尽管全身性抗生素治疗在控制感染、降低发病率和死亡率方面至关重要,但据推测,抗生素的过度使用会导致负面影响,如对抗药性微生物的选择和对共生微生物的附带损害。在一项对4种临床相关抗生素治疗方案[强力霉素(20 mg或100 mg)、头孢氨苄或甲氧苄啶/磺胺甲噁唑(TMP/SMX)]的前瞻性随机研究中,研究人员调查了健康志愿者全身使用抗生素后皮肤上的微生物变化。在使用抗生素之前、期间和之后1年内,从不同的皮肤和口腔部位以及粪便中收集样本,并进行鸟枪宏基因组测序。分类分析表明,与接受其他方案或未经治疗的对照组相比,接受100 mg强力霉素和TMP/SMX的受试者的皮肤微生物群落发生了更大的变化。在抗生素治疗后,口腔和粪便微生物群也出现波动。细菌培养结合全基因组测序显示,在分别接受强力霉素100 mg或TMP/SMX治疗的所有受试者中,分别存在携带tetK或tetL和dfrC或dfrG基因的抗生素耐药葡萄球菌的特异性出现、扩增和持续存在现象。最后,宏基因组数据分析显示参与基因动员的基因增加,表明微生物对抗生素产生了应激反应。总的来说,这些发现证明了抗生素对皮肤微生物群落的直接、持久的影响,强调了皮肤微生物群是抗生素耐药性发展和持续存在的位点以及过度用药的风险。