郭建华,李向碧,岳秀阳,曹 政
(1.西南大学荣昌校区动物医学系,重庆 荣昌 402460;2.重庆澳龙生物制品有限公司,重庆 荣昌 402460)
UNG酶在兽用生物制品支原体PCR检测中防止假阳性的应用
郭建华1,李向碧2,岳秀阳2,曹政2
(1.西南大学荣昌校区动物医学系,重庆 荣昌 402460;2.重庆澳龙生物制品有限公司,重庆 荣昌 402460)
为了研究尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG酶)在减少兽用生物制品支原体PCR检测中的假阳性情况,本研究通过在PCR试剂中加入UNG酶,在PCR反应前25℃作用10 min,再50℃作用2 min,结果显示,该法可以有效防止PCR产物的污染,减少假阳性的产生。
UNG酶;兽用生物制品;PCR;假阳性
支原体是无细胞壁、必须细胞内寄生的单细胞微生物,经常见于生物制品的污染[1]。现行的中国兽药典中,对支原体的检查规定用细胞培养法,在显微镜下看到支原体菌落作为判断的依据,但检查的时间长达29 d,所以常见于成品、血清的检验,对半成品、原辅材料则用培养法检验不能满足需要,所以很多厂家采用更加快捷的PCR方法进行检验。
PCR方法非常敏感,但在阴性对照甚至空白对照中会出现假阳性的情况,使实验者无法对结果进行判断。尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG酶)可以降解含有脱氧尿嘧啶核苷酸(dU)的双链DNA或单链DNA中的尿嘧啶糖苷键。如果在PCR反应体系中以dUTP取代dTTP,使PCR产物都是含有dU的DNA链,在PCR开始前增加50℃的保温步骤,UNG酶即可将反应体系中已有的dU的DNA污染物中的尿嘧啶碱基降解,并在随后变性这步的条件下DNA链断裂,消除由于污染DNA产生的扩增,从而保证扩增结果的特异性,准确性。同时UNG酶被灭活,不会再降解新扩增的产物U-DNA。因此UNG酶广泛用于医学检验中,但在兽用生物制品中,还未见报道[2-3]。
本研究以猪瘟细胞苗产品、生产用牛睾丸细胞作为检验对象,研究了UNG酶在兽用生物制品支原体PCR检测中消除假阳性的作用。
1.1材料细胞源猪瘟活疫苗,重庆澳龙生物制品有限公司2014年生产,血清是内蒙古金源康生物工程有限公司生产。
UNG酶、dUTP、Taq DNA聚合酶(5 units/μL)(附10×PCR Buffer(100 mmol/L Tris-HCl,pH值8.3)、dNTPs(dATP、dGTP、dCTP、dTTP均为10 mmol/L)、DNA分子量标准DL-2 000、支原体核酸提取试剂盒等,购自上宝生物工程(大连)有限公司。
猪鼻支原体,购自中国兽医药品监察所。
1.2方法
1.2.1引物的来源与合成扩增用引物序列来自参考文献[4-5],正向引物序列为:5′-ACACCAT⁃GGGAGCTGGTAAT-3′,反向引物序列为:5′-CTTCATCGACTTTCAGACCCAAGGCAT-3′,引物由Invitrogen(上海)合成。
1.2.2样品的处理与DNA提取样品的处理按照2010版《中国兽药典》第3部进行[6]:随机取5瓶疫苗制品,分别用生理盐水将冻干品复原到10头份每mL,将5瓶稀释液充分混匀制成混悬液,用来提取DNA。
1.2.3PCR反应取1 μL制备的基因组DNA为模板(约50 ng),加入下面的PCR反应体系中:50 mmol/L KCl,10 mmol/L Tris(pH值8.3),1.5 mmol/ L MgCl2,0.001%(wt/vol)gelatin,引物各为 0.6 μmol/L,dNTP各为200 μmol/L,Taq DNA酶1.5 U,UNG酶1U、dUTP600 μmol/L,共20 μL。反应条件:25℃UNG酶处理2 min,95℃2 min使UNG酶失活,95℃预变性,5 min;95℃变性,1 min,57℃退火温度下退火1 min,72℃延伸1 min,共35个循环;最后在72℃下10 min延伸。扩增完后,保存-20℃保存备用。阳性对照组加猪鼻支原体DNA为模板,阴性对照组不加模板,以生理盐水替代,不加UNG酶的试验组反应体系中不加入UNG酶和dUTP,25℃10 min和95℃2 min反应步骤,其余不变。
1.2.4电泳检测取PCR产物5 μL,在1.0%(w/ v)琼脂糖凝胶进行电泳,电场强度5 V/cm,时间50 min。
2.1不加UNG酶的试验组PCR结果如图1所示,阴性对照、血清样品、猪瘟疫苗均出现与阳性对照相同的条带(300 bp)。
图1 不加UNG酶组PCR产物电泳图
2.2UNG酶添加组电泳结果如图2所示,阴性对照、血清样品、猪瘟疫苗均无特异条带。
图2 UNG酶添加组PCR产物电泳图
本试验中,在不加入UNG酶时,阳性对照、样品、阴性对照都有特异性条带,甚至有时候换掉所有的试剂,仍然会出现同样的结果。加了UNG酶后,样品、阴性对照的特异性条带消失了。为了验证PCR结果的可靠性,在本研究中,所有检验样本血清、猪瘟疫苗成品、阳性对照均按照中国兽药典的方法进行了培养法检验,结果与加了UNG酶的结果一致。2014年本公司猪瘟疫苗成品中也未检出支原体,对各批次成品、半成品的PCR检验结果表明,加UNG酶后也不影响检验的敏感性与特异性。
本研究的UNG酶可消除PCR产物污染。其造成PCR假阳性原因还有很多,要彻底根除PCR的假阳性。还需要严格操作和区分操作,如DNA提取区域、加PCR试剂区域、加模板区域、电泳区域,用的微量移液器也不能混用,另外套式PCR、Touchdown PCR等方法也能提高试验的特异性和重复性[7],企业可以采用多种技术,指定操作规程,保证检验的可靠性。
当然,对生物制品的成品是否被支原体污染的检验以及下最终的结论,还需要按照中国兽药典的培养法来进行。需要指出的是,对于被检样品被灭活的支原体,PCR仍然可以检测出来,培养法却检测不出来。笔者建议用多种方法互相验证,确保产品的质量,PCR检验更用于牛睾丸、生产用细胞原辅材料以及中间品的快速检验,培养法更多用于成品的检验。
[1]Zhi Y,Mayhew A,Seng N,et al.Validation of a PCR method for the detection of mycoplasmas according to European Pharmaco⁃poeia section 2.6.7[J].Biologicals,2010,38:232-237.
[2]郭兆彪,张敏丽,汪晓辉,等.用尿嘧啶糖基化酶预防PCR污染的研究[J].中国兽医科技,1999,29(3):12-14.
[3]王省良,周东耀,王丽之,等.尿嘧啶DNA糖苷酶防止PCR产物污染及其对DNA杂交的影响[J].第一军医大学学报,2000,20(4):319-321.
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[6]中国兽药典委员会.中国兽药典(3部)[M].北京:中国农业出版社,2010:附录49.
[7]Joyce W M,熊祺琰,韦艳娜,等.套式PCR检测中国江苏省猪场猪鼻支原体和猪肺炎支原体的感染[J].中国人兽共患病学报,2014,30(8):800-805.
Application of Uracil-N-glycosylaseto Avoid FalsePositivein theDetection of Mycoplasma Contaminatein Veterinary Biological Products
GUO Jian-hua1,LI Xiang-bi2,YUE Xiu-yang2,CAO Zheng2
(1.Department of Veterinary Medicine,Southwest University,Chongqing 402460,China;2.Chongqing Auleon Biologicals Company Limited,Chongqing 402460,China)
To investigate the method of avoidance of false positive in the detection of mycoplasma contaminate in veterinary bi⁃ological productions,Uracil-N-glycosylase was added to PCR reaction mix.And 25℃for 10 minutes and 50℃for 2 minutes were processed before PCR reaction.The results showed that uracil-N-glycosylase prevented the contamination of PCR products and re⁃duced the false positive efficiently.Uracil-N-glycosylase can avoid false positive in detection of mycoplasma contamination in vet⁃erinary biological production.
Uracil-N-glycosylase;Biological products;PCR;False positive
CAO Zheng
TQ464.8
A
0529-6005(2016)07-0083-02
2015-03-25
西南大学科研基金资助(08BSr04)
郭建华(1977-),男,副教授,博士,从事微生物资源开发与分子生物学研究工作,E-mail:guo0619@swu.edu.cn
曹政,E-mail:maodenghu@163.com