6株核桃腐烂病菌的分子鉴定及生物学特性比较

2024-12-27 00:00:00靳启明闫成才王庆朋王喆苟长青王兰冯宏祖郝海婷
山东农业科学 2024年12期
关键词:分子鉴定生物学特性致病性

摘要:为探究核桃腐烂病菌的分类地位及生物学特性,本研究基于分子生物学方法对6株菌落形态有差异的核桃腐烂病菌进行多基因联合鉴定,并进一步探究其致病性及生物学特性的差异。系统进化树显示,44-9-2B与Cylospora melnikii聚为一支,且自举支持率为100%;菌株44-1-2C、51-1-3C与C.chrsosperma聚为一支;菌株49-2-IA、49-9-4D、53-1-3F与Valsa sordida聚为一支。致病性检测表明,44-9-2B致病性最强,也最先产生分生孢子角,其次为菌株44-1-2C和51-1-3C,最后是菌株53-1-3F。生物学特性研究表明,6株致病菌最适生长温度均为28℃,最适pH值为6,光照对6株致病菌的生长有促进作用,各致病菌的最适氮、碳源不同。该研究结果可为核桃树腐烂病的防治提供理论依据。

关键词:核桃腐烂病;分子鉴定;生物学特性;致病性

中图分类号:S436.64 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2024)12-0098-07

核桃是世界上重要的坚果和木本油料树种,面积及产量在各类干果中均居首位。中国是核桃生产大国,产量达365万t,居世界第一。新疆是核桃栽培的发源地,也是中国核桃主产区之一,种植历史悠久,主要种植在南疆,以阿克苏地区、喀什地区、和田地区为主。核桃作为中国重要的木本油料产业之一,在保护生态、促进贫困地区经济发展、实现我国乡村振兴战略等方面发挥着重要作用。

壳囊孢属(Cytospora)真菌是引起核桃等林木腐烂病的主要病原菌,树木被侵染后会出现枝枯、坏死等症状,导致树势衰弱,世界各地均有发生,能够危害的寄主多达80余种。Index Fungorum中记载了700余种壳囊孢属真菌。目前,新疆已记录壳囊孢属真菌50余种,其中金黄壳囊孢菌(Cytospora chrsosperma)在新疆的地理分布及寄主范围最广。杜琴报道引起新疆林木腐烂病的病原菌有3种(VaLsa ceratosperma、Vsordida、V.malicola);郭开发等鉴定出C.chrysosperma(有性型V.sordida)为主要病原菌:Zhao等报道了伊犁的腐烂病菌C.niea;刘础荣等研究发现新疆核桃树腐烂病的主要病原菌是V.sordida;李猛等报道了在阿拉尔鉴定出核桃腐烂病的病原菌为裂褶菌(Schizophyltum commune)。综上所述,在新疆引起核桃腐烂病的病原菌具有多样性。

本研究拟对6株菌落形态有差异的核桃腐烂病菌进行形态观察、致病性检测以及生物学特性分析,并通过多基因联合分析确认它们的分类地位及进化关系,旨在为新疆核桃树腐烂病防治提供理论参考。

1材料与方法

1.1试验材料

6株致病菌菌株分别为:51-1-3C、49-2-1A、44-1-2C、44-9-2B、49-9-4D、53-1-3F,由南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室提供。

核桃枝条采集于塔里木大学园艺试验站,核桃树品种为新翠丰,选取2年生粗细一致的健康枝条。

PDA培养基:1 L水中加入马铃薯200 g、葡萄糖20 g、琼脂15 g。

PSA培养基:1 L水中加入马铃薯200 g,蔗糖20 g,琼脂15 g。

OA培养基:1 L水中加入燕麦片30 g。

核桃组织培养基:1 L水中加入核桃枝条韧皮部20 g(煮沸30 min,纱布过滤)、酵母提取物20 g、琼脂粉15 g。

水琼脂培养基:1 L水中加入琼脂粉10 g。

1.2菌株形态学观察

用直径5 mm的无菌打孔器分别取培养3d的供试菌株菌落边缘菌饼接种于PDA培养基上,26℃条件下暗培养3d,第2天开始每天观察并记录菌丝生长情况(颜色、菌落形状、表面形态、有无子实体、表面分泌物)。

1.3菌株致病性检测

采用核桃枝条打孔接种法进行致病性验证。取粗细均匀的核桃枝条截成10-15 cm段,去除叶和芽,用0.6%的次氯酸钠溶液浸泡15-20min,用无菌水冲洗干净后在超净工作台风干。之后用石蜡封住枝条两端剪口,用打孔器对枝条打孔。将供试菌株接种于PDA平板上,26℃暗条件下培养3d,在菌落边缘处打取5 mm的菌饼,带菌丝的一面紧贴打孔部位接种于打孔的离体枝条上,接种部位用塑料薄膜包裹保湿。以空白PDA为对照。将接种枝条于26℃、保湿、黑暗条件下培养,隔天观察并记录发病情况。

1.4不同培养基及不同培养条件对菌丝生长的影响

设置PDA、PSA、OA、水琼脂、核桃组织培养基共5种培养基处理;温度设定0、10、15、20、25、28、30、35、40℃共9个处理;pH值设定4、5、6、7、8共5个处理:光照设定24 h黑暗、24 h光照、12h光照/12 h黑暗交替3种处理。以Czapek培养基为基础培养基,以乳糖、葡萄糖、可溶性淀粉分别代替Czapek培养基的碳源,以酵母提取物、牛肉浸膏、蛋白胨、硫酸铵、甘氨酸分别代替Czapek培养基的氮源,进行不同碳源、氮源试验。将6株供试菌株按1.2的方法接种到不同处理中,每个处理重复3次,3d后采用十字交叉法测量并记录菌落直径。

1.5多基因联合分子鉴定

采用郝海婷等的方法快速提取DNA,以提取的DNA为模板,利用ITS、EFl-a、TUB2和ACT的引物分别对病原菌进行PCR扩增,所用引物序列及反应程序见表1。PCR反应体系(25uL);DNA模板1 uL,2x Es Taq Master Mix 12.5uL,上、下游引物各0.3 uL,ddH20 10.9 uL。PCR扩增产物用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测后送生工生物工程(上海)股份有限公司测序。利用ACOPTools V2软件进行序列比对和基因拼接,使用MEGA11.0软件以邻接法(NJ)构建系统发育树,用1 000次重复Bootstrap检验系统发育树各分支的支持率。

2结果与分析

2.1菌株形态学观察

6株致病菌在PDA培养基上均能迅速生长,各菌落正、背面均为白色,但菌落形态有所不同(表2,图1)。其中,44-1-2C的菌落呈辐射状生长,菌丝稠密,菌落边缘周围气生丝最稠密,培养到第5天菌落表面出现米黄色液体分泌物,第8天变成绿色;44-9-2B的菌落呈辐射状生长,菌丝较稀疏,蛛丝状;51-1-3C的菌落呈辐射状生长,菌丝较稠密、雪白色、羽绒状,在第8天表面产生子实体;49-2-1A的菌落呈辐射状生长,菌丝较稀疏,部分菌落边缘会出现桔红色分泌物,第7天开始产生子实体;49-9-4D的菌落呈辐射状生长,菌丝较稀疏,出现轮纹;53-1-3F的菌落呈圆形生长,菌丝较稠稀疏且出现轮纹。

2.2菌株致病性测定

致病性测定结果表明,接种6株致病菌均可导致核桃枝条发生腐烂病。接种后8天,接种部位出现褐色、水浸状病斑,且随时间的推移向四周扩散。接种后16天(图2),接种部位变成黑色,枝条干枯。根据枝条病斑大小,6株致病菌致病力由强到弱依次为44-9-2B、44-1-2C、51-1-3C、49-2-1A、49-9-4D、53-1-3F。观察发现,菌株44-1-2C、44-9-2B在第13天产生分生孢子角,51-1-3C、49-9-4D在第20天产生分生孢子角,49-2-1A在第24天产生,53-1-3F未产生分生孢子角。

2.3菌株生物学特性比较

2.3.1培养基种类对茵丝生长的影响 由表3可知,6株致病菌均能在5种培养基上生长,但菌落直径存在显著差异。其中,44-1-2C对核桃组织培养基利用率较高,其余分离株在核桃组织培养基上生长较慢,利用率基本相同。菌株51-1-3C、44-1-2C、53-1-3F、49-9-4D对5种培养基的利用情况基本相似,在PDA培养基上生长较好。菌株49-2-1A、44-9-2B则对PSA培养基利用率较高。

2.3.2温度对茵丝生长的影响 由图3知,6株致病菌均能在15-35℃条件下生长,其中菌株44-1-2C、44-9-2B在低温(10℃)下能够缓慢生长,所有菌株在40℃高温下均不能正常生长,表明它们对高温的适应性较差。各菌株最适生长温度区间为25-30℃,最适生长温度为28℃。

2.3.3pH值对茵丝生长的影响 由图4可见,6株致病菌均能在5个pH值处理下生长,最适pH值区间值为5-6,最适pH值为6。在中性至弱酸性条件下,菌落生长好于弱碱性条件。

2.3.4光照对菌落生长的影响 6株致病菌均能在3个光照处理下生长,但不同光照处理下菌落直径存在差异(表4)。光照对各致病菌的菌落生长有明显的促进作用。

2.3.5碳、氮源对菌落生长的影响 由表5可知,6株致病菌在不同碳源、氮源培养基上均能生长,但菌落直径存在差异。其中,44-9-2B在以乳糖为碳源的培养基中生长最好;51-1-3C、49-2-1A在以葡萄糖为碳源的培养基中生长最快;44-1-2C、49-9-4D、53-1-3F在以可溶性淀粉为碳源的培养基中生长最快。致病菌株在以蛋白胨、牛肉浸膏和酵母提取物为氮源的培养基中菌落直径较大,硫酸铵、甘氨酸作为氮源不适合各致病菌的生长。

2.4多基因联合分析

选择ITS、ACT、EFl-a和TUB2的完整序列,以Diaporther vaccinii(CBS 160.32)为外群,构建多基因联合系统发育树。参考菌株序列的GenBank登录号如表6所示。结果(图5)显示,菌株44-9-2B与C.elnikii聚于一支,自举支持率为100%,表明两者亲缘关系极近:菌株44-1-2C、51-1- 3C与C.chrysosperma聚于一支,自举支持率为55%;菌株49-2-1A、49-9-4D、53-1-3F与V.sordida聚于一支,自举支持率为65%。

3讨论与结论

本研究在致病菌形态观察过程中发现,6株致病菌在PDA培养基表面形态有所不同,其中49-2-1A部分菌丝会变成桔红色,而44-1-2C产生米黄色液体。致病性测定发现,6株致病菌均能表现出致病现象,但致病强弱有所区别,44-9-2B菌株致病性最强,且最先产出分生孢子角,而53-1-3F只表现出致病性,不产生分生孢子角。

为了明确这6株致病菌的分类地位,本研究通过ITS、EFl-a、TUB2和ACT多基因联合建树,得出44-9-2B与C.metnilm聚为一支且自举支持率较高,可确定44-9-2B为C.melnikiio Norphanphoun等于2017年通过系统发育分析及形态学鉴定确定了C.melniku是一个新种,Fan等2020年在我国新疆地区首次发现该菌。44-1-2C、51-1-3C与C.chrysosperma聚为一支,49-2-1A、49-9-4D、53-1-3F与V.sordida聚为一支,上述5株致病菌自举支持率低。其原因可能是本研究选用的4种引物无法将5种菌株具体分类,需采用LSU、RPB2等更多的引物进行基因联合建树,或采用全基因组测序进行全面分析。本研究中C.melnikii(44-9-2B)为强致病菌,国内鲜有报道,可以进一步深入研究其形态特性和生态环境,探索有效的防治方法,其余5种致病菌与刘础荣等、李春艳、翟亚伟的研究结果相同。

为了探究病原菌的最适生长环境,为防控措施提供理论依据,对这6株致病菌进行生物学特性比较。结果显示:6株致病菌最适温度区间为25-30℃,最适温度为28℃,与陈晓忍的研究结果相同;6株致病菌在pH值4-8之间都能正常生长,最适pH值为6,这与翟亚伟的研究结果一致;不同光照处理下,6株致病菌均能在连续黑暗、光暗交替和连续光照条件下生长,但光照对各菌株的菌落生长有明显的促进作用,与刘应敏、刘振亚等的研究结果一致;6株致病菌均能在Czapek基础培养基及供试其他碳源、氮源培养基上生长,其中44-9-2B在以乳糖为碳源的培养基生长最好,49-2-1A、51-1-3C在以葡萄糖为碳源的培养基中生长最快,49-9-4D、53-1-3F、44-1-2C在以可溶性淀粉为碳源的培养基中生长最快。可见,各菌株最适碳源不同,这与赵颖、邢红亮等的研究结果相同;以酵母提取物为氮源最有利于各菌株的菌丝生长,其次是牛肉浸膏和蛋白胨,而硫酸铵和甘氨酸则难以被菌株利用,这与孙朝华、尹永香的研究结果一致。不同碳、氮源研究结果表明碳源对6株致病菌株生长影响较大。

综上所述,本研究对6株致病菌进行了形态观察、致病性测定、分子鉴定以及生物学特性的比较分析。结果表明,6株致病菌在PDA培养基上表现出不同的形态特征,其中49-2-1A和44-1-2C菌株差异最为显著。致病性测定显示所有菌株均具有致病性,44-9-2B为强致病性菌株,且最先产出分生孢子角。通过多基因联合建树分析,44-9-2B被确定为Cytospora metnikii,而其他5株致病菌的分类需进一步研究。生物学特性比较结果显示;6株致病菌最适温度区间为25-30℃;最适pH值为6;光照对6株致病菌生长有促进作用;不同菌株对不同碳源的利用率不同,44-9-2B对乳糖的利用率高,而其他菌株在葡萄糖或可溶性淀粉为碳源的培养基中生长最快:最佳氮源为酵母提取物。

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