小地老虎2种不同类型肌动蛋白基因的克隆与序列分析

2008-04-29 00:44朴冬花贺玉年
植物保护 2008年6期
关键词:序列分析肌动蛋白克隆

朴冬花 姚 磊 贺玉年 樊 东

摘要本研究以鳞翅目夜蛾科昆虫小地老虎[Agrotis ipsilon(Hufnagel)]3龄幼虫整个虫体为材料提取总RNA,利用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE),分别扩增得到2条肌动蛋白的cDNA序列Aiactin1和Aiactin2。GenBank数据库搜索及序列比对结果表明,克隆的2条肌动蛋白基因应属于2种不同类型的肌动蛋白,Aiactin1为肌肉特异型肌动蛋白,Aiactin2为细胞质特异型肌动蛋白。Aiactin1的cDNA序列含有1469个碱基,Aiactin2的cDNA序列含有1408个碱基。2条基因的cDNA序列均包括一个1131个碱基的开放阅读框,编码一个含376个氨基酸的蛋白。Aiactin1肌动蛋白分子量约为41.77ku,等电点5.22;Aiactin2肌动蛋白分子量约为41.83ku,等电点5.47。Prosite软件分析结果表明,Aiactin1和Aiactin2肌动蛋白氨基酸序列中都存在3个肌动蛋白特征片段。2个基因的cDNA序列已经登录GenBank并获得登录号。

关键词小地老虎;肌动蛋白;克隆;序列分析

中图分类号Q 785:S 433.82

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