基于CiteSpace的微小RNA在脑缺血再灌注损伤中的研究现状及热点分析

2024-01-12 07:17罗亚男李景炜李若冰梅志刚
中国医药科学 2023年23期
关键词:图谱可视化英文

罗亚男 李景炜 李若冰 梅志刚

1.三峡大学健康医学院国家中医药管理局中药药理学三级实验室,湖北宜昌 443002;2.湖南中医药大学中西医结合心脑疾病防治湖南省重点实验室,湖南长沙 410208

脑缺血再灌注损伤(cerebral ischemia-reperfusion injury,CIRI)是缺血性脑卒中溶栓后的二次脑损伤,具有高致残率、高病死率的特征,目前尚无统一的防治CIRI 方法[1-4],深入揭示CIRI 发病机制并寻找其潜在的干预靶点仍是研究CIRI 的热点。

微小RNA(microRNAs,miRNA)是一类普遍存在的内源性非编码单链RNA,通过调控下游靶基因和蛋白质网络的表达参与细胞增殖、分化、凋亡等生理过程[5-6]。随着对miRNA 研究的不断深入,发现其在CIRI 的发生发展过程中发挥着不可或缺的作用。目前,该领域研究越来越广泛,但相关文献冗杂,尚无有关miRNA 在CIRI 的知识图谱分析。

作为一款可视化文献分析软件,CiteSpace 能够显示一个知识域在一定时期发展的趋势与动向[7-9]。本研究运用CiteSpace 分别对国内外miRNA 在CIRI相关文献进行可视化分析,梳理miRNA 在CIRI 的研究热点及发展趋势,以期为今后相关研究者提供参考和借鉴。

1 资料与方法

1.1 检索策略

以中国知网(China national knowledge infrastructure,CKNI)和Web of Science(WoS)数据库为本研究文献来源;发表时间设定为建库至2022年6 月30 日; 以“micro RNA”“mi RNA”“mi RNAs”“micro RNAs”“miR”“脑缺血再灌注损伤”“Cerebral Ischemia/Reperfusion Injury”和“Brain Ischemia-Reperfusion Injury”为检索词进行检索。

1.2 纳入及排除标准

纳入标准:公开发表的与检索主题词相关的完整、真实可靠的研究。排除标准:信息不全、不能获得全文的文献或重复文献;会议论文、新闻报道、图书等非期刊论文。

1.3 方法

使用CiteSpace 5.8.R3 软件对纳入的文献进行可视化分析并绘制图谱。节点类型(node types)包括作者(author)、机构(institution)、关键词(keyword)。

2 结果

2.1 文献检索结果

CNKI 和WoS 初筛分别纳入496 篇和492 篇中、英文文献。删除数据不完整、会议记录和修订等非期刊论文,最后纳入165 篇中文文献、433 篇英文文献。

2.2 作者合作网络分析

中文作者合作网络图谱共有211 个节点、321条连线,提示有211 位作者被纳入分析,形成了以何灏龙、彭丽佳等为主的核心研究团队,团队间合作关系较为紧密;英文图谱共有286 个节点、394条连线,提示有286 位作者被纳入分析,形成了以LI ZHANG、HONG WANG 等为主的核心研究团队,这些核心团队内部相互合作,见图1。

图1 中、英文作者合作网络图谱

2.3 机构合作网络分析

中文文献机构合作图谱中共获得126 家研究机构,其中湖南中医药大学针灸推拿学院和昆明医科大学第一附属医院发文量最多,均为4 篇;英文文献共包含181 家研究机构,其中发文前3位的机构均来自中国,分别为首都医科大学(13篇)、重庆医科大学(11 篇)和郑州大学(10 篇)。见图2。

图2 中、英文文献机构合作图谱

2.4 关键词共现分析

中、英文关键词共现网络分别由121 个节点、183 条连线和287 个节点、977 条连线组成。根据关键词共现频次筛选分析,该领域侧重于miRNA 对CIRI 作用机制的探索,包括凋亡、氧化应激、自噬、炎症;干预手段以针刺、电针为主;基础研究、综述为主要文献形式,见图3。深入挖掘关键词共现网络中出现的miRNA,有近百种(表1),提示这些miRNA 为CIRI 中的研究热点。

表1 中、英文文献出现频次前5位的miRNA

图3 中、英文文献关键词共现图谱

2.5 关键词聚类分析

CNKI 和WoS 图谱中聚类模块指数Q>0.3、轮廓指数S>0.7,说明聚类板块是显著的。中文文献获得凋亡(#0)、大鼠(#1)、针刺(#2)等6 个主要聚类标签;英文文献显示down-regulating ddr1(#0)、injure-induced cell apoptosis(#1)等11 个主要聚类标签,代表了miRNA 在CIRI 的主要研究方向,见图4。

图4 中、英文文献关键词聚类图谱

3 讨论

随着测序技术和生物信息学分析的发展,miRNA 在CIRI 中的作用逐渐受到众多学者的广泛关注,文献年发文量持续增长。近年来活跃在国内期刊的学者何灏龙主要研究miRNA 在针刺改善CIRI 中的调控作用[10-11],彭丽佳则主要研究miRNA 在CIRI 中的机制探讨[12]。

关键词可以反映当前研究现状及预测未来热点趋势[13]。综合分析关键词共现及聚类图谱,发现目前对miRNA 在CIRI 中的机制调控、干预方法、文献类型等方面均展开了研究。该领域在机制探索上非常广泛,miR-155、miR-29 等是国内外文献中重点关注的miRNA。Shi 等[14]发现MiR-155-5p 通过调节NF-κB 和MAPKs 通路靶向DUSP14 加重CIRI。相关研究[15]发现外泌体内miRNA 作为细胞间的交流信使,在CIRI中发挥着不同作用,Xu 等[16]发现神经元通过分泌含有miR-132 的外泌体作用于血管内皮细胞Eef2k 基因,增强血管完整性。因此,研究外泌体内miRNA 的作用靶点、调控机制以及特异性分子标志物可能会为CIRI 的诊疗带来新的突破。调控miRNA 可作为CIRI 的潜在治疗靶标,根据它们在CIRI 发展中的不同作用,除了通过siRNA[17]、过表达[18]、shRNA[19]等多种技术手段,还可通过一些治疗方法在体内外模型上得到验证,如针刺[20]、电刺激[21]、左旋樟脑[22]、缺血预处理[23]等。Zhang等[24]发现电针通过外泌体miR-146b 促进内源性神经干细胞分化;Yao 等[25]发现人参皂甙可能通过miR-139-5p/FoxO1/Keap1/Nrf2 轴的抗焦亡作用改善CIRI。可见,调控miRNA 的研究为当前改善CIRI 提供了相关的靶点,但miRNA 在CIRI 中的作用还没有详细的报道,其在神经元或脑组织相关信号通路中的协调或拮抗作用机制还需进一步研究。在研究类型上,国内外均以基础研究、综述为主。基础研究主要集中在MCAO/R 模型和OGD/R 细胞模型,其在临床上的应用仍需更高水平的临床证据支持。

本研究使用CiteSpace 软件对CIRI 相关文献中的miRNA 进行可视化分析,初步展示了该领域的研究现状及发展动态,但也存在一定的局限性。由于软件阈值设置的主观性,关键词突现统计结果可能存在一定片面性。随着可视化软件不断完善,将进一步深入挖掘,以便更加科学、严谨地探讨miRNA 在CIRI 的研究热点及趋势。

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