王国富,白 丽,薛士鹏,吴利先
(大理学院基础医学院,云南大理 671000)
福氏志贺菌ipaB基因的克隆及序列测定
王国富,白 丽,薛士鹏,吴利先*
(大理学院基础医学院,云南大理 671000)
目的:克隆福氏志贺菌(Shigella flexneri,S.flexne)的ipaB基因。方法:以福氏志贺菌2a 2457T(Nal)r为模板,用PCR扩增ipaB目的基因片段,克隆至pQE-30表达载体中,构建含目的基因的表达质粒pQE-ipaB。结果:构建了重组质粒pQE-ipaB,ipaB基因全长1 743 bp,经测序分析与预期相符。结论:成功克隆了ipaB基因。
福氏志贺菌;ipaB基因;克隆;测定;一致
志贺氏菌引起的细菌性痢疾为一种全球性的肠道传染病。据估计,全世界每年感染的人数超过两亿,由该病引起的死亡人数有65万左右〔1〕。福氏志贺菌(Shigella flexneri,S.flexneri)是细菌性痢疾的重要致病菌之一〔2〕。细菌性痢疾的发生开始于细菌侵入肠上皮细胞,引起局部细胞的坏死和炎症反应。目前研究认为,细菌性痢疾的发病机制主要与志贺菌的毒力质粒有关,消除该质粒后志贺菌的致病力也随之消失:毒力质粒上一个31 kb大小的片断是细菌侵袭所必需的,编码多种与侵袭相关的基因:其中由它编码合成的侵袭质粒抗原(Ipa)A,B,C,D是志贺菌侵入肠上皮细胞所必需的〔3-4〕。目前认为,在菌体外,IpaB和IpaC蛋白以复合物形式存在,从而介导志贺菌侵入肠上皮细胞〔5-6〕。所以,本实验选择其中一个与志贺菌毒力明显相关的基因ipaB为靶基因,从福氏志贺菌2a 2457T(Nal)r菌株进行克隆,克隆了ipaB,为进一行研究IpaB的表达和志贺菌发病机制的研究奠定基础。
1.1 材料 福氏志贺菌2a 2457T(Nal)r由军事医学科学院生物工程研究所王恒梁博士惠赠。原核表达载体pQE-30质粒为大理学院基础医学院微生物学教研室保存。限制性内切酶、T4DNA连接酶(快速连接试剂盒)、KpnI、SalI、PCR纯化试剂盒为Takara Bio公司产品,DNA胶回收试剂盒购自Tian gen公司。高保真Tag DNA聚合酶、dNTP购自北京晨绿公司。
1.2 菌株培养 将福氏志贺菌2a 2457T(Nal)r接种在含0.025%刚果红和40 μg/mL萘啶酮酸(Nal)的水解大豆琼脂(Tryptiscase soy agar,TSA)平皿上划线培养,挑取红色菌落接种于水解大豆肉汤(Tryptiscase soy broth,TSB)培养基在37℃140转摇床培养备用。
1.3 基因的扩增 取TBS培养过夜的福氏志贺菌2a 2457T(Nal)r50 uL,12000转5 min离心弃上清液后加50 uL去离子水,煮沸10 min,12 000转离心5 min,取上清液2 uL作为PCR模板,反应体系中加入dNTP 4 μL,10×PCR buffer缓冲液5 μL,Mg2+4 μL,TagDNA聚合酶1 uL,引物P1、P2各1 μL,补水至50 μL。反应条件为:95℃4 min后,按下列参数扩增30个循环,即94℃变性60 s,52℃退火60 s,72℃延伸60 s,30个循环后72℃再延伸8 min。
1.4 重组质粒的构建 PCR扩增片段经1%琼脂糖凝胶70 V、50 mA电泳,在荧光灯下将扩增片段条带切下,用北京Tian gen DNA胶回收试剂盒回收目的片段,质粒pQE-30和目的基因经KpnI和SalI双酶切,用PCR纯化试剂盒回收酶切片段,用T4DNA连接酶试剂盒在16℃连接4 h,转化到TOP-10宿主菌,双酶切鉴定筛选出阳性克隆。挑取阳性克隆接种于LA(含Amp 100 mg/L)液体培养基中,增菌备用。
1.5 序列测定 取鉴定后筛选出的阳性克隆重组质粒送往北京晨绿公司进行测序。
2.1 ipaB基因的PCR扩增产物 根据基因文库中的ipaB基因序列设计引物如下P1:5′-CC GGTACC ATG AAA GCA AAT AAT C-3′P2:5′-CC GTCGAC TTA TCG GTT TCT-3′由上海生工公司合成。P1引入内切酶KpnI的酶切位点,P2引入内切酶SalI的酶切位点。ipaB基因全长1 711 bp,其PCR结果见图1。
图1 ipaB PCR产物的琼脂糖凝胶电泳结果
2.2 重组表达质粒的鉴定 重组质粒pQE-ipaB经 KpnI、SalI双酶切鉴定结果见图2,能切出与ipaB大小相符的片段(1711bp),表明基因克隆成功。
图2 重组质粒pQE30-ipaB的鉴定
2.3 重组质粒pQE-ipaB的序列分析 利用pQE-30的通用引物,由北京晨绿公司进行测序后进行序列分析。测序结果与文献〔3〕报道一致,见图3。
图3 ipaB基因的序列图谱
存在于志贺菌中214 Kb大小的毒力质粒上的一个大小为31 kb大小的编码Ipa/mxi-spa蛋白的致密基因被认为是志贺菌的毒力岛(PAI)。PAI编码着与侵袭相关的多数基因,其中侵袭性相关基因(Ipa)B,C,D是重要组成成分之一〔7-8〕。志贺菌致病的第一步是侵入肠上皮细胞,毒力质粒上位于同一转录单位的ipaBCD的表达产物IpaBCD为志贺菌侵入上皮细胞所必需的。其中,IpaC与IpaB形成可溶性复合物IpaB-IpaC。IpaB-IpaC复合物可能与位于上皮细胞基底面整合素α5β1结合,诱发靶细胞内蛋白激酶活性改变,发生信号级联放大作用,从而介导志贺菌的入侵〔9-10〕。所以,IpaB在志贺菌入侵肠上皮细胞中的作用很重要,有必要对其进行深入研究。
本实验选择福氏志贺菌毒力质粒上编码的侵袭蛋白基因ipaB作为研究对象,并成功地将该基因扩增、克隆到原核表达质粒pQE-30中,构建了pQE-ipaB重组质粒,这将为进一步研究IpaB的表达及免疫学功能,以及研究细菌性痢疾的发病机制提供依据。
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Cloning and Sequencing of IpaB Gene of Shigella flexneri
WANG Guofu,BAI Li,XUE Shipeng,WU Lixian*
(Pre-clinical College,Dali University,Dali,Yunnan 671000,China)
Objective:To clone and sequence of ipaB gene of Shigella flexneri.Methods:IpaB gene was amplified by PCR.The DNA products of ipaB were inserted into a prokaryotic expression vector pQE-30,and then translated into E.coli strain Top10,restriction digestion and sequencing.Results:The recombinant plasmid was constructed and ipaB gene was sequenced as 1 743 bp,conformity with expectation.Conclusion:The results indicated that recombinant plasmid was constructed successfully.
Shigella flexneri;ipaB gene;cloning;assay;conformity
R373[文献标志码]A[文章编号]1672-2345(2012)03-0028-03
云南省教育厅科研基金重点资助项目(2009z0078)
2011-12-05
王国富,副教授,主要从事医学微生物与免疫学研究.
*通信作者:吴利先,教授.
(责任编辑 董 杰)