一种新的DNA序列进化距离的修正方法

邢林林　郭茂祖　王娟

摘要： 进化树是推演生命历史的一个重要工具。在构建进化树的所有算法中，基于进化距离的算法是其中研究的重点。但是，这一方法较为严重地依赖着距离矩阵的质量。人们开发了多种基于生物事实的进化模型来改进距离矩阵的构建过程，很大程度上提高了进化距离的准确性。同时，也提出了许多方法来检测距离矩阵的质量。文中提出了基于模型的距离以及p距离，采用一种组合的新距离的方式来构建距离矩阵。同时采用直接检测距离矩阵的统计学计分方法以及构建进化树，对比实验结果表明文中的方法实用且有效。

关键词：

中图分类号：TP391文献标识码：A文章编号：2095-2163（2012）04-0035-06