RNA-Seq技术揭示人体急进高原早期转录特征

陈　建，刘　宝，崔建华，张　龙，徐　刚，梁　颜，梁　羽，汪　健，高钰琪(第三军医大学高原军事医学系高原特需药品与卫生装备研究室，解放军第十八医院高山病研究所，华大基因研究院，重庆400038)

RNA-Seq技术揭示人体急进高原早期转录特征

陈建，刘宝，崔建华，张龙，徐刚，梁颜，梁羽，汪健，高钰琪△
(第三军医大学高原军事医学系高原特需药品与卫生装备研究室，解放军第十八医院高山病研究所，华大基因研究院，重庆400038)

目的:通过RNA-Seq技术探讨人体急进高原早期的转录特征。方法:对从平原快速进入高原(5300 m)的19名青年健康男性志愿者，于进入高原前后采集静脉血。提取总RNA进行测序，获取原始序列数据，对原始序列数据进行质量控制处理后，将其比对到人类参考基因组(hg19)。统计相关读段数计算不同转录本的表达量。对急进高原前后转录本表达谱进行转录本差异表达分析，针对差异表达转录本，对其进行基因本体及通路分析。结果:从37 908个转录本中筛选出836个差异转录本，其中274个转录本表达上调，562个转录本表达下调。人体急进高原早期多个生物学过程及信号通路参与了人体对高原低氧环境的反应。结论:面对高原低氧环境，人体在基因整体水平表现出了特有的差异表达谱特征，参与其中的生物学过程及信号通路对理解人体对高原低氧环境反应的分子机制具有重要的参考价值。

△E-mail: gaoy66@yahoo.com