuzhou Medical University, Jiangsu Xuzhou 221002, China; 3. Dept. of Pathology, Xuzhou Medical University, Jiangsu Xuzhou 221004, China; 4. Oncology Center, the Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University, Jiangsu Xuzhou 221002, China)
ABSTRACT OBJECTIVE: To investigate the correlation of ADPRT rs1136410 polymorphism with the occurrence of non-small cell lung cancer (NSCLC) in Han nationality from northern Jiangsu. METHODS: A total of 283 patients with primary NSCLC of Han nationality in Northern Jiangsu were selected from the Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University during Nov. 2015-Dec. 2018 as NSCLC group. A total of 210 healthy subjects underwent physical examination were included in control group. PCR-RFLP was utilized to determine the genotypes at ADPRT rs1136410 locus. Logistic regression model was used to evaluate the effect of polymorphism and its interaction with smoking on the occurrence of NSCLC. RESULTS: There was no statistical significance in age and gender between 2 groups (P>0.05). The proportion of smoker in NSCLC group was significantly higher than control group (P<0.05). TT, TC and CC genotypes were detected at rs1136410 locus of ADPRT gene. The frequency of TT, TC and CC genotype were 41.9%,44.8% and 13.3%, and those of allele T and C were 64.3% and 35.7% in control group. The frequency of TT, TC and CC genotype were 21.6%, 50.2% and 28.2%, and those of allele T and C were 46.6% and 53.4% in NSCLC group, respectively. The frequencies of genotypes in 2 groups were in accordance with Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05), while there was significant difference in genotype and allele frequencies between 2 groups (P<0.05). Compared with TT genotype, the risk of NSCLC in individuals carrying TC and CC genotypes raised by 1.179, 3.122 folds [ORTC=2.179, 95%CI (1.435, 3.309), P<0.05; ORCC=4.122,95%CI(2.401,7.075),P<0.05]. Compared with individuals carrying TT genotype, the risk of NSCLC occurrence in non-smokers carrying TC and CC genotypes increased by 0.371, 1.328 fold [ORTC=1.371,95%CI (0.927,3.428),P<0.05; ORCC=2.328,95%CI (1.249,4.622),P<0.05]; and the risk of NSCLC occurrence in smokers carrying TC and CC genotypes increased by 0.928, 2.182 folds [ORTC=1.928,95%CI (1.257,2.957), P<0.05;ORCC=3.182,95%CI (1.760,5.754), P<0.05]. CONCLUSIONS: The rs1136410 locus mutant genotype of ADPRT gene is the risk factor of NSCLC in Han nationality from Northern Jiangsu, and smoking raises this risk of NSCLC occurrence in individuals with mutation genotypes of ADPRT rs1136410.
KEYWORDS ADPRT gene; rs1136410; Single nucleotide polymorphism; Non-small cell lung cancer; Correlation; Smoking; Han nationality; Northern Jiangsu
肺癌是近年来发病率和病死率最高的恶性肿瘤[1-3]。其中,非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC)约占85%,且其确诊时大多患者已处于晚期,错失手术机会[4-5],故其早期诊断至关重要。有研究发现,DNA修复能力下降是引发肺癌(包括NSCLC)的重要原因之一,DNA修复途径基因的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)可导致机体DNA修复能力下降,并增加患者对肿瘤的易感性[6]。聚腺苷二磷酸核糖转移酶(ADPRT)又称聚腺苷酸二磷酸核糖基转移酶(PARP),其编码基因(ADPRT)是DNA修复途径中重要的修复基因[7]。既往文献报道,该基因存在多个与恶性肿瘤易感性相关的SNP位点,但研究结果不一[8-14]。其中,rs1136410位点是研究热点之一,其突变可增加胃癌发生的风险[11],但可降低脑部肿瘤的发生率[12]。Wang X等[13]研究发现,ADPRT基因rs1136410位点多态性与我国北方人群肺癌的发生无关。Qin Q等[14]的研究指出,该位点多态性可导致亚洲人群肺癌发生的风险增加,而与高加索人群肺癌的发生无关。目前尚未检索到ADPRT基因rs1136410位点多态性对我国苏北地区汉族人群NSCLC易感性影响的相关报道。为此,本研究以该类人群为研究对象,初步探讨了ADPRT基因rs1136410位点多态性与其NSCLC发生的相关性,旨在为NSCLC早期预防和诊断新标志物的寻找提供参考。
1 资料与方法
1.1 研究对象
本研究经徐州医科大学附属医院临床试验伦理委员会审查通过(批件号:XYFY2018-KL023-01),取样前所有受试者均知情同意并且签署了知情同意书。
1.1.1 NSCLC组 选取2015年11月-2018年12月于徐州医科大学附属医院就诊的原发性NSCLC的苏北地区患者283例,作为NSCLC组。纳入标准:(1)年龄>18岁;(2)汉族;(3)无血缘关系;(4)经病理学和/或组织学检查确诊为NSCLC(如肺腺癌、肺鳞癌等)。排除标准:(1)有肿瘤史者;(2)曾接受过手术或放化疗者;(3)伴有其他严重疾病(如糖尿病,无法控制的高血压,最近6个月内出现过心力衰竭、心肌梗死等)者。其中,男性182例,女性101例;平均年龄(60.50±7.32)岁;吸烟者176例,非吸烟者107例;腺癌176例,鳞癌99例,类型不明确的8例;TNM分期Ⅰ~Ⅱ期80例,Ⅲ~Ⅳ期203例。
1.1.2 对照组 选取同期于该院进行体检的健康者210例,作为对照组。纳入标准:(1)体检结果为健康,无肿瘤和/或内分泌及代谢性疾病;(2)与NSCLC组患者无血缘关系;(3)无肿瘤尤其是NSCLC家族史;(4)无明确职业性致癌因素接触史;(5)年龄、性别与NSCLC组患者匹配。排除标准:(1)有肿瘤史者;(2)三代以内亲属有肿瘤史者。其中,男性131例,女性79例;平均年龄(59.74±8.85)岁;吸烟者101例,非吸烟者109例。
1.2 资料收集
本研究采用回顾性分析方法,收集并记录两组受试者的人口学资料,包括年龄、性别、个人疾病史、吸烟史等;采集NSCLC组患者的确诊信息。
1.3 ADPRT基因rs1136410位点多态性检测
所有受试者均抽取外周静脉血2 mL,采用Ezup柱式血液基因组DNA抽提试剂盒[生工生物工程(上海)有限公司],并参照说明书提取DNA,产物置于-20 ℃保存。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法(PCR-RFLP)进行基因分型。引物由生工生物工程(上海)有限公司设计并合成,上游引物:5′-GTTCTTCCACCTCTCAACTCCCCCA-3′,下游引物:5′-TGCTGCTATCAGACCCTCCCCT-3′。反应体系(共25.0 μL):DNA模板9.0 μL,10×EasyTaq缓冲液5.0 μL(含20 mmol/L氯化镁),10 mmol/L dNTP 5.0 μL,10 μmol/L上、下游引物各2.5 μL,5 U/μL EasyTaq DNA Polymerase 1.0 μL(除上、下游引物和DNA模板外,其余试剂均购自北京全式金生物技术有限公司)。反应条件:94 ℃预变性5 min,94 ℃变性30 s,62.0 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,72 ℃再延伸5 min,共30个循环。酶切反应体系(共20.0 μL):10 U/μL EciⅠ内切酶1.0 μL(美国New England Biolabs公司)、10×酶切缓冲液2.0 μL(美国New England Biolabs公司)、0.1%牛血清白蛋白2.0 μL(徐州微科曼得生物工程有限公司)、PCR产物10.0 μL、灭菌双蒸水5.0 μL,混匀后于37 ℃消化12 h。取酶切产物10 μg,行2.0%琼脂糖凝胶电泳(电压:100 V,时间:40 min),于1600R型凝胶成像系统(上海天能科技有限公司)上成像,确定各基因型。
1.4 统计学方法
采用SPSS 19.0软件对数据进行统计分析。采用拟合优度χ2检验分析受试者基因型频率是否符合Hardy-Weinberg平衡。计量资料以x±s表示,组间比较采用t检验;計数资料以例数或率表示,组间比较采用χ2检验。建立Logistic回归模型分析ADPRT基因rs1136410位点多态性与肺癌发生的相关性,以经患者年龄、性别、吸烟史校正后的比值比(OR)和95%置信区间(CI)表示相对危险度。所有统计检验均为双侧概率检验,P<0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 一般资料
两组受试者的年龄、性别比较,差异均无统计学意义(P>0.05);而NSCLC组吸烟者的比例显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),详见表1。
2.2 基因型分析结果
按“1.3”项下方法得ADPRT基因rs1136410位点PCR扩增产物的大小为311 bp。经EciⅠ酶切后,野生(TT)型酶切片段的大小为311 bp,突变杂合(TC)型酶切片段的大小为311、236、75 bp,突变纯合(CC)型酶切片段的大小为236、75 bp,详见图1。
由图1可见,本研究共检出ADPRT基因rs1136410位点3种基因型:TT、TC、CC型。其中,对照组受试者TT、TC、CC型频率分别为41.9%、44.8%、13.3%,NSCLC组患者TT、TC、CC型频率分别为21.6%、50.2%、28.2%。两组受试者各基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。两组受试者上述基因型及等位基因频率比较,差异均有统计学意义(P<0.05),详见表2。
2.3 ADPRT基因rs1136410位点多态性与NSCLC发生的相关性
Logistic回归分析结果显示,ADPRT基因rs1136410位点多态性与NSCLC的发生有关。其中,与TT型个体比较,TC型个体发生NSCLC的风险增加了1.179倍,CC型个体发生NSCLC的风险增加了3.122倍,差异均有统计学意义(P<0.05),详见表3(表中,“*”表示该参数经年龄、性别、吸烟史校正)。
2.4 ADPRT基因rs1136410位点多态性与吸烟的交互作用对NSCLC发生的影响
既往研究表明,吸烟是诱发NSCLC的重要环境因素[13],故本研究进一步探讨了ADPRT基因rs1136410位点多态性与吸烟的交互作用对NSCLC发生的影响。结果显示,与ADPRT基因rs1136410位点TT型不吸烟个体比较,TC型不吸烟个体发生NSCLC的风险增加了0.371倍,而吸烟个体发生NSCLC的风险增加了0.928倍,差异均有统计学意义(P<0.05);CC型不吸烟个体发生NSCLC的风险增加了1.328倍,而CC型吸烟个体发生NSCLC的风险增加了2.182倍,差异均有统计学意义(P<0.05),详见表4(表中,“*”表示该参数经年龄、性别校正)。
3 讨论
ADPRT是重要的DNA修复基因,定位于人类染色体1q41~42,其编码多肽的长度约为113 kDa,该多肽由6个独立结构域组成,可通过对DNA缺口进行识别来修复DNA单链的断裂损伤[14]。其中,位于该基因17外显子的rs1136410位点可发生非同义突变(即碱基T与C置换,致编码的缬氨酸变成丙氨酸),造成编码产物ADPRT酶催化结构域空间构象发生改变,使得其活性降低、DNA修复能力下降,最终增加肿瘤发生的风险[15]。Bashir K等[8]研究发现,携带突变纯合子(即CC型)的个体罹患甲状腺癌的风险增加;Alanazi M等[16]的研究结果表明,携带突变杂合子(即TC型)的沙特阿拉伯人群罹患乳腺癌的风险增加,提示该位点可能与肿瘤的发生有关。为此,本研究初步探讨了该位点多态性与我国苏北汉族人群NSCLC发生的相关性。本研究采用PCR- RFLP法共检出了ADPRT基因rs1136410位点TT、TC、CC等3种基因型,两组受试者各基因型及等位基因频率比较,差异均有统计学意义。Logistic回归分析结果显示,该位点突变会增加我国苏北地区汉族人群NSCLC发生的风险,其突变基因型(TC、CC型)及突变等位基因(C等位基因)是NSCLC发生的危险因子,与相关研究的结果[13-14]并不完全一致。笔者认为,一方面可能与受试者的不同地域、不同民族有关;另一方面也可能与受试者的不同肿瘤及病理类型有关。
此外本研究还发现,NSCLC组吸烟者的比例显著高于对照组,故进一步分析了ADPRT基因rs1136410位點基因型与吸烟的交互作用对NSCLC发生的影响。结果发现,携带C等位基因且合并吸烟的患者罹患NSCLC的风险亦显著增加。Zhang X等[17]研究显示,吸烟可显著增加ADPRT基因rs1136410位点突变纯合型个体罹患肺癌的风险,且风险随吸烟指数的升高而增加;Anil S等[18]也发现,吸烟可增加ADPRT基因rs1136410位点CC型个体罹患口腔鳞癌的风险。同时有文献指出,致癌剂(包括烟草致癌物)可直接引起DNA突变,亦能抑制DNA修复酶的活性、降低DNA修复能力,从而增加个体癌症发生的风险[19]。由此可见,环境-基因交互作用对NSCLC发生的影响不能忽视,吸烟是导致ADPRT基因rs1136410位点突变个体发生NSCLC的重要环境因素,但具体机制还有待进一步研究证实。
综上所述,ADPRT基因rs1136410位点突变可增加我国苏北地区汉族人群NSCLC发生的风险,且吸烟可进一步增加该位点突变个体发生NSCLC的风险。但由于本研究样本量偏小,故本课题组将扩大样本量对上述结果予以证实,并进一步揭示ADPRT基因rs1136410位点突变对其蛋白质功能及酶活性影响的分子机制。
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(收稿日期:2019-03-20 修回日期:2019-05-27)
(編辑:张元媛)