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最佳卵巢癌模型的识别
Nikolaus Schultz和他的研究团队分析了癌症基因组图谱(确定临床卵巢癌样本的基因组特征)以及癌细胞系百科全书(包含用于研究工作的大约1000个癌细胞系的相似数据),对这些数据彼此之间进行了匹配,并根据大约50个卵巢癌细胞系与来自“高级别浆液性卵巢癌(High grade serous ovarian carcinoma,HGSOC)”患者的临床样本的基因组相似性对它们进行了排序。该团队发现,两个最流行的卵巢癌细胞系(占所有已发表的关于HGSOC的研究论文的60%)并不是非常像HGSOC,而12个最适合的卵巢癌细胞系仅用在1%的已发表研究论文中。
该研究成果最近刊登在国际杂志Nature Communications上,为“一些最流行的卵巢癌细胞系可能并非卵巢癌的最好模型”的说法提供了证据,同时也提供了一个方法论框架,这个框架也许还可应用于其他细胞系和不同类型的癌症,以便评估它们作为研究工具是否合适。
参考资料
[1]Domcke S,Sinha R,Levine DA,et al.Evaluating cell lines as tumour models by comparison of genomic profiles[J].2013,9 July,doi:10.1038/ ncomms3126
(陈农)