实时反转录聚合酶链反应对猪水泡诊断样本中赛尼卡谷病毒的检测
Senecavirus A(SV-A)原名赛尼卡谷病毒(SVV),被认为与猪原发性疱疹病(SIVD)相关,SIVD是一种缺乏特定病原体的疱疹疾病综合症。SIVD的临床表现类似于更具传染性和经济破坏性的水泡性疾病,如口蹄疫(FMD)、猪水疱病(SVD)和水泡性口炎(VS),通常需要立即做出诊断,以解除对动物的检疫、运动和贸易的限制。该研究提出了一个适用于诊断猪样本中SV-A的检测方法:SYBR Green RT-qPCR(实时反转录定量聚合酶链式反应)。用RT-qPCR对出现水泡疾病临床症状的50头猪只样品进行检测,引物序列设计根据Genbank中SV-A高度保守的VP1编码区:SV-A-qF(5'-GGGTAACACTGACACCGATTT)和SV-A-qR(5'-TCGAGATCGATCAAACAGGAAC),扩增产物长度为87 bp,以β-Actin为内参,目的基因扩增条件为:48 ℃5 min;95 ℃ 10 min;接下来40个循环的95 ℃ 5 s,60 ℃ 1 min。结果显示:以35头未患水泡病的猪为对照组,在50头猪中,44头猪(88%)被检测到患有SV-A。
SV-A RT-qPCR是一种快速、特异、灵敏度高的定量分析方法,可检测来自于病变蹄中的拭子和组织、口腔和鼻黏膜上皮、口腔拭子、痂和内部器官如肝脏和淋巴结组织中的SV-A RNA。
(编译自:http://journals.plos.org/plosone/ article?id=10.1371/journal.pone.0146211)