新冠病毒或与“近亲”差异更大并有两亚型

中科院上海巴斯德研究所和北京大学等机构的研究人员，合作分析了新冠病毒的起源与持续演化。研究发现，虽然基因组分析表明，新冠病毒最接近云南中菊头蝠携带的RaTG13，但它们在中性位点上的差异远高于此前的认识，而且新冠病毒分化出了两个亚型。相关论文刊登于《国家科学评论》。

研究人员调查了新冠病毒和其他相关冠状病毒的分子差异程度。结果发现，虽然新冠病毒和蝙蝠SARS 相关冠状病毒（RaTG13）之间的基因组核苷酸只有4%的变异，但两者中性位点的差异为17%，表明这两种病毒之间的差异比之前估计的要大得多。

该研究结果表明，新冠病毒和穿山甲SARS 冠状病毒突刺蛋白的受体结合域功能位点之所以出现新变异，除了重组外，还可能是由突变和自然选择引起的。

研究人员还对103 个新冠病毒基因组进行了群体遗传分析。研究人员发现这些病毒株已发生了149 个突变点，而且大多数衍生突变是单基因突变，这表明它们要么是最近发生的，要么是种群增长的结果。

此外，新冠病毒可能进化成了两种主要亚型——L 型和S 型，这两种类型由两个不同的单核苷酸多态性（SNP）明确定义，这表明到目前为止已测序的病毒株之间几乎完全有联系。

虽然L 型（占比约70%）比S 型（约30%）更普遍，但是研究人员发现S 型是原始版本。虽然L 型在武汉新冠肺炎暴发的早期阶段更为流行，但在2020 年1 月初之后，L 型的出现频率有所下降。

研究人员猜测，人类的干预可能对L 型施加了更严重的选择压力，因为L 型可能更具侵略性、传播速度更快。另一方面，S 型的进化时间更长、攻击性更弱，可能由于受到的选择压力相对较弱而增加了相对出现频率。

专家认为，这些发现表明，有必要对新冠病毒感染者的临床症状、基因组数据、流行病学数据等进行进一步的、即时的、全面的研究。