基于聚类分析的河南荷花品种资源分类1)

2013-08-08 07:22管志涛郝改莲孔德政
东北林业大学学报 2013年9期
关键词:野生种重瓣株型

管志涛 郝改莲 孔德政

(濮阳职业技术学院,濮阳,457000) (河南农业大学)

确定荷花品种主要性状对鉴定新品种及分类至关重要[1]。面对众多的荷花品种,只有了解品种的特性和相互之间的关系,才能更好地为选择亲本,培育更优质品种服务。在借鉴以往研究方法的基础上,研究选用河南地区127个荷花品种及野生种,借助聚类分析方法,对荷花品种进行遗传距离研究,旨在为荷花育种、分类、应用及亲缘关系的研究提供依据。

1 材料与方法

试验所用荷花品种均来源于河南省各城市公园、风景区、莲藕生产地及野生藕生长地培育及生长的花莲、藕莲和子莲。在2008年调查的96个品种[2]基础上,扩大调查范围,加深调查力度,增加了扣马白莲等31个品种及野生种,因野生种目前尚未申报命名,笔者采用发现野生种的地名命名。供试荷花品种名称见表1。

参照《中国莲》[3]《中国荷花品种图志》[4]《中国荷花》[5],确定荷花品种性状指标,对24个生物学性状进行统计与测量,将性状分为数值性状和质量性状。其中又将质量性状分为二元性状和有序多态性状。本研究采用等级数量编码方法进行性状编码[6],二元性状以0,1表示,有序多态性状以1,2,3…表示,数值性状取平均值直接转人下一步数学运算。

试验数据应用DPS软件统计分析。孔德政等[7]认为卡方距离最长距离法分辨力最好,聚类分析时最适合莲属资源分类。

2 结果与分析

2.1 R型聚类分析结果

根据分类的需要,对荷花的生物学性状进行的R型聚类。分析结果见图1,依据聚合水平,计算出跳变值,在图1中作结合线L=9.401 7。分析显示,大多数性状间都彼此独立,说明这些性状间的变异和演进是互不干扰的。

2.2 Q型聚类分析结果

对127个荷花品种进行卡方距离最长距离法聚类,结果见图2。由图2可以看出,在结合线L1=3.745 3处将荷花品种分为两大类,即大株型群(Ⅰ类)和中小株型群(Ⅱ类);结合线L2=2.823 4又将大株型群分为三大类,即A组、B组、C组。结合线L4=2.567 1又将中小株型群分为3类,即重台类(D组)、重瓣类(E组和 F组)、少瓣和半重瓣类(G组)。这些大类下面又可分为若干小类。

A组:所含品种类型为少瓣类。结合线L3=2.623 9将其分为两类①组和②组。①组品种均为花莲品种,但还在大株型群中出现了‘娃娃莲’、‘金珠落玉盘’、‘风采’、‘红领巾’等中株型群品种,这说明碗莲品种性状进化不稳定,给其适合的条件和环境,有变回大株型的趋势[2];②组均为藕莲品种。

表1 供试荷花品种

图1 24个形态性状R型聚类

B组:所含品种类型为少瓣类。结合线L5=2.547 1将其分类为③组和④组。③组均为目前全国广为栽培的藕莲品种。鄂莲5号为鄂莲1号和鄂莲2号的杂交品种,鄂莲系列从遗传距离中可看出,亲缘关系较近,这与实际生产相符。但观赏品种‘眼儿媚’、‘一丈青’与藕莲品种聚为一类,说明其在亲缘关系中与藕莲较近,只是在生产中作为花莲推广。④组均为河南本土野生种,因野生种负载荷花的原始信息,故它们聚为一类。又因野生种目前尚未申报命名,故在聚类和生物学性状描述时,笔者采用发现野生种的地名命名。

C组:所含品种类型为少瓣类,并且均为冬荷品种,故聚为一类。

D组:所包含的品种类型为重台类,少数为重瓣类。D组中重瓣类品种的心皮大部分瓣化或泡状,很少结实,有向重台类进化的趋势,故其与重台类聚类在一起。结合线L6=2.147 8将D组分类为⑤、⑥、⑦3组。⑤组品种全为粉色系。⑥组品种为红莲系,因复色品种‘蝶恋花’由红莲进化而成,故与红莲聚类在一起。白色品种‘小碧台’因其遗传性状与其他品种相近而聚类在一起。⑦组品种为白色系。粉色品种‘红宝石’、‘寿星莲’由白色系进化而成,故与白色系聚类在一起。

E组:所包含的品种类型为半重瓣和重瓣型。结合线L7=1.987 1将E组分类为⑧组和⑨组。⑧组品种为少瓣和半重瓣品种,因重瓣品种‘别样红’、‘友谊红2号’因花色与其他品种相同,又因花瓣数为重瓣品种中的较少数,与重瓣相近,故与半重瓣聚类为一类。⑨组品种均为重瓣类。

G组:所包含品种类型为大中型株型群。花型为重瓣型和少瓣型。结合线L8=2.595 7将G组分类为⑩组和○11组。⑩组品种为重瓣型,从遗传距离上看,⑩组和⑨组较远,故⑩组没和⑨组聚类在一起。○11组品种为少瓣类,且为大株型群。但其没和I组聚类在一起,大概是因为生物学性状与Ⅱ组其他品种较近,而与其聚类在一起。这一问题需要进一步研究讨论。

图2 127个荷花品种聚类分析

3 结论与讨论

依据主成分分析结果,对荷花品种的24个性状进行R型聚类。聚类结果表明,大多数性状间都彼此独立,性状间的变异和演进是互不干扰的。只有少数性状具有连带和相互关系,在以后的运用中可淘汰掉部分性状。

本研究采用卡方距离最长距离法对127个荷花品种的24个性状进行Q型聚类分析,通过分析,将其划分为两大类,又依据各品种的相似性状,细分为11小类。通过对荷花每一品种分类位置进行分析与比较[4,7-8],笔者认为,数量分类结果行之有效,并可减少细胞学标记分类、蛋白质标记分类、DNA分子标记分类等工作的试验繁杂。与形态学形状分类比较,又增强了科学性及客观性。如唐招提寺莲[9]通过数量分类和RAPD鉴定都聚在藕莲中,但在生产中则作为花莲栽培,有充分理由将其认定为藕莲。

R型和Q型聚类分析结果具有客观性,必要时能为修改和改进分类提供帮助,聚类分析方法本身只是一种运算方法,不提供新的分类系统,但其客观地检查现有的分类结果,还能在许多情况下为完善和改进现有的分类提供启示作用。尤其在研究品种和野生种遗传距离时,聚类分析可从繁杂的现象中,找出主要问题。目前,关于聚类分析方法,已被广泛应用于李[10]、茄子[11]、山药[12]等果蔬及农作物,加之数理分类方法可以检验和重复,因此,在研究植物分类中应充分利用。

[1] 王其超,张行言.荷花新品种性状记载项目的制定[J].中国园林,2012,28(1):74-77.

[2] 管志涛.河南省荷花资源调查及其品种分类的研究[D].郑州:河南农业大学,2008.

[3] 倪学明.中国莲[M].北京:科学出版社,1987.

[4] 王其超,张行言.中国荷花品种图志[M].北京:中国林业出版社,2004.

[5] 邹秀文,赵效锐,靳晓白.中国荷花[M].北京:金盾出版社,1997.

[6] 徐克学.数量分类学[M].北京:科学出版社,1994.

[7] 孔德政,管志涛.基于主成分和聚类分析的荷花品种生物学性状的比较研究[J].中国园林,2008,24(8):86-89.

[8] 赵海舰.荷花部分品种资源调查及孢粉学研究[D].郑州:河南农业大学,2010.

[9] 郭宏波.莲属(Nelumbo)资源的分类[D].武汉:华中农业大学,2003.

[10] 焦扬,葛慧玲.聚类分析在李品种谱系分析中的应用[J].东北农业大学学报,2011,42(5):72-76.

[11] 赵德新,孙治强,任子君,等.茄子形态学性状主成分分析及聚类分析[J].河南农业大学学报,2009,43(4):393-397.

[12] 梁任繁,王军民,覃芳,等.广西山药种质资源聚类分析[J].中国蔬菜,2009(4):30-34.

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