试纸型生物传感器检测病原微生物的研究进展*

2020-02-12 17:50胡柳杨综述曹东林审校
检验医学与临床 2020年6期
关键词:试纸病原体病原

胡柳杨,韩 冰 综述,曹东林 审校

广东省第二人民医院检验医学部,广东广州 510317

当今感染性疾病仍是引起人类死亡的主要原因,开展病原微生物的现场快速检测对疾病的治疗和预后尤为重要。目前,临床上主要使用的呼吸道病原体检测方法包括显微镜检查、细菌培养和免疫学试验,这些方法操作过程烦琐,耗时长,具有一定技术难度,灵敏度较低。随着分子生物学技术的飞速发展,DNA G+C mol%测定、特异探针杂交技术、PCR技术扩增特异核酸片段、16SrRNA序列分析、限制性片段长度多态性分析及生物芯片等技术被应用于病原微生物检测,这些方法的灵敏度和特异度高,并且能做到快速检测,但都依赖于昂贵的仪器设备及经过培训的实验室技术人员,这使其在小型社区医院及偏远地区的应用受到限制。生物传感器技术是近年来发展迅速的病原微生物检测方法,具有快速、灵敏、成本低、易于自动化的优点,用于病原体检测的主要有免疫传感器和DNA生物传感器[1]。其中DNA生物传感器可以特异性地识别病原微生物的特异核酸序列,已受到越来越多的关注。DNA生物传感器的一般原理包括将DNA探针固定在传感器表面,通过电化学[2]、光学[3]或重量法[4]进行杂交和检测。越来越多的DNA生物传感器被设计用于病原微生物的即时诊断,试纸型生物传感器——基于纸张的微流体生物测定几乎符合即时诊断设备的所有关键标准[5],即不需要复杂的设备、试剂或电源,灵敏且准确测定,并且检测快速、成本低,易于使用和运输。本文阐述了试纸型生物传感器的工作原理、应用研究和最新进展,并探讨其在病原微生物现场快速检测中所面临的挑战和发展趋势。

1 试纸型生物传感器的原理

1.1试纸型免疫生物传感器 试纸型免疫生物传感器[6]的试纸条依次由样品垫、缀合垫、硝酸纤维素膜和吸收垫组成,硝酸纤维素膜和吸收垫以重叠方式附着在塑料背衬上,以促进毛细管流动。试纸型免疫生物传感器各组成部分的作用分别为[6]:塑料背衬提供稳定性和黏合性;硝酸纤维素膜分别固定单克隆抗体和多克隆二抗,用于测试和对照;硝酸纤维素膜的一端是吸收垫,其与硝酸纤维素膜部分重叠,为毛细管流动提供驱动力;试纸条的最前端是样品垫;在样品施加端末放置缀合垫,由纤维素制成并用信号发生基团标记的特异性多克隆抗体处理。该生物传感器由检测线、对照线和控制线3部分组成,试纸条上的条带颜色取决于信号发生基团的颜色。目前试纸型免疫生物传感器多数以纳米金粒子作为信号发生器,纳米金粒子在520 nm处有等离子体共振峰,表现为特征性红色。待测样品在样品垫被加载,然后经毛细管作用沿着条带移动,并在最后的吸收垫处被收集,样品移动到缀合垫时,待测物质与多克隆抗体结合形成待测物质-信号基团-多克隆抗体复合物,当样品移动到测试区时,特异性的单克隆抗体捕获待测物质-信号基团-多克隆抗体复合物,信号基团在检测线中累积,呈现肉眼可见的条带,条带颜色的强弱与待测物质的含量呈正比。在测试区捕获复合物后,未结合的成分(包括过量的信号基团-多克隆抗体)和流体部分继续沿着条带流动,通过多克隆二抗在对照区捕获未结合的信号基团-多克隆抗体显色。控制线始终显色,以保证试纸型生物传感器的正常功能。

1.2试纸型DNA生物传感器 试纸型DNA生物传感器的试纸条组成与试纸型免疫生物传感器大致相同,但不同于试纸型免疫生物传感器,试纸型DNA生物传感器的检测不依赖于抗原-抗体的特异性结合。试纸型DNA生物传感器将PCR与生物传感器组合成一个系统,作为一种简单快速的PCR后分析工具,与琼脂糖凝胶电泳相比,灵敏度更高,并且检测更加简单和快速。试纸型DNA生物传感器的一般原理包括将DNA探针固定在传感器表面,通常将对捕获DNA扩增子具有极强亲和力的特定寡核苷酸序列或免疫物质(例如:半抗原-抗体和半抗原-蛋白质)作为DNA探针。目前大多数试纸型DNA生物传感器通过使用金纳米粒子[7-11]和有色聚苯乙烯微球[9]作为信号发生器来进行DNA的显色检测。试纸型DNA生物传感器不仅可以定性检测,还能进行半定量分析,定量数据可以通过仪器进行强度读数或通过与酶[8]、荧光染料[12-13]或放射性偶联物[14]的额外偶联来记录。试纸型DNA生物传感器分为检测区、对照区和控制区3个部分,传感器表面的探针结合扩增的DNA,信号发生基团在检测区累积,出现肉眼可见的条带,当在低于饱和浓度的分析范围内测试DNA产物的量时,强度与靶DNA的量呈正相关,从而提供了靶DNA的定量信息[7]。

2 试纸型生物传感器的优点

试纸型生物传感器的优点:(1)大部分DNA生物传感器需要使用仪器,并且在大多数情况下,涉及几个孵育和洗涤步骤。试纸型DNA生物传感器不需要复杂的设备、试剂或电源,无须使用仪器即可直观检测DNA。此外,试纸型生物传感器无须多次孵育和洗涤,并最大限度地降低对实验室人员的要求。(2)具有良好的灵敏度和特异度。YETISEN等[5]证实试纸型DNA生物传感器对PCR产物的检测灵敏度是溴化乙啶电泳的50倍及以上,并且高于普通杂交。(3)试纸型生物传感器可运行在多重反应系统上。试纸型免疫生物传感器可以根据不同的需求在一个条带上固定不同病原微生物的特异性抗体,实现病原体的多重检测;试纸型DNA生物传感器可以在一个条带中检测到多个扩增的靶基因DNA片段,不同探针分别用寡核苷酸或免疫物质(例如:半抗原-抗体和半抗原-蛋白质)标记,在临床使用时,可根据不同需求,选择特殊组合的探针,实现个体化核酸检测。(4)检测快速、体积小巧、一次性检测、检测成本低、易于使用和运输。试纸型免疫生物传感器无须对样品进行任何预处理,样品点样后5 min内完成检测[6];试纸型DNA生物传感器在PCR扩增后15 min内可得到结果[7-9]。这些特性使得它更适用于在检验设备缺乏的小型实验室和需要快速检测的现场进行即时检测。

3 试纸型生物传感器在微生物病原体检测中的应用

试纸型生物传感器平台可根据不同需求进行相应的构建,可对不同的病原体进行多重、快速、准确、可视化检测,在病原微生物及抗菌药物耐药分析中具有巨大的应用潜力。现将试纸型生物传感器在病原微生物检测中的应用总结如下。

3.1病毒性病原体的检测 LILES等[15]应用试纸型生物传感器检测登革病毒并评估其检测的灵敏度和特异度,该方法在检测登革热感染方面比Taqman RT-PCR更敏感,证实了这种方法也适用于使用反转录DNA模板检测登革病毒。KOIWAI等[16]基于试纸型DNA生物传感器建立了一种同时对3种常见的病毒(包括感染性肌坏死病毒、桃拉综合征病毒和黄头病毒)进行快速检测的新方法,这3种病毒中的每种病毒均具有与常规PCR相同的灵敏度,且能产生更清晰的显色结果并且能够1次检测3种病毒。试纸型DNA生物传感器被应用于筛查、确定宫颈癌标本中是否存在人乳头瘤病毒16型(HPV16),测试结果与这些癌症的表征匹配率为100%[14]。GLYNOU等[7]应用寡核苷酸功能化金纳米粒子作为干试剂条带生物传感器中的探针用于DNA杂交分析,并检测来自人血浆的丙型肝炎病毒RNA的RT-PCR产物,检测效率比琼脂糖凝胶电泳高8倍,该研究者发现条带传感器对靶DNA的检测明显更快,与琼脂糖凝胶电泳和其他技术检测所需的时间相比更短,仅需10 min。

3.2细菌性病原体的检测 试纸型DNA生物传感器被应用于检测食源性病原体霍乱弧菌。在一项对174株霍乱弧菌和非霍乱弧菌进行临床评估的研究中,与常规琼脂糖凝胶电泳DNA检测相比,试纸型DNA生物传感器的灵敏度和特异度均为100%[9],证明它是琼脂糖凝胶电泳分析的可行替代品,易于使用,且能一次性使用,不需要任何专门的设备且无须使用致癌化学品。ANG等[10]建立了新型序列特异性核酸侧向流动试纸型生物传感器,用于检测引起腹泻的产毒性霍乱弧菌的霍乱毒素基因,并且在几分钟内得到快速的显色结果,而无须在高温下多次洗涤或孵育。KALOGIANNI等[11]建立了能同时检测大肠埃希菌和金黄色葡萄球菌的双色试纸型DNA生物传感器,该传感器能够较为快速地实现对这两种常见细菌的检测。LI等[6]描述了能用于铜绿假单胞菌和金黄色葡萄球菌特异性检测的多重免疫传感器的制造过程和测试结果。目前的即时检测平台都不能同时检测多重细菌,但该试纸型免疫生物传感器可用于快速检测多重细菌的感染因子,对于每种测试的感染因子,传感器都显示出了高特异性和500~5 000 CFU/mL的检测范围。 HAYASHI等[17]用试纸型DNA生物传感器实现了包括肠道沙门菌、志贺菌、肠侵袭性大肠埃希菌和肠出血性大肠埃希菌在内的4种食源性病原体的快速筛查,能够帮助确认安全的食品进入市场。TIAN等[18]建立了能够多重检测口腔微生物群的试纸型DNA生物传感器,实现了对口腔常见微生物的五重分析,并对其进行了半定量分析。接着,该研究者应用试纸型DNA生物传感器多重分析了口腔斑块中与龋齿相关的常见细菌的五元亚群[19],表明该一次性试纸型DNA生物传感器在分析口腔微生物组成以及微生物亚群的即时诊断方面具有巨大潜力。试纸型DNA生物传感器可用于细菌性鼻窦炎相关细菌的检测[20],改进该传感器对细菌性鼻窦炎和支气管炎的诊断具有潜在价值。在过去30年中,细菌变异、抗菌药物的不合理使用以及感染控制方面的问题,导致耐药菌株的增加和播散,SHANMUGAKANI等[21]建立了一种能直接在粪便标本中多重检测碳青霉烯酶基因的试纸型DNA生物传感器平台,能在2 h内直接在粪便标本中多重检测blaNDM、blaKPC、blaIMP 和blaOXA-48等碳青霉烯酶基因。因此,试纸型DNA生物传感器是可以应用于耐药基因检测的一种价格合理、快速的即时检测工具。OHSHIRO等[22]开发了一种快速的试纸型PCR-DNA生物传感器用于鉴定阳性血培养瓶中的金黄色葡萄球菌和抗菌药物耐药基因mecA和blaZ,整个过程可在1 h内完成。由于该方法与常规PCR方法相比,非常快速和简便,并且与实时PCR或全自动装置相比,更为经济,证实其所提出的试纸型DNA生物传感器技术可应用于快速诊断甚至应用于社区医院等检测仪器缺乏的地方。

4 试纸型生物传感器技术的前景展望

试纸型生物传感器技术平台为临床诊断中的多重分析及标本半定量分析提供了简单、快速的检测手段。由于试纸型生物传感器小型化、便携、检测成本低、无须孵化和洗涤步骤、快速且灵敏度高、特异性强等优点,试纸型生物传感器已被用于种植业[23]、水产业[16,24]、食品安全[17]、医疗卫生[18-19]等领域。

目前试纸型生物传感器在病原体检测方面的研究仍处于初期阶段,国内相关研究相对较少,用于临床检测也有一定的局限性,主要包括:(1)试纸型生物传感器测定细菌仅提供相对丰度,其不一定能反映细菌的实际量;(2)试纸型DNA生物传感器仅能对有限物种进行分析,因为该方法依赖于物种特异性引物的PCR扩增,而目前与人类疾病相关的微生物序列信息没有被完全破解或公布,其应用会受到一定的限制;(3)试纸型生物传感器检测到的细菌可能并不直接参与疾病的发病;(4)试纸型DNA生物传感器多重检测平台的建立要克服多重PCR的难题,因此较难实现高通量检测。随着试纸型生物传感器信号处理技术、探针技术以及多重PCR技术研究的不断深入,试纸型生物传感器在医疗设备不齐全的社区医院、偏远地区医院,以及在基因分型、病原微生物检测等方面将有着较好的应用前景。同时可以预见,试纸型生物传感器在现场即时检测方面也将有着广泛的应用前景。

5 小 结

综上所述,试纸型生物传感器不需要复杂的设备、试剂或电源,具有良好的灵敏度和特异度,并且检测快速、体积小巧、检测成本低、易于使用和运输,是适用于小型实验室和现场即时检测呼吸道病原体的理想平台。

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