宫颈癌组织中HPV16型E6/E7序列突变分析*

2012-06-06 13:24张志珊庄建良李爱禄蒋燕成
中国人兽共患病学报 2012年6期
关键词:危型变异氨基酸

张志珊,庄建良,李爱禄,蒋燕成

宫颈癌与人类乳头状瘤病毒(HPV)的感染密切相关。HPV属于性传播疾病病原体,目前已鉴定出100多种基因亚型,其中至少有40个类型的HPV可以感染生殖部位,根据其致癌能力的大小分为高危型、中间型和低危型两种,高危型包括HPV16、18、31、33、35、39、43、51、52、56、58、59、68、73、82等型,高危型HPV持续感染是激发宫颈上皮恶性转化的最重要危险因素,是宫颈癌及癌前病变发生发展的必要条件[1]。

HPV的基因约长8kb,主要由早期基因(E区)、晚期基因(L区)和长控制区(LCR)组成,E区有6个开放读框(ORF),编码6个早期蛋白,即El-E7。其中E6、E7基因在细胞癌变中起重要作用。在持续感染高危型HPV病毒后,病毒基因组会整合到宿主染色体中,E6和E7基因的表达调控也受到干扰。E6、E7基因特定位点的突变会使病毒更易诱导细胞产生癌变,增大再次感染或从宿主免疫系统逃逸的机会。本文对本自泉州地区的宫颈癌组织中HPV16型的E6、E7基因的序列进行分析,探索HPV16型E6、E7基因突变情况及其与宫颈癌发生的相关性,这对于宫颈癌的防治及指导疫苗设计具有重要的意义。

1 材料与方法

1.1 标本来源及DNA的提取 35例宫颈癌组织来自2009年1月-2010年12月本院妇产科宫颈癌术后样本(经病理检查确诊),这35例标本在前期实验中,通过对HPV亚型进行分型检测后,确定为HPV16型感染。全基因组DNA的提取采用QIAGEN公司的DNA mini kit。

1.2 PCR引物的设计与合成 根据GenBank公布的 HPV16序列(EU918764),应用 Premier 5.0软件设计两对引物分别用于扩增E6、E7基因。引物由上海生工生物工程有限公司合成,引物如下:

1.3 PCR扩增 引物E6F/E6R用于扩增E6基因,E7F/E7R用于扩增E7基因。反应体系为:10×buffer 5μL,dNTP 4μL,上、下游引物(20μmmol/L)各1μL,Ex Taq酶2.5U,模板1μL,加H2O至50μL。循环条件:95℃预变性5min,95℃30s,55℃30s,72℃30s,35个循环,72℃ 延伸5min。PCR产物经琼脂糖凝胶电泳鉴定后,送上海生物工程有限公司进行测序。

1.4 序列分析 测得的序列用Sequencher软件进行编辑、校正后,使用ClustalX和BioEdit进行基因的比对和多态性分析。

2 结 果

2.1 HPV16E6基因变异分析 35例样本的E6基因均成功扩增并测序。将测序结果与HPV16型的野生株(德国标准株,基因号K02718)[2]进行对比分析,结果发现35例样本中有32例存在基因突变,突变率为91.4%。共涉及到12个位点的14种不同突变模式,其中10个位点的变异为错义突变,另外2个位点为无义突变(A131C和T241G)。突变频率最高的是178位点,35例样本中有26例由原来的T突变为G,1例突变为A,结果均导致氨基酸的转换D25E(77.1%)。其它位点突变导致的氨基酸转 换 有 E113D,L83V,L28V,S138C,T21S,R144T,S142T,Q20P,T21I,R10G。突变频率的分布见表1,E6氨基酸序列比对见图1。

表1 HPV16E6基因变异分析Tab.1 Sequence variation of HPV 16E6in cervical cancer tissue

图1 HPV16E6蛋白氨基酸序列比对Fig.1 Alignment of amino acid sequences of HPV 16E6

2.2 HPV16E7基因变异分析 35例样本中,成功测序的有28例。通过对E7基因进行比对后,共发现5个突变位点,突变位点的数量低于E6基因,突变频率与E6基因接近(89.2%)。氨基酸比对结果显示,有2个位点为错义突变,3个位点为无义突变(图2)。28例样本中有21例发生A647G突变,导致氨基酸的转换(N29S),是突变频率最高的位点(75.0%)。另有1例发生L28F的氨基酸转换。在无义突变中,突变频率从高到低分别为T846C(75.0%)、G666A(32.1%),T843C(21.4%)。突变频率分布见表2。

表2 HPV16E7基因变异分析Tab.2 Sequence variation of HPV 16E7in cervical cancer tissue

3 讨 论

HPV感染是宫颈癌的首要病因,在全世界范围内,最常见的感染亚型是HPV16型。不同的HPV16变异株具有不同的生物学活性和致癌潜能,其中某些位点的变异与宫颈癌的发生密切相关[3-4]。来自世界范围的分子流行病学资料显示,E6基因的突变增强了致癌的危险性,同时这些突变株的致癌能力具有地域性[5],Yamada等人曾报道在欧洲宫颈癌患者中,野生型E6基因(德国株)的分布频率为34%[6],随后Zehbe等人报道,在瑞士宫颈癌患者中野生型E6基因的分布频率仅为6%[3],与Pillai等人报道的印度人群中9.1%的流行率接近[7]。本次研究结果显示,35例宫颈癌患者中,有3例为野生型E6基因,仅占7.9%。在所有的E6突变位点中,报道最多的突变是T350G,不同的地域的分布频率差别较大,从2%~93.5%不等[6,8-11]。此位点的变异导致E6蛋白L83V氨基酸转换,使其对鳞状上皮和腺上皮细胞生长转化能力增强[4],与宫颈上皮内瘤样病变Ⅰ级向Ⅲ级转化有关[12]。而来自德国和俄罗斯的报道则认为L83V变异与侵润性癌无关[13-14]。本次研究发现,泉州地区 HPV16E6基因L83V变异仅有3例,占7.9%,频率最高的突变是D25E,占77.1%,其次为E113D,占11.4%。其它变异还有 L28V,S138C,T21S,R144T,S142T,Q20P,T21I,R10G。我们发现D25E变异在泉州地区宫颈癌患者中最为流行,这与以往 Wu Y[10]等人报道的65.5%,Kang[15]报道的85.2%接近。该变异在东亚人种的分布频率高显著高于其它地区,被认为是亚洲型尤其是东亚病毒分枝的特异性变异。此次研究还发现了一些以往没有报道过的变异,如T21S,Q20P,T21I,R10G,其变异的频率较低,与宫颈癌的相关性有待于进一步探讨。

本研究显示泉州地区宫颈癌患者中HPV16E7基因也存在高频率的突变(89.2%)。与E6变异位点相比,本次研究中E7的变异位点相对较少,仅发现5个位点突变。只存在2种类型的错义突变N29S和L28F,其余3种均为无义突变。突变频率最高的是A647G突变(导致N29S氨基酸转换)和T846C(无义突变),突变率均为75.0%,与 Wu Y报道的70.2%和67.1%相近[10]。在以往报道中,A647G和T846C是最常见的2种变异,但是突变的频率差别较大。对于N29S的突变率,泰国宫颈癌患者为63.0%[16],韩国为59.5%[17],德国仅为0.9%[13]。这些资料显示,N29S突变主要存在亚洲人群,而较少发生在欧洲人群中,提示E7变异具有明显的地域性。研究还发现A647G和T846C这2种突变都是同时存在同一个样本中。这个结果和熊光武[18]等人的报道一致,可能提示这是中国人群中特异的突变类型,对于研究针对中国人群的HPV疫苗提供一定的线索。

图2 HPV16E7蛋白氨基酸序列比对Fig.2 Alignment of amino acid sequences of HPV 16E7

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