64位博士组团盯上基因数据分析,能让癌症变得可控吗

2016-11-26 01:06王鹏
就业与保障 2016年3期
关键词:癌症测序精准

王鹏

64位博士组团盯上基因数据分析,能让癌症变得可控吗

王鹏

2月3日,已临近新年,余伟师还在公司忙得不可开交。下午5点,见完投资人,他又匆匆赶回微软创投加速器工作。目前,他和他的创始团队10多名成员都在这里办公。赛福基因是入驻微软创投加速器的第7期项目之一。这份机会也来之不易,1400份申请,最后只有20个项目成功入围。

当然,历经半年,他们不得不从这里搬走,一是因为他们将从微软创投加速器“毕业”,新的项目将入驻,二是因为公司的核心团队将陆续回国,他们需要更大的“战场”。

创客ABC

A.他们是谁?

这是一支跨专业有机整合了64位海外华人博士的技术团队,创始人兼CEO余伟师曾是美国国立卫生研究院科学家,技术总监刘湘涛是耶鲁大学应用数学博士,市场负责人贾洪涛是俄亥俄州立大学生物医学博士,运营负责人梁萌萌是南加州大学病理生物学博士。

B.他们在做什么?

打造一个基因数据智能分析平台,为医生、患者提供精准的疾病分类和诊疗建议,将癌症转为可控慢性病,为亚健康人群提供个性化健康管理措施。

C.融资状况?

已完成天使轮融资,但尚未对外披露具体投资方和投资金额。

曾因“知识无用武之地”而深感寂寞

中国近年来癌症及患病人群剧增,“我们国家每5分钟有21人因为癌症死亡,每5分钟有35人被诊断为癌症,我们肩上的责任还很重。”余伟师说。

十年前,还在读硕士的余伟师就已经开始研究基因与疾病、基因与癌症的关系。2005年至2010年,他先后在国际知名杂志上发表了7篇基因与遗传疾病、基因和癌症发生相关的论文。2011年,他进入美国国立卫生研究院从事博士后研究,主要研究干细胞和诱导干细胞分化的表观遗传学机制。期间他又发表了数篇具有国际影响力的文章,并获得了美国政府近150万美元的个人科研经费,以及晋升为研究员和杰出人才通道的绿卡申请机会。

然而十载寒窗,余伟师逐渐认识到疾病,尤其是癌症治疗的复杂性,是他一个人每天待在实验室里永远也无法读懂的世界。要想真正解决人类面临的这一难题,他必须走出实验室,和更多志同道合的专家们一起,充分接触临床,去和医生们合作亲自解决各种问题。

由于“人种差异大”,余伟师认为欧美基因库案例虽然对人类疾病的了解有着重要的作用,但对中国人参考价值有限,一种“多年的知识储备无用武之地”的落寞油然而生,与此同时,身边不断有朋友或者亲属死于癌症的噩耗传来,回国创业的念头在他心里生根发芽。

在一些聚会上,他和身边的华人博士交流,发现大家都深有同感,他们都迫切的希望能将自己所学应用到实践中去,能帮助到那些正处于疾病痛苦中的同胞。“探索之路漫漫,有了同伴的互相搀扶,我立刻就不感到孤单了。”

考虑到中国基因数据分析市场成本高、时效低,且精准解析的维度欠缺。余伟师决心建立中国人自己的自动化数据分析平台。

在美国,2013年余伟师和他的4个同伴一起组建了早期团队,最初的目的也很简单,就是想利用他们在医学领域的跨学科的优势准确高效地解析人类基因组大数据,为医生、患者提供精准的疾病分类和诊疗建议。

2013年10月,余伟师团队接收了一份来自广东省中山医院的病例全基因数据,这是他们的第一次团队协作。

接到第一单,余伟师等5人兴奋得不得了,连轴转工作了一周,在数据提供方隐去临床诊断结果的前提下,他们通过分析该患者的基因数据最终将此病例判断为“结肠癌”患者,并给出了药物治疗的方案。而同时参与这次基因大数据分析的另外一家国际知名机构花了一个月的时间最终却给出了一个“样本出错”的结论。(应余伟师要求,此处隐去该机构名称。)

余伟师介绍称,进行基因大数据分析除了要过硬的专业知识和算法外,还要能够判断哪些信号是杂质和噪音,“因为癌旁正常组织和肿瘤组织并不是绝对单一的,当医学领域的不同学科的人交叉合作时,就拥有了更强的辨别能力”。

64个华人博士组成“幕僚团队”

2014年,余伟师团队完成了第一阶段的技术攻克,并在美国与各大癌症中心进行临床测试,同时也与国内多家知名医院完成了技术测试。经过短短两年时间,当初的5人团队已经壮大成64个分别来自分子医学、生物信息学、分子遗传学等各个研究领域的国际顶尖人才。

他们利用生物信息学与云计算正在开发出智能化、全自动的基因数据分析系统平台,在实现复杂基因数据的精准解析度基础上,能使成本降低50%~80%。

2015年10月,余伟师放弃了在美国所获得的一切成果,回国加入了创业大潮,“我们希望能够团结带动更多的科学家投入到这个事业中,帮助医生实现精准治疗,将癌症真正转变为可控的慢性病”。

据余伟师介绍,在目前的64位国际顶尖人才中,有20多人已成为赛福基因的核心成员,据不完全统计,团队核心成员在精准医疗领域发表的论文600篇之多,其中生物信息学基因数据分析相关论文200余篇。

未来核心成员会陆续回国参与到公司的全职经营中来,赛福基因也为他们预留了丰厚的股权作为激励。而其他成员多在美国各大癌症研究机构工作,以基因公司科学顾问的角色继续通力合作为赛福基因提供技术支持。

也在此时,正好赶上微软创投加速器招收项目,微软创投大中华区负责人杜枫介绍称,微软创投加速器招收项目有三个标准:一是广阔的市场,二是团队要最有可能解决这个问题,三是技术要具有领先性。

“赛福基因刚好具备这三点,所以他们可以从1400份申请中脱颖而出,成为了微软创投加速器第7期项目中唯一的生物医学方向的团队。”杜枫说。

基因信息挖掘机:从1000G中挖出几KB的信息

目前,赛福基因主要为医院和医疗科研单位提供基因大数据分析服务,所以他们也是一家B2B的公司,“现在国内有很多机构具备了基因检测能力,也诞生了很多基因检测公司,但是却缺乏专业的生物信息分析的团队,我们可以直接和他们对接”。

在对接医院方面,赛福基因的服务对象有两个,一个是给临床医生提供患者的个性化治疗建议,另一个是基于临床案例给医院提供大数据样本的分析报告。

“北京大学肿瘤医院的沈琳副院长曾搜集了15对胃肠间质瘤的样本,这是胃癌里面非常罕见的一种疾病,我们帮他做了基因数据分析后,对于她未来的临床治疗起到了很大的帮助,她也特别满意。”

在数据来源上,主要由医院、第三方检测机构、体检中心等几方面提供。为了让记者更形象地理解基因数据分析的难度,余伟师打了个比方,如果对一个人进行全基因组测序,根据测序深度不同,大概会产生300G到1000G的内容,而赛福基因要做的就是从1000G的内容中挖掘出几KB的关键信息,供医院和科研机构使用。

“当我们生物信息团队将突变的基因位点筛查出来后,分子医学和遗传学的博士团队就发挥作用了,他们深耕于人类疾病的不同领域,知晓不同的位点和疾病之间的关联,最终和临床信息相结合,辅助医生制定更精准的治疗方案。”余伟师说。

在余伟师看来,他们团队强大的基因数据分析能力得益于团队成员的学科交叉,“特别是癌症是一种复杂的基因组疾病,要想筛查出涉及疾病的关键位点,就必须具备过滤基因数据噪音的能力以及对疾病信号通路的精确把握,这需要不同专业的顶尖人才的相互碰撞和探讨交流,才能完成。”

杜枫介绍称,基因产业是新兴产业,目前就像一片汪洋大海上浮出了几个小岛,剩下的大部分信息还在水下,“所以基因行业还没有A+B一定等于C,只有A+B可能会推导出C”。

“基因数据分析其实就像在绘制海图,把大洋上的岛屿一个个挖掘并连接起来,怎么才能连接起来时,很多人都在探索的问题,赛福基因走得稍微早一点,他们将这些医学领域的教授和博士联结起来,其他人要绘制‘海图’也得这么做。”杜枫说。

构建基因数据智能分析系统

在余伟师看来,赛福基因能顺利走上基因数据分析的商业化道路与基因检测技术的日益成熟,成本也大幅度降低密不可分,因为这使普通患者基因测序成为可能。

2003年,进行一次个人的全基因测序需要30亿美金;2011年,乔布斯患胰腺癌,进行DNA测序花费10万美元,虽然价格缩水了10000倍,但依旧非常人所能承受;2015年基因测序的费用降到了1000美金,价格再次大幅降低,参与测序的人数增加为基因数据分析提供了商业化可能。

值此契机,余伟师决定在该领域深挖,他也看到了一个案例一个案例地去进行基因数据分析的低效和繁琐,为了让基因数据更高效地实现精准解析,他们正在筹划构建一个基因数据的智能分析系统,医生和科研人员在该系统中自助式的导入样本数据,利用后台的算法模型,就可以高效地得到自己想要的分析结果。

余伟师介绍称,利用生物信息学与云计算开发出智能化、全自动的基因数据分析系统平台,使成本降低50% ~80%,能实现复杂基因数据的精准解析度。

长期而言,赛福基因还希望在智能分析系统基础上建立一个可视化系统及云服务端口,使医生与科学家之间的交流效率提升到一个新的次元。“在这个智能分析平台上,我们还会对亚健康人能够提供一些个性化的健康管理的措施,给医药研究院提供动态的数据分析,加强精准医疗在癌症治疗上的应用。”

近两年来,世界各国政府纷纷以各种方式支持精准医疗计划发展,加速该领域的产业化。其中,基因检测被《时代》杂志评选为“50项最重要发明”榜首,业内普遍认为精准医疗计划将催生上万亿的市场,其中基因检测服务业五年内或达到百亿级。

在余伟师看来,精准医疗计划处于疾病诊疗的风口,将会全面推动传统医疗的变革,掀开疾病个体化治疗的新篇章。“随着精准医疗时代的开启,无论是B端还是C端都将前景广阔,对此我们深信不疑。”

不过,余伟师也表示看到了目前国内市场的鱼龙混杂,没有出现相关的行业标准,“目前赛福基因公司正在赢得国内相关权威部门的支持,我们正在积极地与此行业的各方进行磋商,希望能凭借我们在美国参与精准医疗计划积累的经验帮助中国在基因测序整体行业的发展贡献自己的力量。”

(稿件来源:《新京报》)

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