钦州市36656份上呼吸道标本新型冠状病毒核酸检测结果分析

卓训妮

摘要：目的：了解钦州市新型冠状病毒肺炎感染情况，为疫情防控工作提供依据。方法：采用实时荧光RT-PCR法对钦州市2020年各县（区）和海关送检的标本进行新型冠状病毒核酸检测，收集阳性病例流行病学调查资料，统计分析检测结果。结果：在36656份上呼吸道标本中，共检出新型冠状病毒核酸阳性10例，其中8例为无国外旅行史人员，检出率为0.02%（8/36273），2例为输入性外籍船员，检出率为0.52%（2/383），两类人群检出率比较有统计学意义（P<0.01，X2=34.760）。10例阳性病例中，男性7例，女性3例，男女比为2.33∶1;最小年龄12岁，最大年龄50岁;轻型2例，普通型4例，无症状感染者4例，无死亡病例。本地8例病例中，6例为家庭聚集性病例。结论：入境船员是高危人群，应密切联系港口相关部门，加强监测，及时发现和隔离阳性病例，加强疫情防控知识宣传，开展群防群控，防止疫情爆发流行。

关键词：新型冠状病毒;核酸;实时荧光定量PCR;检测;分析

Abstract： Objective： to understand the infection situation of COVID-19 in Qinzhou and to provide basis for epidemic prevention and control. Methods： real time fluorescence RT-PCR was used to detect COVID-19 nucleic acids in samples collected from counties （districts） and customs in Qinzhou in 2020， and the epidemiological data of positive cases were collected， and the results were analyzed statistically. Results： among the 36656 upper respiratory tract specimens， 10 cases were found positive for COVID-19 nucleic acid， 8 of them were non foreign travel history personnel， the detection rate was 0.02% （8/36273）， 2 cases were imported foreign sailors， the detection rate was 0.52% （2/383）， and the detection rate of two groups was statistically significant （P< 0.01， x2=34.760）. Among the 10 positive cases， 7 were male and 3 were female， the ratio of male to female was 2.33∶1; The youngest was 12 years old and the oldest was 50 years old; There were 2 mild cases， 4 common cases， 4 asymptomatic cases and no death cases. Among the 8 local cases， 6 were family cluster cases. Conclusion： the entry crew is a high-risk group， we should closely contact the relevant departments of the port， strengthen monitoring， timely detect and isolate positive cases， strengthen the publicity of epidemic prevention and control knowledge， carry out group prevention and control， and prevent the outbreak of the epidemic.

Keywords： COVID-19; Nucleic acids; Real time fluorescence RT-PCR; Test; Analysis

一、前言

新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎，COVID-19）为新发急性呼吸道传染病，由新型冠状病毒（2019-nCoV）引起[1]，目前已肆虐全球。据世界卫生组织统计数据，截至2021年4月8日，全球累计新冠肺炎确诊病例1.324亿例，累计死亡病例2875672例，新冠肺炎已严重危害人类的身心健康和社会的经济发展。本实验室自疫情爆发以来，积极开展病原检测工作，应用实时荧光RT-PCR法对钦州市疑似新冠肺炎病例及其他排查者标本进行检测，截止2020年12月31日，共完成36656份上呼吸道标本新型冠状病毒核酸检测。本文对2020年本市各县（区）及海关送检标本的核酸检测结果进行统计分析，了解钦州市新型冠状病毒肺炎感染情况，为进一步做好疫情防控提供依据。

二、材料与方法

（一）标本来源及保存

所有标本来自钦州市辖区内各市縣（区）和海关，于2020年1月21日至2020年12月31日冷藏送至本中心实验室的疑似新冠肺炎病例和其他排查者标本，共36656份，其中36088份为咽拭子标本，568份为鼻咽拭子标本;无境外旅行史人员标本36273份，入境船员标本383份;在24 h内检测的标本置于4℃保存，24 h内无法检测的标本置于-70℃或以下保存。

（二）病毒RNA提取试剂

采用西安天隆科技有限公司生产的RNA提取试剂盒。

（三）病毒核酸检测试剂

采用上海伯杰医疗科技有限公司2019新型冠状病毒（ORFlab/N基因）核酸检测试剂盒（双重荧光PCR法）。

（四）检测方法

依据国家卫生健康委办公厅发布的《新型冠状病毒实验室生物安全指南》（第二版）[2]和《新型冠状病毒肺炎防控方案》[3]进行生物安全防护和实验操作，采用实时荧光RT-PCR法进行检测，严格按试剂说明书操作，结果判读以试剂盒说明书为准。

（五）主要仪器设备

1. ABI7500型荧光定量PCR仪。

2. NP968-C西安天隆核酸提取仪。

3. 恒温水浴箱。

（六）质量控制

每次实验均设阳性对照、阴性对照和外部质控，阴性对照Ct值>38或未检出，阳性对照的扩增曲线呈S型，且Ct值≤30，同一实验必须满足这两个条件，否则实验结果视为无效;样本内标须正常检出，有明显的S线。所有阳性标本均上送广西壮族自治区疾病预防控制中心复核确认。

（七）结果判读

严格按照《新型冠状病毒肺炎防控方案》附件6新型冠状病毒肺炎实验室检测技术指南[3]判定，实验室确认阳性病例需满足以下两个条件中的一个：第一，同一份标本中新型冠状病毒2个靶标（ORFlab、N），实时荧光RT-PCR检测结果均为阳性，如果出现单个靶标阳性的检测结果，则需要重新采样，重新检测。如果仍然为单靶标阳性，判定为阳性。第二，两种标本实时荧光RT-PCR同时出现单靶标阳性，或同种类型标本两次采样检测中均出现单个靶标阳性的检测结果，可判定为阳性。结合试剂盒说明书，由Ct值大小及扩增曲线图进行判断：Ct值>38或未检出，判为阴性;当扩增曲线呈S型，且Ct值≤ 35，判为阳性;当扩增曲线呈S型，且35MNzfaiBvD1eJJTj4YC6T6Q56Q+DiXQRJykptb1vOknY=