肠道病毒71型(EV71)感染引起手足口病并可导致神经源性疾病,而免疫受损或不成熟与EV71感染的发病率和致死率升高密切相关。Ⅰ型干扰素(IFN)是抗病毒感染的第1道防线。但小鼠模型中EV71不能促进Ⅰ型干扰素产生,且加入针对IFN-α/β的中和抗体可使病毒感染症状恶化。该过程中的分子机制尚不清楚。研究发现,EV71通过维甲酸诱导基因I(RIG-I)抑制抗病毒免疫,在病毒感染细胞中EV71可抑制IFN-β、ISG54、ISG56及肿瘤坏死因子(TNF)的表达。在病毒编码的结构及非结构蛋白中,3C蛋白可抑制病毒及RIG-I诱生的IFN-β,但不抑制MDA5的活性。EV71在哺乳动物细胞内表达时,3C蛋白通过CARD区结合RIG-I,阻止其招募IPS-1并抑制随后的干扰素调节因子3(IRF3)入核。3C蛋白RNA结合区2个位点(R84Q、V154S)突变对此无影响,点突变H40D则抑制效果消失,但与3C蛋白的酶活性无关。研究结果显示,EV71的3C蛋白通过RIG-I抑制Ⅰ型干扰素反应,这可能是EV71感染的致病机制之一。