郑和成,刘程静,胡利平,张秀峰(.楚雄州公安局,云南楚雄675000;.昆明医科大学法医学院,云南昆明650500)
指纹脱落细胞的STR检验
郑和成1,刘程静1,胡利平2,张秀峰2
(1.楚雄州公安局,云南楚雄675000;2.昆明医科大学法医学院,云南昆明650500)
关键词:法医遗传学;DNA指纹法;短串联重复序列;指纹;脱落细胞
现场遗留的帽子、口罩、衣服、手套等生物学检材,一般含有较多脱落细胞,DNA检验比较容易,然而对于指、掌纹短时间接触部位,由于所含脱落细胞少,且部分细胞核DNA容易降解,STR分型成功率较低。本研究对指纹脱落细胞分别应用Chelex-100、QIAamp DNA Investigator Kit、MagAttract M48 DNA Manual Kit磁珠及直接扩增法进行STR检验,并比较分析。
1.1样本来源
取100片洁净载玻片,25名志愿者每人分别在4块载玻片上按1枚清晰指纹样本,提取志愿者口腔拭子作为对照。将指纹脱落细胞检材分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ四组,每组25份,涵盖所有志愿者的指纹脱落细胞。
1.2DNA提取
Ⅰ组:剪取0.2 cm×0.2 cm纱布2块,采用两步擦拭法进行提取,置于1.5mL离心管中,加入20μL 5% Chelex-100、2μL 10mg/mL蛋白酶K,56℃消化过夜,100℃加热8min,离心后取上清液。
Ⅱ组:剪取0.5 cm×0.5 cm纱布2块,采用两步擦拭法进行提取,置于1.5mL离心管中,按照QIAamp DNA Investigator Kit说明书提取DNA模板,洗脱体积为20μL。
Ⅲ组:剪取0.5 cm×0.5 cm纱布2块,采用两步擦拭法进行提取,置于1.5mL离心管中,按照MagAttract M48 DNA Manual Kit磁珠法提取DNA模板,洗脱体积为20μL。
Ⅳ组:剪取0.5 cm长纱布丝一根,用蒸馏水浸湿后擦拭指纹部位,置于200μL扩增管中。
1.3扩增和检测
扩增采用Identifiler®Plus试剂盒(美国AB公司),使用10μL体系,按照说明书中的试剂配比,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组每管试剂混合物均为9μL,模板均为1μL,Ⅳ组每管试剂混合物均为9μL,四组均用28个循环进行扩增。使用3130型遗传分析仪(美国AB公司)进行检测,GeneMapper®ID 3.2软件进行STR分析。
检验结果表明,Ⅰ组检出7例可供比对的STR分型,检出率为28%;Ⅱ组检出6例,检出率为24%;Ⅲ组检出7例,检出率为28%;Ⅳ组检出19例,检出率为76%。
通过对指纹脱落细胞DNA进行四种方法的STR检验,结果显示,直接扩增法的检出率明显高于其他三种。利用Chelex-100法提取指纹脱落细胞DNA,虽然操作方法相对便捷,且没有造成DNA的损失,但加入22μL液体后就稀释了DNA的浓度,使得进入扩增体系的DNA模板含量减少,从而检出率也就降低。利用QIAamp DNA Investigator Kit法、MagAttract M48 DNA Manual Kit磁珠法检验,优点是可以清除较多杂质,提取到较纯的DNA模板,但在提取过程中还存在DNA的损失和稀释,造成指纹脱落细胞STR分型检出率低。利用直接扩增法检验指纹脱落细胞DNA,可以最大程度地保留核DNA的含有量,提高指纹脱落细胞STR分型的检出率,同时检验方法更加简单快捷。
直接扩增法检验指纹脱落细胞DNA在检出率和快捷程度上都具有较强的优势,然而本研究针对的是没有污染和杂质的理想指纹检材,因此在实际检案中遇到可能留有嫌疑人指、掌纹的部位和工具等,且污染程度低、杂质少时,可采用直接扩增法检验脱落细胞的STR基因型。对于杂质较多的指、掌纹脱落细胞的DNA检验,最好采用另三种方法,这些方法能够去除一定的杂质,特别是QIAamp DNA Investigator Kit法、MagAttract M48 DNA Manual Kit磁珠法,不但能够去除杂质,还可得到相对较纯、浓度较高的DNA模板,有利于含杂质较多的指、掌纹脱落细胞DNA的检验。
(本文编辑:李成涛)
·教育与管理·
收稿日期:(2015-04-07)
通信作者:张秀峰,男,博士,讲师,主要从事法医物证学教学、科研和鉴定;E-mail:191797683@qq.com
作者简介:郑和成(1982—),男,主检法医师,主要从事法医DNA检验研究;E-mail:769398851@qq.com
基金项目:云南省教育厅科学研究基金项目(2014Y180);云南省科技厅-昆明医科大学应用基础研究联合专项基金(2014FZ005)
文章编号:1004-5619(2016)02-0136-01
中图分类号:DF795.2
文献标志码:B
doi:10.3969/j.issn.1004-5619.2016.02.015