非小细胞肺癌血清中lncRNA HOTAIR的表达及临床意义

2017-09-05 01:50谭楠李莉红白璐赵昆
中国肺癌杂志 2017年6期
关键词:引物病理肺癌

谭楠 李莉红 白璐 赵昆

肺癌是起源于支气管粘膜或腺体的恶性肿瘤,是发病率和死亡率增长最快、对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一,根据统计肺癌的年发病人数及年死亡人数均居全球肿瘤首位[1]。肺癌的发病机制尚未完全明确,可能与吸烟、职业、环境接触、电离辐射、既往肺部慢性感染、遗传及大气污染等因素有关,肺癌的早期症状不明显,甚至可无任何不适,因此研究肺癌的发病机制及早期诊断对肺癌的治疗及预后至关重要。长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的RNA分子,它们并不编码蛋白,而是在表观遗传、转录以及转录后等多种层面上调控基因的表达水平[2,3],研究证实lncRNA广泛参与了细胞增殖、分化及凋亡等过程,在多种疾病病理过程中发挥重要作用[4],与肿瘤的发病、转移、预后及治疗密切相关[5,6]。HOX转录反义RNA(HOX transcript antisense RNA, HOTAIR)是一种新近发现具有反式转录调控作用的lncRNA[7],国内外研究[8-12]发现HOTAIR在肺癌组织中高表达,且与肺癌的临床分期、淋巴结转移及预后有关。为了进一步研究HOTAIR在肺癌诊断及预后中的作用,本实验采用实时定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者血清中HOTAIR水平,并分析其与临床病理参数之间的关系。

1 资料与方法

1.1 病例资料 选取西安市第一医院2016年1月-2016年11月期间经过组织病理确诊的NSCLC患者64例,其中男性38例,女性26例,年龄32岁-75岁,平均(56.4±10.7)岁,组织病理类型为鳞癌23例、腺癌39例、大细胞癌2例,分期采用2009年国际抗癌联盟(Union for International Cancer Control, UICC)(第7版)肺癌肿瘤-淋巴结-转移(tumor-node-metastasis, TNM)分期标准进行:I期15例,II期20例,III期26例,IV期3例。64例健康体检者作为正常对照组,其中男性40例,女性24例,年龄26岁-71岁,平均(53.4±9.6)岁,本研究经过医院伦理委员会批准并征得所有研究对象的知情同意。

1.2 样本采集 所有患者均在进行手术、化疗或放疗前进行采样,空腹无菌采取静脉血5.0 mL,放置30 min后1,200 g离心10 min,吸取上清至离心管中,4oC 12,000 g再离心10 min后分离上清至新的离心管中,取250 μL血清加入750 μL TRIzol® LS试剂后-80oC保存待用。

1.3 总RNA提取及cDNA第一链合成 参照文献[13]严格按照TRIzol® LS试剂(美国Invitrogen公司)说明书进行血清总RNA提取,提取的RNA溶于DEPC处理的水中。采用逆转录试剂盒(美国Thermo Scientific公司)进行cDNA第一链合成,具体如下:3 μg总RNA、5 μg/μL Oligo(dT)1 μL温和混合后70oC孵育5 min,冰上冷却,短暂离心收集上清;依次加入5×反应缓冲液4 μL、20 U/μL RNase抑制剂1 μL及10 mmol/L dNTP 2 μL 37oC温和混合后孵育5 min;加入200 U/μL M-MuLV逆转录酶1 μL,42oC 60 min、70oC 10 min,冰上冷却终止反应;合成的cDNA第一链在-20oC保存待用。

1.4 实时定量PCR检测 根据Genebank中HOTAIR及内参GAPDH的序列,利用Primer 5.0软件设计引物,具体序列如下:HOTAIR上游引物5'-GGCAGCACAGAGCAACTCTA-3',下游引物5'-GCAGGGTCCCACTGCATAAT-3',扩增产物大小125 bp;GAPDH上游引物5'-ACTAGGCGCTCACTGTTCTCT-3',下游引物5'-GヰGACTCCGACCヰCACCT-3',扩增产物大小83 bp,由上海生工生物技术科技有限公司合成引物。利用SYBR® Premix Ex TaqTMII(大连宝生物工程有限公司)进行PCR扩增,20 μL反应体系包括10 μL SYBR® Premix Ex TaqTM II(2×)、模板3.0 μL、上下游引物(10 μM)各1.0 μL、ddH2O 5.0 μL,PCR反应条件:95oC预变性30 s,95oC 10 s、60oC 30 s共35个循环。扩增结束后得到Ct值,采用2-△△Ct法计算血清中HOTAIR的表达水平。

1.5 统计学方法 所有数据均采用SPSS 16.0进行统计学处理,计量资料采用均数±标准差(Mean±SD)表示,组间比较采用t检验,以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 HOTAIR在NSCLC患者血清中的水平 实时定量PCR检测结果发现NSCLC患者血清中HOTAIR水平为(2.85±1.16),明显高于正常对照组(1.74±0.69),两组之间差异具有统计学意义(t=6.566, P<0.01)。

2.2 NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数之间的关系 为了进一步研究HOTAIR在NSCLC发生、发展中的作用,本研究统计分析了肺癌血清中HOTAIR水平与临床病理参数之间的关系,结果发现血清中HOTAIR水平与患者性别、年龄、吸烟、分化程度及病理类型均无明显相关(P>0.05)。而肿瘤大小>3 cm的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于肿瘤大小≤3 cm患者,III期+IV期肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于I期+II期患者,有淋巴转移的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于无淋巴转移的患者,差异均具有统计学意义(P<0.05),结果见表1。

3 讨论

非编码RNA(non-coding RNA)是指不编码蛋白质的RNA,其中包括rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA、microRNA、lncRNA及circRNA。由于lncRNA不编码蛋白质,最初被认为是基因组转录的“噪音”,不具有生物学功能。但随着RNA测序、芯片等分子生物学技术和生物信息学的不断发展,越来越多的研究[4-6]证实lncRNA具有复杂的生物学功能,在多个层面上参与细胞分化和个体发育调控,并与多种疾病尤其是恶性肿瘤的发生发展密切相关。国内外学者研究[14-16]发现MALAT1、ANRIL、H19、MEG3、GAS5及CCAT2等多种lncRNAs在肺癌中异常表达,与肺癌的发病、诊断、治疗及预后密切相关。HOTAIR是Rinn等[7]发现的第一个具有反式转录调控作用的lncRNA,人HOTAIR基因定位于12q13区域,基因(RefSeq NR_003716)全长2,364 bp,由1个长外显子和5个短外显子组成,HOTAIR主要是通过5'结构域和3'结构域募集复杂蛋白复合体来调控靶基因的表达。多项研究发现HOTAIR不仅在乳腺癌、食管癌、胃癌、肝癌、结肠癌、肾癌、宫颈癌、卵巢癌、胰腺癌、肺癌等实体瘤中高表达[17,18],而且在淋巴瘤、急性白血病等血液系统恶性肿瘤中也高表达[19,20]。国内外学者[8-12,21]研究发现NSCLC患者肿瘤组织中的HOTAIR的表达水平明显高于正常肺组织,细胞实验证实过表达HOTAIR可以显著促进A549细胞的迁移和侵袭,且与顺铂化疗耐药有关。由于lncRNA具有疾病特异性和组织特异性、稳定性高等特点,在心血管疾病、肿瘤患者外周循环中可以检测到lncRNA,有可能成为疾病诊断、预后的标志物[22,23]。本研究采用实时定量PCR检测NSCLC患者血清中HOTAIR的水平,结果发现NSCLC患者血清中HOTAIR水平明显高于正常对照组(P<0.01),这与国内外学者在肺癌组织中的研究结果一致[8-12],提示HOTAIR在NSCLC病理过程中发挥了重要作用。

表 1 NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数的关系Tab 1 The relationships between the serum levels of HOTAIR and clinical pathological parameters in the patients with NSCLC

本研究进一步分析了NSCLC患者血清中HOTAIR水平与临床病理参数之间的关系,结果发现肿瘤大小>3 cm的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于肿瘤大小≤3 cm患者,III期+IV期肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于I期+II期患者,提示HOTAIR与TNM分期及肿瘤负荷有关,与国内外学者研究结果[8-12]一致,本研究还发现I期+II期患者血清中HOTAIR水平仍然明显高于正常对照组(P<0.01),随着研究的不断深入HOTAIR有可能成为肺癌的早期诊断指标之一。同时研究结果还发现有淋巴转移的肺癌患者血清中HOTAIR水平明显高于无淋巴转移的患者,有研究表明过表达HOTAIR可以显著促进肺癌细胞A549的迁移和侵袭[11,24],提示HOTAIR参与了肺癌的侵袭及转移过程。本研究结果显示肺癌患者血清中HOTAIR水平与患者性别、年龄、吸烟、分化程度及病理类型均无明显相关,但张泽雨[10]等发现NSCLC患者肿瘤组织中HOTAIR的水平与肿瘤的分化程度明显相关,这可能与病例的选择有关,有待于扩大样本量进行进一步研究。

综上所述,本研究发现NSCLC患者血清中HOTAIR水平升高,且与肿瘤大小、TNM分期及淋巴转移有关,提示HOTAIR与肺癌的发生发展及转移有关,但其具体作用机制尚不明确。由于肺癌的临床表现比较复杂,早期症状不明显,甚至可无任何不适,因此肺癌的早期诊断尤为重要,随着对HOTAIR研究的不断深入,可能为肺癌的早期诊断及治疗提供新的靶点。

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