ERCC-2基因单核苷酸多态性与胃癌患者预后相关性的meta分析

2018-09-11 02:09武亚运王勇攀董晓强毛德利何宋兵
健康研究 2018年4期
关键词:多态性基因型位点

武亚运,王勇攀,董晓强,毛德利,何宋兵

(1.嘉善县第一人民医院 普外科,浙江 嘉善 314000;2.苏州大学附属第一医院 普外科,江苏 苏州 215006)

胃癌(gastric cancer)是消化系统比较常见的恶性肿瘤,有统计学数据表明,在2012年,全世界有72.31万的胃癌患者死亡,而且有95.16万的新增病例[1]。亚洲地区尤其是亚洲东部地区的胃癌发病率相对全球而言,处于较高的水平,就最新的流行病学数据表明,2015年度,我国新增67.91万胃癌患者,同年又有49.80万胃癌患者死亡,对于我国国民而言,其危害性仅次于肺癌[2]。ERCC-2基因,又称XPD基因,即着色性干皮病基因 D(xeroderma pigmentosum group D,XPD),是NER(nucleotide excision repair)通路中的重要基因,该基因中751、312 位密码子的突变频率较高。近年来研究发现,该基因的rs1799793(XPD312)、rs13181(XPD751)位点单核苷酸突变与胃癌患者预后相关[3-4]。本文拟应用meta分析的方法系统评价ERCC2基因多态性与胃癌患者预后的相关性。

1 资料和方法

1.1 检索数据库 检索Pubmed, Embase, Web of science等数据库中2017年9月8日前公开发表的有关ERCC2多态性与胃癌相关的文献。对检索到的文献无时间限制,未检索灰色文献,语种为英文。检索关键词为(“ERCC-2”,“ERCC2”,“XPD”, “Stomach Neoplasm*”, “Gastric Neoplasm*”, “Stomach Cancer*”, “Gastric Cancer*”,“Polymorphism*”,“snp”, “snps”, “varia*”, “mutation*”),括号内“*”代表“截词检索”。

1.2 文献的纳入和排除 纳入标准:英文类公开发表的队列研究文献,所有研究对象均为病理确诊的胃癌,对于预后的相关性研究,结局指标必须为OS(Overall Survival即总体生存时间),文中可以直接获取HR(hazard ratio)及95%CI(confidengce interval),或应用Tierney 等人的方法从Kaplan-meier生存曲线上间接获取HR及95%CI[5];排除会议论文或摘要,综述,系统评价类文献,动物试验,质量评价分数较低,数据不全且无法获得完整数据的文献。

1.3 文献质量及风险评价 此次meta分析,由于纳入的所有研究类型均为队列研究,应用的是NOS量表(Newcastle-OttawaScale量表)对研究进行评价,以其下包含的8个分支小条目作为评分点,单个小条目代表1分,高于6分(含6分)的研究才可进行meta分析。经评价后所有入选文献评分均在6分及6分以上。

1.4 筛选和资料提取 研究的筛选由多名人员完成(n≥3)。主要提取的信息包括:作者、胃癌患者肿瘤分期、样本量、SNP位点、终末指标、基因型测序方法、研究所在地区。

1.5 统计学处理 Stata 14.0处理数据,对包含的研究应用χ2检验进行异质性评价,只有当I2值低于50%且P>0.05,采用固定效应模型。对于生存资料,以HR值(对于文献中同时存在CrudeHR和AjustedHR情况,选择AdjustedHR)及95%CI作为效应量对各个纳入的文献结果进行合并,P<0.05为差异有统计学意义,绘制森林图,并绘制漏斗图检测发表偏倚(Egger检验结果,P<0.1认为存在发表偏倚),最后进行敏感性分析。

2 结果

2.1 文献检索与筛选结果 共检索到239篇胃癌与ERCC-2基因多态性相关的文献。根据上述的文献质量评价原则及被研究文献的纳入和排除标准,最终11篇研究纳入meta分析,共计3282例经病理确诊的胃癌患者,研究的年限区间为2008—2016年。具体见表1。

表1 纳入文献基本情况

*AGC advanced gastri cancer;OS Overall survival;HR Hazard ratio

2.3 ERCC-2基因单核苷酸多态性与胃癌患者预后相关的meta分析结果

2.3.1 rs13181单核苷酸多态性与胃癌患者预后相关的meta分析 结果显示,rs13181单核苷酸多态性与胃癌患者预后无明显相关性,森林图结果显示,GT/TT(HR=0.94,95%CI=0.80~1.10,P=0.408)(图1),GG/TT(HR=0.97,95%CI=0.75~1.25,P=0.820)(图2);发表偏倚的数字化结果见图3、4,Egger检验结果提示,GT基因型vs. TT基因型P=0.179;GG基因型vs. TT基因型P=0.746(均P>0.1),结合图示及数字化结果,没有明显发表偏倚;为分析单项研究对总的合并结果的影响力,应用Stata软件绘制的敏感性分析图显示,剔除单项研究后结果没有明显变化(图5和图6)。

图1 GT基因型 vs. TT基因型森林图

图2 GG基因型 vs. TT基因型森林图

图3 GT基因型 vs. TT基因型漏斗图

图4 GG基因型 vs. TT基因型漏斗图

图5 GT基因型 vs. TT基因型敏感性分析

图6 GG基因型 vs. TT基因型敏感性分析

2.3.2 rs1799793单核苷酸多态性与胃癌患者预后相关的meta分析 结果显示,对于rs1799793位点, 森林图结果显示GA/GG(HR=1.09,95%CI=0.93~1.27,P=0.280)(图7),AA/GG(HR=1.58,95%CI=1.20~2.08,P=0.001)(图8);发表偏倚的数字化结果见图9、10。Egger检验结果提示,GA基因型vs. GG基因型P=0.200;AA基因型vs. GG基因型P=0.751(P均>0.1),结合图示及数字化结果,没有明显发表偏倚;为分析单项研究对总的合并结果的影响力,应用Stata软件绘制的敏感性分析图显示,剔除单项研究后结果没有明显变化,结论可靠(见图11、12)。

图7 GA基因型vs. GG基因型森林图

图8 AA基因型 vs. GG基因型森林图

图9 GA基因型 vs. GG 基因型漏斗图

图10 AA基因型vs. GG基因型漏斗图

图11 GA基因型 vs. GG基因型敏感性分析

图12 AA基因型 vs. GG基因型敏感性分析

3 讨论

胃癌的全球发病率位于第五位,死亡率位居第三位[1]。切除修复交联互补基因2(ERCC2/XPD)是一种进化保守的DNA解旋酶基因,研究发现该基因与多种人类恶性肿瘤的发病风险相关[15-16],尤其是该基因多态性与胃癌发病的关联,在研究中已经得到证实[17]。rs13181和rs1799793位点是目前研究较多的位点,rs13181位点,属于A/G/T三等位基因突变,其中G/T突变较为常见,而A突变报道较少,MAF(G)=0.2366;rs1799793位点,属于A/G/T三等位基因突变,其中G/A突变较为常见,而T突变报道较少,MAF(A)=0.1945。近年来有研究开始着重于胃癌患者ERCC-2基因多态性与预后相关的研究,但是学者们的研究结果存在争议,例如Ding等[18]认为ERCC-2基因rs1799793位点单核苷酸多态性与胃癌患者生存期有关,Mo等[8]却认为他们无明显相关性。

对于预后的相关研究合并,由于多数研究采用的是单基因型的对比,为了尽可能地避免选择偏倚,本次meta分析选择对单基因型的生存资料进行合并。结果显示,所有的合并结果异质性均低于50%且P值均大于0.05,因此选用固定效应模型进行比较。对于rs13181位点而言,其突变型杂合子及纯合子相对于野生型均没有显示出预后方面的明显差异;对于rs1799793位点,其突变型纯合子相对于野生型纯合子预后存在显著统计学差异(P=0.001),为考察结果的稳定性,应用STATA软件绘制敏感性分析图,如图12结果显示:排除Li 2013这篇权重较大的研究后对结果有较大的影响,但差异仍具有统计学意义,结论可靠;另一方面其突变杂合子相对于野生型却没有显示出明显的统计学差异。笔者认为这是一个有意义的发现,对于以后有意向研究ERCC-2基因多态性与胃癌患者预后相关性的学者而言可以是一个参考;而且,对于胃癌患者预后评估,风险性因子的筛查也可以提供帮助,ERCC-2基因rs1799793位点的突变检测或可成为胃癌患者的预后评估及风险因子筛查的新途径。

一篇发表于Tumor Biology上的meta分析[19],作者从胃癌患者ERCC-2单核苷酸多态性与含奥沙利铂化疗疗效及预后的关联性着手进行整合,进而得出rs13181位点单核苷酸多态性与预后无关的结论,但该篇meta分析的纳入研究数量较少,结论的获取可能不太可靠。本次研究纳入文献均为英文文献,影响资料的全面性,部分合并结果显示出不容忽视的异质性等,希望更多的学者提供更大样本量、多区域的研究,用以进一步明确其相关性。

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