李 军 ,黄 霞 ,姚雪梅 ,陈雪芬 ,齐兴柱
1.热带生物资源教育部重点实验室,海南海口 570228;2.海南大学海洋学院,海南海口 570228
E.coli DH10B碱性磷酸酶基因的克隆、表达及活性研究
李 军1,2,黄 霞2,姚雪梅2,陈雪芬2,齐兴柱2
1.热带生物资源教育部重点实验室,海南海口 570228;2.海南大学海洋学院,海南海口 570228
目的:克隆并表达E.coli DH10B碱性磷酸酶(AKP)成熟肽基因(phoAm),为AKP的定向改构及应用奠定基础。方法:采用PCR法从E.coli DH10B基因组扩增phoAm;将phoAm克隆入表达载体pET28a,再转入E.coli BL21(DE3)进行表达;用免疫金层析法和SDS-PAGE法检测表达的重组rAKP;采用对硝基酚磷酸(pNPP)法测定rAKP的活性。结果:rAKP单体分子量约47 K,活性分析比对照菌提高21.5倍。结论:获得AKP成熟肽基因并得了到具有较高活性的重组rAKP。
碱性磷酸酶;大肠杆菌DH10B;表达纯化;活性分析
碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,AKP)是一类非特异性磷酸单酯酶,可催化磷酸单酯的水解[1]。AKP广泛存在于多种细菌、真菌和动物中。不同来源的AKP的相对分子质量和编码序列差异很大,且各种AKP的性质、结构、功能和催化机制也不完全相同。其中,E.coli AKP由phoA基因编码,为同源二聚体金属酶,单体由449个氨基酸组成,相对分子质量为47 K,活性中心包括3个金属原子,即2个锌原子和1个镁原子[2]。
E.coli AKP催化机制明确,底物范围广泛,作为工具酶在表位连锁、组织化学、免疫印迹、突变分析等方面有广泛应用。E.coli DH10B无致病性和耐药基因,是基因克隆的常用受体菌。本研究首次从E.coli DH10B基因组中克隆了AKP的成熟肽基因(phoAm)并进行了表达研究,从而为此种酶的结构、功能和应用研究打下了坚实的基础。
1.1 材料
1.1.1 菌株、载体 大肠杆菌菌株E.coliDH10B、E.coliBL21(DE3)、E.coli DH5α及原核表达载体pET28a(+)由热带生物资源教育部重点实验室保存。
1.1.2 试剂 T4 DNA连接酶、限制性核酸内切酶BamHⅠ、HindⅢ、氨苄青霉素、卡那霉素、异丙基硫代-β-D-半乳糖苷(IPTG)、对硝基苯磷酸(pNPP)购自生工生物(上海)有限公司。质粒提取试剂盒、DNA产物纯化试剂盒、Pfu DNA聚合酶购自天根生化科技(北京)有限公司。His标签蛋白纯化试剂盒、重组标签蛋白快速检测试剂盒GoldCassette-HIS购自北京康为世纪生物科技有限公司。
1.1.3 引物 引物设计后由生工生物(上海)有限公司合成。
1.1.4 仪器 UV-2450紫外可见分光光度计(岛津);超微量黑色石英比色皿(岛津);PCR扩增仪(2720 Thermal Cycler Applied Biosystems);凝胶成像系统(BioRad)。
1.2 方法
1.2.1 E.coli DH10B基因组DNA的提取与纯化 E.coli DH10B甘油菌经LB培养液增菌培养后,用天根公司的细菌基因组DNA提取试剂盒进行提取与纯化。提取的基因组DNA用紫外分光光度法进行评价。
1.2.2 引物设计 从Genbank数据库下载E.coli DH10B的phoA 基因序列(accession number:NC-010473),使用 Primer Premier 6.0和Oligo 7.37辅助设计用于扩增AKP phoAm的引物,为便于克隆进表达载体pET28a中,在引物两端加上适当的酶切位点和保护碱基。设计的引物如下,正向引物(phoAm-F):5'-GTCATGGATCCCGGACACCAGAAATGCC-3'(BamHⅠ);反向引物(phoAm-R):5'-GCGACAAGCTTTATT TCAGCCCCAGAGC-3'(HindⅢ)。
1.2.3 PCR法扩增phoA基因 在0.2 ml PCR管内配制50 μl反应体系,按下述程序进行PCR扩增:94℃预变性3 min;扩增 30个循环, 即 94℃ 30 s→55℃ 30 s→72℃ 2 min;72℃延伸5 min。反应结束后,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测并进行测序。
1.2.4 phoAm基因的克隆 PCR产物经DNA产物纯化试剂盒纯化后,用限制性内切酶BamHⅠ和HindⅢ双酶切,并与同样经BamHⅠ和HindⅢ双酶切的表达载体pET28a(+)经T4 DNA连接酶连接后,转化E.coli BL21(DE3)感受态细胞,经LB/kan筛选平板培养后,用菌落PCR鉴定转化子。
1.2.5 phoAm基因的诱导表达 分别接种pET28a-phoAm/BL21(DE3)和 pET28a/BL21(DE3)单菌落至 5 ml LB 培养液中,37℃振荡培养过夜。按1%的比例接种阳性菌液至100 ml LB培养液中,37℃振荡培养,至菌液OD600nm约为0.4时,加入终浓度为1 mmol/L的IPTG进行诱导,继续培养3 h。
1.2.6 重组蛋白(rAKP)的检测 菌体离心后,加入缓冲液超声破碎,离心取上清液,用免疫金层析法检测6×His标签,用SDS-PAGE法检测表达蛋白。
1.2.7 重组蛋白(rAKP)的纯化 采用Ni-Agarose His标签蛋白纯化试剂盒进行纯化。对洗脱液进行SDS-PAGE分析并用Bradford法定量。
1.2.8 重组蛋白(rAKP)的活性分析 采用对硝基酚磷酸(pNPP)法测定rAKP的活性。取发酵菌体超声破碎后的上清液,加入测活液,30℃反应10 min,加入终止液终止反应,于波长410 nm处测吸收值。
2.1 PCR扩增E.coli DH10B成熟肽基因(phoA)
PCR产物在琼脂糖凝胶电泳上分析,可见1.4 kb的条带(图1)大小与预期一致。
图1 E.coli DH10B phoAm PCR产物的琼脂糖凝胶电泳
2.2 重组蛋白(rAKP)的表达与检测
重组菌诱导表达后,取超声破碎后的上清液,分别用免疫金层析法快速检测6×His标签(图2),用SDS-PAGE法检测表达蛋白(图3)。rAKP的分子量约为47 K。
图2 免疫金层析法快速检测His标签蛋白
图3 SDS-PAGE检测诱导表达的rAKP
2.3 重组蛋白(rAKP)的活性分析
rAKP经活性分析,对照菌 E.coli BL21(DE3)的 OD405nm为 0.120,重组菌 E.coli BL21(DE3)/phoAm 的 OD405nm为2.58,即重组菌的碱性磷酸酶活性提高21.5倍。
本研究首次从E.coli DH10B菌株的基因组中克隆了碱性磷酸酶成熟肽基因,并进行了表达、纯化与活性研究。E.coli AKP作为工具酶在表位连锁、组织化学、免疫印迹、突变分析等方面有广泛应用。目前市场上常见的AKP产品有虾碱性磷酸酶(SAP)和牛小肠碱性磷酸酶(CIAP),其中CIAP的活性最高,约为天然E.coli AKP的40倍[3]。与天然提纯的SAP和CIAP相比,E.coli AKP的生产成本低,热稳定性好。由于AKP的构效关系明确,且在定点诱变和结构改造方面积累了一定的经验[4-5]。进一步研究可结合计算机模拟对E.coli AKP的三维结构与催化活性之间的关系进行深入分析[6],利用当前蛋白质工程的先进技术手段对重组E.coli AKP进一步改构。
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[4]MullerBH,LamoureC,LeD.ImprovingEscherichiacolialkalinephosphatase efficacy by additional mutations inside and outside the catalytic pocket[J].Chembiochem,2001,(2):517-523.
[5]王秋颖,李宁,向本琼.大肠杆菌碱性磷酸酶突变体的构建及其结构与功能研究[J].北京师范大学学报:自然科学版,2007,43(6):647-652.
[6]Lopez-CanutV,RocaM,BertranJ,etal.Promiscuityinalkalinephosphatase superfamily,unraveling evolution through molecular simulations [J].J Am Chem Soc,2011,133(31):12050-12062.
Study on cloning,expression and activity of alkaline phosphatase from Escherichia coli DH10B
LI Jun1,2,HUANG Xia2,YAO Xuemei2,CHEN Xuefen2,QI Xingzhu2
1.Key Laboratory of Tropical Biological Resources of Ministry of Education,Hainan Province,Haikou 570228,China;2.Ocean College of Hainan University,Hainan Province,Haikou 570228,China
Objective:To clone and express alkaline phosphatase mature peptide gene of E.coli DH10B for the foundation of directed structural transformation and application of AKP.Methods:phoAm gene was amplified from E.coli DH10B genome by PCR;phoAm gene was cloned into pET28a and transformed into E.coli BL21(DE3);rAKP was detected by immuno-gold chromatography and SDS-PAGE;the activity of rAKP was determined by pNPP method.Results:Molecular weight of rAKP monomer was about 47 K,and activity of rAKP increased 21.5 times compared with the control.Conclusion:AKP matural peptide gene and rAKP with higher activity is acquired.
Alkaline phosphatase;E.coli DH10B;Express and purify;Activity analysis
Q78
A
1673-7210(2012)01(a)-028-03
海南大学211工程研究生教育教学改革研究项目(项目编号:YJG0102)。
李军(1969-),男,博士,副教授,硕士研究生导师;研究方向:生物制药与药物制剂。
2011-08-08)