王兴政,杨 宁,陈红刚,刘效瑞,王富胜
(1.甘肃省定西市农业科学研究院,甘肃 定西 743000;2.西北师范大学,甘肃 兰州 730070;3.甘肃中医药大学,甘肃 兰州 730010)
我国中药材资源丰富,是世界中药材的主产国,对中药材的研究有几千年历史。中药材的品质关系到临床用药的安全有效,发展道地药材是实现中药现代化的关键,也是占有市场、增强产品竞争力的基本保障。当前,药材道地性研究已经成为中医药科研的重要课题。
板蓝根(Radix Isatidis)为2年生草本十字花科植物菘蓝(Isatis factionindigotica Fort)的根,始载于《神农本草经》,为传统抗病毒中药之一。板蓝根味苦、性寒,归心、胃经,有清热解毒、凉血利咽之功效[1-2]。近年来的研究表明,板蓝根具有较强的抗菌、抗病毒和抗内毒素的作用[3],广泛用于治疗流感、腮腺炎、温病发热、发斑、风热感冒、咽喉肿烂、流行性乙型脑炎和肝炎等多种疾病[4]。
然而目前甘肃板蓝根栽培中普遍使用传统栽培育种方法,栽培品种为板蓝根属多种类型的混和体,田间表现良莠混杂,难于管理,且品系亲缘关系不明确,缺乏品系鉴定的分子依据,严重制约着当地板蓝根的产量和品质,生产中迫切需要优势新品种的选育鉴定。另外,药材的道地性一直是评价药材品质的综合性标准,而产生道地性的原因,除了与栽培方法、生态环境、加工方法有关外,还与物种居群的遗传特异性有关。道地药材与非道地药材在形态和生药性状等特征上的差别并不明显,这给应用传统方法鉴别道地药材带来了困难。
随机扩增DNA多态性(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)技术以其操作简单、快速、花费少、DNA用量少、无放射性等优点,广泛应用于中草药种质资源亲缘关系、遗传多样性及药材道地性研究等方面[5-6]。本研究正是基于甘肃省板蓝根生产及销售实际中不能提供科学的药材道地性鉴定等问题,利用RAPD技术对甘肃省定西市农业科学研究院选育的板蓝根新品系BLG2012-04与当地大田栽培种进行分析鉴定,考证其遗传多样性和亲缘关系,为甘肃省板蓝根的产业化发展提供部分分子生物学依据。
本研究所用2个板蓝根样品种子分别为培育品系BLG2012-04和当地大田栽培种(CK),均由甘肃省定西市农业科学研究院提供,种子采集于2014年9月,每个样品均采集种子500粒。
1.2.1 板蓝根种子的萌发 挑选颗粒饱满均匀的板蓝根种子,用1 g/kg次氯酸钠溶液表面消毒10 min,用蒸馏水少量多次冲洗若干次,至无次氯酸钠味道为止。消毒过程中轻摇数次,以提高消毒效果[7]。取10个花盆,分为BLG2012-04和CK两组,每组5盆。每盆中均匀撒播30粒种子,覆土2 cm。培养条件为温度25℃,光照强度1 000~2 000 Lx、每天连续光照12 h,每隔48 h浇水1次。
1.2.2 DNA的提取 采用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法提取植物基因组DNA,所用试剂盒购自北京百泰克生物技术有限公司。提取后的DNA在4℃保存待用,对提取的2个供试材料的DNA进行琼脂糖凝胶电泳检测,以确保为后期PCR扩增提供良好的模板。
1.2.3 PCR扩增 PCR扩增反应在BIO-RAD普通型PCR仪上进行,RAPD引物由北京奥科生物技术公司生产,所用Taq酶购自天根生化科技(北京)有限公司。
RAPD反应体系:模板DNA 1μL,随机引物2μL,Taq酶10μL,加ddH2O至20μL。
扩增程序:94℃预变性5 min后,94℃1 min,30℃1 min,72℃1 min,共计35个循环,最后72℃延伸10 min。
采用1%的琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭(EB)染色,UVI凝胶图像分析系统观察照相。每实验重复3次。
参照Williams等的方法[8]。电泳扩增图谱中的每条带(DNA片段)均为1个分子标记(Marker),并代表1个引物结合位点。根据各分子标记在相同电泳迁移率下(相同分子量片段)的有无,统计得到所有位点的二元数据,有DNA扩增带(显性)为1,无带(隐性)记为0,强带和弱带赋值为1。对于多态性位点,采用在重复试验中能稳定出现的差异带用于数据分析。
通过引物筛选,对2个品系挑选出谱带清晰、重复性好、多态性较丰富的11条随机引物用于PCR扩增反应。引物分别为P1、P2、P4、P5、P7-P13。所用引物及扩增条带数见表1。对于BLG2012-04品系,11条引物共扩增出119个位点,不同引物的扩增位点变幅为8~13个,平均每条引物能扩增出10.8个位点;对于CK,11条引物共扩增出119个位点,不同引物的扩增位点变幅为8~14个,平均每条引物能扩增出10.8个位点。
利用11条引物,分别扩增两品系,从而在分子水平上反映两品系间的遗传差异性。筛选出的11 条引物分别为 P1、P2、P4、P5、P7、P8、P9、P10、P11、P12、P13(引物及其扩增条带数见表1)。结果显示,BLG2012-04和CK的主谱带基本一致,说明它们的遗传背景具有很大的相似性,但是两者间的次谱带存在一定差异。相同引物扩增2个品系产生的总位点数的范围为16~27个,其中多态性位点的差异变幅为1~2个。这说明2个品系之间存在遗传学差异,表现出具有遗传多态性位点(图1)。
表1 引物序列和对BLG2012-04及CK的扩增结果
图1 BLG2012-04和CK的RAPD电泳图谱
1)影响PCR扩增条带的因素有模板DNA、引物、dNTPs量、Taq酶、退火温度、电泳中的琼脂糖浓度、电泳时间等。本研究对退火温度和电泳时间这两个因素进行了优化分析,最终确定了板蓝根材料的最适RAPD-PCR扩增反应体系为模板DNA 1μL,随机引物 2μL,Taq酶 10μL,ddH2O 7 μL;RAPD引物最佳退火温度为30℃,最适琼脂糖浓度为1%。此体系的建立可以为其他板蓝根品系的RAPD扩增提供参照依据。
2)RAPD是一种显性标记,能从分子水平上揭示材料间存在的遗传差异[9-11]。从RAPD的结果可以看出,2个不同的供试材料的主谱带基本一致,说明它们的遗传背景具有很大的相似性。表明甘肃省新选育的板蓝根品系BLG2012-04和当地大田栽培种之间的遗传关系较近。这种情况可能是由于在板蓝根种植过程中,两个品系之间的地理分布近,并且板蓝根是自交不亲和的异花授粉植物,从而使不同板蓝根品系间相互授粉的几率大大提高,造成品系间的遗传关系较近。次谱带存在不同程度的差异,多态性位点的差异变幅为1~2个。这在分子水平上说明板蓝根品系BLG2012-04与当地大田栽培种具有一定的遗传差异性。
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