类成龙,姜玥璐,周 进,劳永民,何永红,蔡中华
(1:清华大学生命学院,北京 100084)(2:清华大学深圳研究生院,深圳 518055)
基于矩阵模型进行抗荧光干扰的蓝藻原位检测方法
类成龙1,2,姜玥璐2,周 进2,劳永民2,何永红2,蔡中华2
(1:清华大学生命学院,北京 100084)(2:清华大学深圳研究生院,深圳 518055)
藻蓝蛋白与叶绿素a作为特征色素常用于表征蓝藻的生物量. 藻蓝蛋白与叶绿素a通常用荧光光谱或原位荧光强度检测,但是在实际水体中藻蓝蛋白与叶绿素a的荧光效应相互干扰会影响测量精度,极大限制了该方法的应用. 本文根据朗伯比尔定律,利用二阶矩阵模型设计了一套在荧光检测过程中“激发光-发射光”优化抗干扰的波长选择方法,并利用多元线性回归分析建立了两种色素浓度与荧光强度之间的多元校正线性模型,实验验证了所筛选蓝藻荧光分析法中特定激发光和发射光波长的有效性. 本研究实现了两种色素检测过程中的成功解耦,可在藻蓝蛋白的原位检测中排除水体中藻蓝蛋白与叶绿素a之间的相互干扰,提高藻蓝蛋白和叶绿素a的原位检测精度,为开发便携式蓝藻检测传感器时的波长选择提供理论基础.
藻蓝蛋白;叶绿素a;荧光检测;解耦;抗荧光干扰
中国是世界上蓝藻水华暴发最严重、分布最广泛且蓝藻种类最多的国家之一[1],太湖、滇池、巢湖等内陆湖泊均已成为我国蓝藻水华暴发的高频地区[2]. 蓝藻水华的暴发会引起水体缺氧而导致水生动植物大量死亡,破坏水体生态系统[3-4];其分泌的藻毒素进入水体后,通过食物链、食物网或者饮用水进入人体,对公众健康造成极大的威胁[5-6];藻类大量繁殖影响水质以及水厂的运行,造成供水危机[7];水华消亡时还会散发恶臭气味,影响周边的环境[8]. 因此,对蓝藻水华的预报、预警以及控制是水生生态环境治理的关键环节,对蓝藻生物量的原位检测是蓝藻水华治理过程的核心,是水华预报与预警的基础[9].
目前针对蓝藻生物量的检测主要有以下几种方法:群落计数法[10]、吸光光度法[11-12]、多光谱遥感技术[13]、荧光检测法[14-17]、流式细胞法[18]以及液相色谱法[19]等. 这些方法给日常监测与科学研究带来便利的同时,也均存在不足,主要体现在精度、准确性、时效性以及人耗/时耗等方面,尤其在原位监测上,更是存在瓶颈[20]. 蓝藻生物量的荧光检测法因其简便性、灵敏度高、可原位检测等特点而被广泛使用,其中多以藻蓝蛋白作为特征色素,利用二维荧光光谱法进行检测[21]. 目前用荧光检测法检测蓝藻生物量的大多数研究皆是在藻蓝蛋白的激发光谱与发射光谱中选择激发光与发射光波长(多选择激发光谱与发射光谱的峰值波长),并建立藻蓝蛋白浓度与荧光强度的线性关系[15,17,22-27]. 这些研究方法在单一色素的检测中表现出很高的精确度,而在实际水体中,因藻蓝蛋白与叶绿素a荧光效应的相互干扰而影响测量精度,从而难以将蓝藻与其他真核藻类进行有效区分,极大限制了该方法的原位应用.
本文以简单易行的荧光分析法为基础,运用二阶矩阵模型,建立了一种以减少两种色素相互干扰为目标的特定波长筛选方法,再结合多元线性回归分析对藻蓝蛋白、叶绿素a、混合藻类的检测实验进行验证. 验证结果表明,本文方法可抑制藻蓝蛋白与叶绿素a的相互耦合,避免其他真核藻类对蓝藻检测的干扰,使藻蓝蛋白的检测达到抗荧光干扰的效果,从而实现蓝藻生物量的精确检测.
1.1 材料与仪器
叶绿素a与藻蓝蛋白的标准品均为Sigma标准试剂(藻蓝蛋白标准品:Sigma-52468;叶绿素a标准品:Sigma-C5753),所用溶剂为15%的乙醇PBS溶液(由PBS溶液中加入150 ml乙醇后定容至1 L而得,且在此溶剂中,叶绿素a与藻蓝蛋白可以实现较大范围浓度比的混合);藻类培养使用BG-11培养基;藻类计数采用血球计数板;实验中所用的仪器为荧光分光光度计(TECON-INFINITE-M200PRO,奥地利),仪器参数为:Read: Number of flashes, 25; Read-Settle time, 0 ms; Mode: Top; Z-position: Manual, 20000 μm; Gain: Manual, 110;Integration: time, 20 μs;实验中所用的藻类包括铜绿微囊藻(Microcystisaeruginosa)(蓝藻)和小球藻(Chlorellavulgaris,FACHB-8)(绿藻),均来自中国科学院水生生物研究所淡水藻种库(FACHB).
1.2 波长筛选方法的建立
蓝藻生物量的荧光检测法基于朗伯比尔定律[25],以藻蓝蛋白为特征色素建立其浓度与荧光强度的关系. 强度为I0的入射光平行照射到厚度为l、浓度为c的溶液表面,当蓝藻溶液极稀(满足K·l·c≤0.05)时[14],荧光发射光强If为:
If=2.3η·I0·K·l·c
(1)
式中,η为物质的荧光系数,K为物质的摩尔吸收系数.
在混合色素的荧光检测过程中,不耦合检测是指检测过程中两种色素产生的荧光互不干扰. 而用荧光分析法检测藻蓝蛋白与叶绿素a时,两者存在很强的耦合效应. 结合多元线性回归分析以及荧光光谱的叠加效应[28],可建立多元线性荧光检测模型:
u1=h11·C1+h12·C2+b1u2=h21·C1+h22·C2+b2
(2)
式中,u1和u2分别为叶绿素a和藻蓝蛋白的浓度;hij为线性系数;C1和C2分别为叶绿素a和藻蓝蛋白检测方法下的相对荧光强度值;b1和b2分别为叶绿素a和藻蓝蛋白检测模型公式中的常数项,即为朗伯比尔定律中提出线性项后的残余项,也是仪器与环境噪声的反映项.
定义荧光系数矩阵(H)为:
(3)
由上,特定波长的不同组合会导致荧光系数矩阵中的元素不同,H阵也代表了不同色素之间的干扰程度. 基于以上原理,可以结合矩阵中向量相关性原理寻找两种色素相互干扰最小时的条件.
将(2)式转换为:
(4)
定义检测矩阵(A)为:
(5)
在不耦合双色素系统的检测中,荧光强度与色素浓度关系的模型应为:
(6)
也即A阵应为对角阵. 因而对于不同的方法组合,需要寻找一种方法使得检测矩阵最接近于对角阵,也即使得A阵的两个行向量相关性最差.
定义检测解耦参数(S)为:
(7)
则由向量相关性理论可推导,S值越大,则矩阵中两个行向量相关性越小. 因此S值可表示荧光检测叶绿素a与藻蓝蛋白时两者荧光光谱实现分离的程度,也即分离程度越大,两者的相互干扰越小.
通过对激发波长与发射波长的不同组合,得到一系列A矩阵,找到S值最大时所对应的A矩阵,此时的方法组合即为最优的激发光波长与发射光波长. 而后根据多元线性回归分析建立荧光强度与两种色素浓度的关系,即为检测藻蓝蛋白与叶绿素a混合色素的模型.
具体激发光波长与发射光波长筛选流程如图1 所示. 其中,C1、C2分别为预选的检测叶绿素a的激发光波长范围与发射光范围;P1、P2分别为预选的检测藻蓝蛋白的激发光波长范围与发射光范围;Ni为特定波长组合的方法i. 所有数据处理在Matlab软件(Matlab-R2012a)中完成,实现S值的筛选.
图1 波长筛选方法Fig.1 Method of wavelength selection
1.3 验证实验
在验证实验中,对以下3种方法做对比:
本文研究方法(M1):是指以本研究所筛选出的激发光波长与发射光波长进行检测,结合多元线性回归分析建立检测模型;
最强波长模型(M2):是指以色素荧光光谱中的峰值波长进行检测,建立模型方法同M1[28];
标准曲线法(M3):是指波长选择同M2,用单一色素的标准曲线法建立模型[17,22-23].
1.3.1 色素检测 将两种色素配制不同浓度梯度的混合溶液,且保持每份溶液中叶绿素a与藻蓝蛋白浓度比CChl.a∶CPC=1∶1. 保持其他实验条件与前述相同,用M1、M2、M3 3种方法分别检测相应的荧光强度,同样的浓度取3个样本,同样的样本连续测3次.
1.3.2 藻类的检测 本文用混合培养对数生长期的铜绿微囊藻与小球藻进行实验,以藻蓝蛋白作为特征色素检测铜绿微囊藻细胞浓度(cells/ml)与藻蓝蛋白荧光强度的关系. 通过对单一铜绿微囊藻的个数与藻蓝蛋白浓度的线性关系,建立蓝藻细胞浓度的检测模型. 藻液的培养条件为:300 ml培养瓶,藻液容积为200 ml;温度为25±1℃;光照时间L∶D=12 h∶12 h,光照强度为3300±200 lx;每天摇晃1次,并随机交换位置以保证每个培养瓶均接受到相同的光照;培养周期为15 d. 每天用M1、M2、M3 3种方法检测混合藻液中藻蓝蛋白的荧光强度,并计算蓝藻的细胞浓度. 蓝藻浓度标准值测量依据国家标准《水和废水监测分析方法》中的群落计数法,在显微镜下检测[10].
1.3.3 结果指标比较 在对色素标准品与活体藻类检测中,用3个指标对结果进行评估:准确率(或者误差)、精密度和回收率. 准确率的计算公式为:
(1)
误差(e)= 1-准确率
(2)
式中,检测值为检测结果;真值在色素检测实验中为色素配比时的标准浓度值,在活体藻类检测中则指显微计数法所获得的浓度值.
标准差表征多次检测值的可重复性,也即为检测结果的稳定性;其值越小,表示精密度越高. 在本文实验中,精密度为同一浓度样品6次测量结果的标准差.
回收率用来表征检测方法的准确度高低,其计算公式为:
(3)
式中,加标量为加标前浓度的20%且在检测范围内.
2.1 叶绿素a与藻蓝蛋白的荧光光谱特征
激发光谱中(选取叶绿素a的发射波长为680 nm,藻蓝蛋白的发射波长为648 nm),叶绿素a的峰值出现在436 nm,而且从500 nm到630 nm逐渐升高,藻蓝蛋白的峰值出现在626 nm,虚线框内两者具有很强的重叠耦合(图2a);发射光谱中(选取叶绿素a的激发波长为436 nm,藻蓝蛋白的激发波长为626 nm),叶绿素a的峰值出现在680 nm,藻蓝蛋白的峰值出现在648 nm,虚线框内两者具有很强的重叠耦合(图2b). 当蓝藻水华暴发时,水体中含有大量这两种色素,彼此间的耦合则产生较强的荧光干扰.
当CChl.a>500 μg/L时,叶绿素a的荧光强度与浓度不呈显著的线性关系;当CPC>2000 μg/L时,藻蓝蛋白的荧光强度与浓度也不呈显著的线性关系(图2c). 从曲线形状看两者更接近于幂函数曲线,这与将朗伯比尔定律进行泰勒级数分解后的结果一致:此时不满足条件K·l·c≤0.05,则呈现一种幂函数关系[14]. 但此高浓度在实际水体检测中不常见,因此本文只研究浓度在线性范围内的部分. 因而,叶绿素a的荧光线性浓度范围上限为500 μg/L. 藻蓝蛋白的荧光线性浓度范围上限为2000 μg/L. 将图2c中浓度范围为0.03~500 μg/L的部分放大至图2d,可知当CChl.a>0.10 μg/L或者CPC>0.20 μg/L时,色素荧光强度与浓度呈现出很强的线性关系. 其中叶绿素a的相关系数R2达0.9944,藻蓝蛋白的相关系数R2达0.9942. 浓度低于这个范围时,检测已经无区分度. 因此,本文所研究的叶绿素a和藻蓝蛋白的荧光线性浓度范围分别为0.10~500 μg/L和0.20~2000 μg/L. 藻蓝蛋白的线性浓度范围更广,适合在高浓度下检测,满足水华暴发时的测量需求;而叶绿素a的检测限较低,灵敏度高,但是检测范围相比藻蓝蛋白小.
图2 叶绿素a与藻蓝蛋白的荧光光谱性质(叶绿素a与藻蓝蛋白的激发光谱(a);叶绿素a与藻蓝蛋白的发射光谱(b);叶绿素a与藻蓝蛋白的荧光强度-浓度相关关系曲线(c);叶绿素a与藻蓝蛋白在低浓度下的荧光强度-浓度相关关系曲线(d))Fig.2 Excitation spectrum and emission spectrum of chlorophyll-a and phycocyanin
2.2 叶绿素a与藻蓝蛋白干扰程度最小波长的筛选
按照第1节中的方法收集叶绿素a与藻蓝蛋白的荧光光谱数据,在Matlab软件(Matlab-R2012a)中运行本文提出的波长筛选方法模型,最终得出可最大程度上减弱两种色素之间荧光干扰的波长组合:叶绿素a和藻蓝蛋白的激发波长分别为440和600 nm,发射波长分别为688和640 nm.
2.3 叶绿素a与藻蓝蛋白的浓度检测
在叶绿素a与藻蓝蛋白混合色素溶液的检测中(图3),本文研究方法M1得到叶绿素a和藻蓝蛋白的灵敏度分别为0.06 和0.1 μg/L,相比于方法M2与M3的结果具有一定提高. 3种方法的检测上限并无明显差异,与图2c所显示的一致,叶绿素a检测上限为500 μg/L,藻蓝蛋白检测上限为2000 μg/L. M1方法中曲线线性程度最好,相关系数R2分别达到0.9948与0.9936,比M2方法和目前研究中常用的M3方法有显著提高. 这说明本文研究方法能够有效提高混合色素中叶绿素a与藻蓝蛋白检测的灵敏度与检测稳定性,提高检测精度.
而无论是检测叶绿素a还是藻蓝蛋白,相同的色素浓度在3种方法检测下,荧光强度呈现的规律均为:M1 图3 叶绿素a(a)和藻蓝蛋白(b)在3种方法检测下的线性拟合结果 Fig.3 Linear correlation of chlorophyll-a (a) and phycocyanin (b) in fluorescence detection with the three methods 取1、10和100 μg/L 3种浓度的混合色素(保持每份溶液中CChl.a∶CPC=1∶1),用1.3.1节中的描述方法进行检测(图4). 比较M1与M2方法的结果(图4a),可发现在两种色素的线性浓度范围内,M1所得到的结果优于M2,说明不同特定波长的选择对藻蓝蛋白与叶绿素a的检测精度产生影响,而不是单一色素检测下荧光强度越强越好. M2方法劣于M1,一方面是因为选择光谱中最强的峰值波长而未考虑两种色素之间的耦合影响;另一方面则是因为荧光强度大,放大了因荧光不稳定所带来的误差效应. 比较M2与M3方法的结果,发现M2方法明显优于M3方法,说明多元校正线性模型对于提高两种色素的检测精确度同样具有很大影响. 直观从检测结果来看,本文研究方法通过筛选荧光检测中的激发光波长与发射光波长,能显著提高蓝藻检测精度. 相比于目前普遍使用的M3方法,对波长进行筛选并建立多元线性回归模型具有显著优势(One-way ANOVA,F>Fcrit,P-value<0.05). 对3种检测方法下的结果进行定量分析,比较准确率、精密度与回收率3个指标(皆为平均值)(图4b),发现M1方法检测叶绿素a与藻蓝蛋白的准确率分别为90.4%和92.0%,相比于M2和M3方法分别高出2.0%~20.0%和4.3%~20.0%,具有明显的优势;从精密度来看,M1方法的平均标准差最小,表征精密度最高,说明本研究方法的精密度与重复性更好,避开最强波长的荧光,在一定程度上可以减弱荧光不稳定性所带来的误差,实现了两种色素抗干扰性最强,提高了检测结果的精密度;从回收率来看,M1方法的准确性最高,更加验证了本研究结果在检测效果上的优势. 综合上述参数的比较,本研究方法能提高混合色素检测的准确率,有效减弱两种色素间的耦合作用,并具有较好的稳定性. 图4 3种方法下叶绿素a与藻蓝蛋白不同混合浓度的检测结果:3种方法与标准浓度的比较(a);3种方法检测指标的比较(b)Fig.4 Detecting the concentration of chlorophyll-a and phycocyanin mixed with the three methods 2.4 蓝藻与真核藻类混合浓度的检测 藻蓝蛋白作为蓝藻的特征色素,其浓度与蓝藻数量呈现高度的相关性[26]. 在BG-11培养基中进行铜绿微囊藻与小球藻的混合培养,通过上述3种验证方法对对数生长期内藻蓝蛋白的荧光强度与蓝藻细胞浓度进行线性回归分析. 3种方法中,M1方法下线性回归方程为:y=0.94x-0.29,R2=0.9994,其斜率最接近于1,且相关系数最大(图5a). M2方法的检测结果与M1较为接近,但依然不如M1检测效果好,且M1与另外两种方法的检测结果具有显著性差异(One-way ANOVA,F>Fcrit,P-value<0.05),从图5b可直观看出3种方法检测效果的差异. 以显微计数值作为模拟值计算Nash-Sutcliffe效率系数为0.94,相比于陈纬栋等[25]的0.78以及Gregor等[29]的1.12具有较大改进;相关系数高于杨飞等[17]的研究,检测结果更加稳定; 准确率方面比Lee等[15]的80%~90%也有较大提高. 图5 混合藻类在3种方法检测下的结果(e-M1、e-M2、e-M3分别为M1、M2、M3方法的检测误差)Fig.5 Detecting results of Microcystis aeruginosa and Chlorella vulgaris mixing solution with the three methods 比较图5与图4发现,在实际检测活体藻类的过程中,准确率相比于色素的混合检测略有下降. 其主要是因为对游离的藻蓝蛋白的测定与细胞中原始状态不同,不同种类蓝藻、同种蓝藻的不同细胞内光合色素系统的结构差异以及相同细胞在不同生长环境与不同阶段中的差异也会对荧光结果产生影响[15]. 本研究将蓝藻光合系统中色素之间复杂的相互作用共同看作一个“黑匣子”,将其内部的差异看作系统误差来处理,活体藻类色素系统的光合效应与标准色素相似,从而可以看出本文研究方法在提高检测效果方面的优势. 尽管本文研究方法的结果与混合藻类中蓝藻浓度的标准结果仍然呈现较好的相关关系,但对其内部光合色素系统的研究可为进一步提高蓝藻的检测精度提供很好的研究方向. 在混合藻类的培养过程中,3种方法的检测误差随着时间增加呈现下降趋势. 本文推测其原因为:在BG-11“富营养”水平下,培养的开始阶段,两种藻类的生长相互干扰较小,环境提供足够的生长繁殖条件,蓝藻与绿藻都呈“J”型曲线增长,且数量相当,这与本文显微镜计数结果一致. 此时CChl.a∶CPC较高,叶绿素a与藻蓝蛋白之间的荧光干扰较大,从而导致总体检测误差大. 此阶段中,M1的误差明显比另外两种方法小,本文研究方法的优势明显. 到了培养后期,因环境中营养减少,藻类生长受限,但蓝藻的竞争能力强[30],使得蓝藻浓度高于绿藻浓度,CChl.a∶CPC降低,叶绿素a对藻蓝蛋白的荧光干扰降低,从而导致总体检测误差变小. 总体而言,M1的误差依然最小. 活体藻类的实验证明,本文的研究方法能够显著提高混合藻类中蓝藻浓度的检测精确度,本研究结果同样适用于实际水体,且在蓝藻占比越小时,本研究方法越具优势. 1)使用本文所提出的二阶矩阵模型进行蓝藻检测过程中激发光波长与发射光波长的筛选,可找出藻蓝蛋白受叶绿素a干扰最小的波长组合. 所筛选的“激发光-发射光”最优抗干扰波长组合结果为:叶绿素a和藻蓝蛋白的激发波长分别为440和600 nm,发射波长分别为688和640 nm. 2)对两种色素以及活体藻液的实验验证结果表明:使用本研究的波长筛选方法,结合多元线性回归分析,能够克服目前蓝藻检测研究中存在的波长选择问题,抑制两种色素之间的耦合干扰,提高检测的精准度,实现蓝藻生物量的抗荧光干扰原位检测. 3)本文研究方法在混合藻液中蓝藻占比越小时,抑制干扰提高检测精度的优势越明显. 4)本研究为混合色素荧光检测提供了一种筛选抗干扰激发光波长与发射光波长的科学方法,为藻蓝蛋白荧光检测传感器的研制提供了理论基础,并具有业务化的潜力. 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Anti-interferancein-situdetection of cyanobacteria based on matrix model LEI Chenglong1,2, JIANG Yuelu2, ZHOU Jin2, LAO Yongmin2, HE Yonghong2& CAI Zhonghua2** (1:SchoolofLifeScience,TsinghuaUniversity,Beijing100084,P.R.China)(2:GraduateSchoolatShenzhen,TsinghuaUniversity,Shenzhen518055,P.R.China) Phycocyanin and chlorophyll-a are characterizations of cyanobacterial biomass. These two pigments are detectedinsituwith fluorescence spectrum method or fluorescence intensity. However, due to the fluorescence interference between phycocyanin and chlorophyll-a, the accuracy ofin-situdetection of cyanobacteria is relatively low, which limited the application of this method. In this study, we developed a novel method of fluorescence analysis based on a two-order matrix model and a multivariate calibration linear model for the correlation between the fluorescence intensity and pigment concentration, which was verified by experiment. The established method decoupled the two mixed pigments as well as quantitatively analyzed the wavelength selection of excitation and emission and largely eliminated the fluorescence interference between phycocyanin and chlorophyll-a, and therefore, significantly improved the accuracy ofin-situdetection of cyanobacteria. More importantly, our study can provide theoretical basis for the cyanobacteria detection sensor in how to select wavelengths. Phycocyanin; chlorophyll-a; fluorescence detection; decoupling; anti-interference ; E-mail: caizh@sz.tsinghua.edu.cn. DOI 10.18307/2017.0525 广东省海洋与渔业厅科技攻关与研发项目(A201503D07)和深圳市科技创新委计划项目(JCYJ20160608165926763,JCYJ20151117173236192,CXZZ20150529165045063)联合资助. 2017-04-08收稿; 2017-05-17收修改稿. 类成龙(1992~),男,硕士研究生; E-mail: chenglongl@139.com.3 结论