担子菌门(BasidiomycotaR.T.Moore 1980)真菌是以食药用菌为代表的大型真菌最主要的种类构成,也包括植物病原菌锈菌和黑粉菌,还有酵母菌等,其物种数占真菌界的1/3,有4万余种。该类群所涉及的食用菌产业自2014年就已成为农业第5大种植业,药用菌的活性产物开发前景广阔。然而由于种类繁多、分类历史悠久、大量新类群的发现引发分类系统巨大变革,阻碍了相关资源的认识进程。为此,中国科学院微生物所赵瑞琳团队集结近10年来担子菌门分类研究的新进展,首先在多基因及基因组层面对整个门的系统发育关系开展研究,并估算了目前担子菌门内亚门、纲、目、科的演化时间,具体包括:6个基因(LSU、SSU、5.8s、rpb1、rpb2、ef1)的多基因系统发育图谱、116个代表种的396个直系同源基因的系统发育基因组图谱研究及771个代表种分子钟分析推算了科和科以上的分类阶元的演化时间。为建立担子菌门标准化分类系统中的各分类等级的演化时间标准提供了依据。
此外,在理清担子菌门内主要进化支序的系统发育关系基础上,赵瑞琳团队联合27国专家对担子菌门中已知的3 198个属名进行梳理;同时还整理提供了每个合法属的各类信息,包括分类地位、物种数、模式种、生活类型、生境、分布地、DNA数据以及系统发育等,进一步完善分类系统的各类信息。获得目前最完整的担子菌门分类系统:包括4亚门、18纲、68目、241科、1 928属,共41 270个种(分别增加1亚门、2纲、14目、64科、337属和9 755种)。研究成果于2019年11月发表于《Fungal Diversity》上。
以该研究成果为基础的网站https://www.basidio.org正在建设中。该网站将持续对担子菌门分类系统进行维护和更新,实现大型真菌(蘑菇)为主的这一大类真菌的分类系统的整体性呈现,不仅为分类学家,而且为资源的利用者、生态学家等提供巨大的便利。