不容小觑的新型猪圆环病毒:中国部分地区PCV3分子流行病学调查

2019-01-10 21:19:02QiShan-shan,SuMing-jun,GuoDong-hua
中国预防兽医学报 2019年2期
关键词:圆环毒株消化道

猪圆环病毒3型(PCV3)作为一种新发现的圆环病毒,对养猪业的威胁持续升级。PCV3属于圆环病毒科、圆环病毒属,是一种无囊膜的环状DNA病毒。PCV3基因组由编码复制酶蛋白(Rep)和衣壳蛋白(Cap)的2个ORFs组成。其中,Cap蛋白在诱导宿主特异性免疫应答过程中发挥重要作用。2015年,美国学者Palinski等在患有猪皮炎肾病综合征和繁殖障碍母猪及其流产胎儿体内首次分离鉴定了PCV3。随后,中国、巴西、意大利、韩国、泰国、西班牙、丹麦、德国、瑞典和波兰等国家,陆续报道了PCV3感染病例。

2017年,何启盖等首次报道PCV3在中国猪群中存在。此后,PCV3在中国的流行情况及其遗传进化特性成为研究热点。近期发表于《Transboundary and Emerging Diseases》的论文对PCV3分子流行病学进行了系统研究。该研究对2015年~2017年来源于中国174个猪场的616份样品(患有消化道疾病样品480份、患有呼吸道疾病样品94份、健康样品42份)进行了PCR检测和基于cap基因的遗传进化分析。结果显示,PCV3阳性率为12.2%,其中在呼吸道疾病样品中阳性率为26.6%,在消化道疾病样品中阳性率为10.4%。统计分析显示,PCV3感染与消化道疾病和呼吸道疾病均呈高度相关性(p<0.05)。鉴定的51个PCV3毒株cap基因与PCV3参考毒株序列的核苷酸同源性为97.1%~99.8%。

为了分析PCV3 Cap蛋白的氨基酸序列差异性,该研究将鉴定的51个PCV3毒株分别与国内、国外以及全球范围的PCV3参考毒株的Cap蛋白进行比较与分析。结果显示,该研究鉴定的51株PCV3 Cap蛋白序列中共有17个氨基酸突变位点,其中R10K、A24V、R27K、T77S、F104Y、I150L是全球范围PCV3共性的氨基酸突变位点。根据Cap蛋白A24V和R27K两个突变位点,可将51个PCV3毒株划分为 PCV3a(A24和 R27)、PCV3b(A24和 K27)和 PCV3c(V24和K27)。51个PCV3毒株Cap蛋白氨基酸突变表现为两个特征:①氨基酸突变主要位于1~30区域;②氨基酸高频突变位于8~10、24、27、77、137和150位点。进化树分析结果显示,PCV3a(29.4%)主要在华中地区流行,PCV3b(41.2%)主要在东北地区流行,PCV3c(29.4%)在中国东北、华东、华南、西南、华中和华北地区均有流行。该研究提出,PCV3 Cap蛋白特定的氨基酸突变对该病毒基因分型有一定意义。

该研究揭示了2015年~2017年中国部分地区PCV3感染情况及其遗传演化特征,证实了PCV3呈现较高的感染率和遗传多样性,并与猪消化道疾病和呼吸道疾病具有关联性,为PCV3分子流行病学等相关研究提供了有价值信息。

评述论文来源:Qi Shan-shan,Su ming-jun,Guo Dong-hua,et al.Molecular detection and phylogenetic analysis of porcine circovirus type 3 in 21 provinces of China during 2015-2017.Transbound Emerg Dis,2019 Jan 13.DOI:10.1111/tbed.13125.

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