宁乡猪GLP2R基因多态性研究

2019-06-11 11:01曾青华
国外畜牧学·猪与禽 2019年3期
关键词:宁乡等位基因多态性

曾青华

摘 要:为探讨宁乡猪遗传多样性,本研究以外来猪种大白猪为对照,研究了宁乡猪GLP2R基因的多态性。通过限制性片段长度多态性聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism,PCR-RFLP)分析检测了该基因A/G位点。结果表明,宁乡猪全部为GG型,大围子猪和黔邵花猪的优势等位基因都为G;而外来品种(大白猪)的优势等位基因为A,其基因频率为0.6433,中外品种的差异较大。本研究为宁乡猪的保种和选育提供了有益的资料。

关键词:猪;GLP2R基因;遗传多态性

宁乡猪是我国著名的四大地方猪品种之一,原产于湖南省宁乡县的流沙河及草冲一带,其特征是“丝颈葫芦肚,耳薄嘴筒齐,稀毛现薄皮,鱼尾后脚直,奶子一斩齐,四脚要撒蹄”、“乌云盖雪银颈圈”。其体型中等,体质疏松细致,体躯呈圆筒状,毛色为黑白花,四肢、肋腹及颈下部为白色,头和臀部呈黑色。GLP2R属于G蛋白偶联受体家族[1]。GLP2R为GLP2的特异性受体,GLP2与其受体结合从而发挥作 用[2-3]。Luo等[4]认为GLP2R基因与猪肌内脂肪含量有关。

本研究首次检测了宁乡猪GLP2R基因的多态性,旨在为揭示猪GLP2R基因的分子遗传机制奠定基础,并为宁乡猪保种和选育提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 样品采集

以4个地方猪种(大围子猪、宁乡猪、沙子岭猪、黔邵花猪)和1个外来猪种(大白猪)为试验材料,共计523头,分别采取猪耳组织样品,于-20 ℃保存。

1.2 基因组DNA提取

基因组DNA提取按常规酚-氯仿法进行。

1.3 引物合成及聚合酶链反应扩增

用Primer Premier 5.0软件设计引物,其中正向引物:5'-ATG AGG CCG GAA CGG AGC CG-3';反向引物:5'-CTA ATC TCA CTC TCC TCG AG-3',由华大基因公司合成。聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)体系:2×PCR Master·Mix 10 μL,双蒸水8.0 μL,引物1.0 μL,基因组DNA 1.0 μL。PCR扩增程序:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s;55 ℃复性30 s;72 ℃延伸30 s,共35个循环;72 ℃延伸 5 min;4℃保存。

2 结果与分析

2.1 基因型分型

在扩增的746 bp的片段中,709 bp处A/G突变位点导致了限制性内切酶BstE Ⅱ的变化。GLP2R基因的A/G位点存在3种基因型,分别为GG基因型(506 bp、240 bp)、AG基因型(746 bp、506 bp、240 bp)和AA基因型 (746 bp)(图1)。

2.2 猪GLP2R基因的多态性分析

GLP2R基因A/G突变位点PCR-RFLP-BstEⅡ的基因和基因型频率见表1。大围子猪和黔邵花猪这两个地方品种的优势等位基因都为G;而外来品种(大白猪)的优势等位基因为A,基因频率为0.6433。从基因型分布频率看,GG型占优势,AA型个体较少,只在沙子岭猪中发现1个,在黔邵花猪中发现4个,在桃源黑猪中检出15个;但大白猪中GG型较少(41个),而AA型和AG型分别有125个和127个。

3 讨论与结论

宁乡猪GLP2R基因A/G位点基因型全部为GG型,可能的原因是该品种经过长期高度近交的人工選育,此位点已全部纯合,这也反映了该品种比较纯。大围子猪在该位点也是全部为GG型。沙子岭猪和黔邵花猪G等位基因为优势等位基因,而在外来品种(大白猪)中A等位基因为优势等位基因,这也反映了中外品种的遗传背景差异大。在该位点上的差异有望作为品种标记的一种手段,应用于标记辅助选择。□□

参考文献:(4篇,略)

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