虽然党的七届二中全会已决定定都北平,但“最后决定还得召开政治协商会议”。只有经过新政协会议表决通过,定都北平才具有合法性。
1949年6月15日,新政治协商会议筹备会第一次全体会议在北平中南海勤政殿开幕。会议决定成立以毛泽东为主任的新政协筹备会常务委员会,下设立六个小组。其中,第六小组组长马叙伦,叶剑英、沈雁冰任副组长,负责拟定国旗、国徽、国歌和国都方案。从6月中旬至9月14日,第六小组共召开全体会议四次、座谈会多次。组员们对国旗、国歌方案均有不同意见,争论较大,但关于国都问题“大家一致意见建都北平,改称北京,这个问题没有不同意见”。
9月21日,中国人民政治协商会议第一届全体会议在中南海怀仁堂开幕。9月23日,全体代表分作11个小组讨论新政协筹备会第六小组提出的国旗、国都和纪年方案。第六小组印发了《国旗国徽国歌国都纪年方案组关于国旗国都纪年的意见》,提交各组讨论,其中关于国都问题的意见为:“我们提议中华人民共和国的首都应定于北平,并将北平改名为北京”,因为“北平为中国的首都已有七百多年的历史”,“从各种条件看,北平实具备现代大国首都的各种资格”:在政治上,北平位于华北老解放区内,人民力量雄厚;在经济上,邻近我国重工业区的东北六省,便于发展工业;在文化上,这里有几百年的文化积蓄,规模弘伟,文物集中,是世界上有名的历史的大都市之一,且自五四以来,这里就是新文化思想的摇篮;在地理上,北平位于一个大平原之中,将来有足够的扩充的余地,在交通上是四通八达,有平沈、平绥、平汉、平沪等铁路干线,连络全国各地。各组讨论非常认真和热烈,虽然对国旗参考图案看法不同,但对国都的意见却非常一致。次日,《人民日报》在报道讨论结果时称:“参加讨论的代表们毫无例外地同意建都北平。”
9月25日晚,毛泽东在中南海丰泽园召开座谈会,商谈国旗、国徽、国歌、纪年、国都诸问题,周恩来、郭沫若、沈雁冰、黄炎培、陈嘉庚、马叙伦等参加。大家对把国都建在北平都没有异议,但对于北平、南京是否改名有争议。张奚若说:“国都在北京大家是不会有意见的,但就是南京是否改名,有人提议南京要改名。”黄炎培建议说:“为了省事,我的意见,北平、南京都可以不改。”毛泽东说:“国都问题,还是改一个字好(指北平改为北京)。”经过讨论,大家对建都北平并改名北京一致赞成。
9月27日,大会讨论了《国旗国都纪年国歌决议草案》,并通过中华人民共和国国旗、国都、纪年、国歌四个决议案。其中关于国都问题的决议案为:“全体一致通过中华人民共和国的国都定于北平,自即日起改名北平为北京。”10月1日,中华人民共和国开国大典在修整一新的天安门广场隆重举行。北京,这座闻名中外的历史文化古城,正式成为新中国的首都。