陈优生
(广东食品药品职业学院 制药工程学院,广东 广州 510520)
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐的合成及晶体结构
陈优生
(广东食品药品职业学院 制药工程学院,广东 广州 510520)
摘 要:以4-硝基苯二胺为原料通过取代反应、加成反应和水解反应三步单元反应制备2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑,经过制备单晶并用X-射线衍射表征其为2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐晶体结构,化合物属单斜晶系,空间群为C2/C,分子式C7H7N4O2+·Cl-,Mr=214.62,晶胞参数a=13.969(3)Å、b =7.806 4(19)Å、c=16.490(4)Å、β=91.303(3)º、V=1 797.7(7) Å3,晶胞密度(计算值)为1.586 Mg·m3、Z=8、R=0.035、ωR=0.096,化合物通过氢键形成空间三维结构。
关键词:2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐;X-射线衍射;晶体结构
苯并咪唑类化合物是一种含有两个氮原子的苯并杂环化合物,苯并咪唑衍生物及其金属配合物具有良好的生物活性,可作为药物中间体,制备人、畜的驱虫药物。含咪唑环的苯并咪唑及其衍生物在抗癌、抗真菌、镇痛消炎、抗风湿、驱虫等方面有很重要的药用价值。由于其具有特殊的结构、生理活性和反应活性等,应用十分广泛。因此,几十年来苯并咪唑及其衍生物的合成及应用研究从未间断,至今仍十分活跃。
以4-硝基苯二胺为原料制备2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐单晶,化合物的单晶结构通过X-衍射后进行得到确认。本文中所述苯并咪唑衍生物的合成工艺简单易行,收率高达92%。
1.1 试剂和仪器
2-硝基苯二胺、BrCN均为国产分析纯,氨水为化学纯。
Bruker Smart-APEXII CCD单晶X衍射仪;三颈反应瓶等玻璃仪器,磁力搅拌器等。
1.2 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐的制备[1]
称取4-硝基苯二胺1.4 g于三颈瓶中,加入溴化氰(BrCN)0.97 g,加入水30 mL,继续搅拌热回流7 h,然后冷却,再加入氨水(25%)调节反应液pH值至11,室温条件下经过1天,挥干母液后得到样品,样品溶于pH等于1的盐酸溶液中放置2天,挥干母液得到衍射样品。
1.3 X-射线衍射测定单晶结构
选一个大小为0.12 mm×0.12 mm×0.10 mm的单晶样品,封入锂毛细管中,在Enraf-Nonius CAD4四圆衍射仪上[2],T=291K,以Mo Kα射线(γ=0.710 73Å),石墨单色器,ω /2θ 扫描方式收集衍射数据,衍射指标hkl值分别为-16~16、-9~9、-19~13,共收集5º≤2θ ≤50º范围内的独立衍射点1580个,其中I>2σ(I)的可观测衍射点为1242个,参数数目127个,在微机用直接法(SHEL XS97)解析晶体结构[3-4],从E图上获得全部14个非氢原子位置,用块对角矩阵最小二乘法修正结构参数并判别原子种类,用几何计算法与差值 Fourier法获取全部氢原子位置,并用全矩阵最小二乘法修正结构参数,最终可靠因子为R[F2>2σ(F2)]=0.035,ωR(F2)=0.096,(Δ/σ)max<0.001,最终残余的最低峰(Δρ)min=-0.19 e/Å3,最高峰(Δρ)max=0.18 e/Å3,S=1.02。
收稿日期:2016-03-02
基金项目:广东省自然科学基金面上项目资助(9151052005000006)。
作者简介:陈优生(1972~),男,江西吉安人,副教授,博士;主要从事药物合成的研究。yous11@163.com
2.1 衍射样品的合成
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑的化学反应式如下图1所示。
图1 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑的合成路线
2.2 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐单晶X-射线衍射的表征
2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐单晶 X-射线衍射样品结构如图 2所示。标题化合物属单斜晶系,空间群为C2/C,分子式 C7H7N4O2+·Cl-,Mr=214.62,晶胞参数a=13.969(3)Å、b=7.8064 (19)Å、c=16.490(4)Å、β=91.303(3)º、V=1797.7(7) Å3、Z=8,晶胞尺寸为0.12×0.12×0.10 Å3, F000=880,晶胞密度(计算值)为1.586 Mg·m3。
晶体结构中,分子内的C-H…Cl 和N-H…Cl及分子间的N-H…Cl作用力使分子形成比较稳定的二面体网状结构如图4。通过π-π共轭苯并咪唑环有很强的稳定性。
化合物部分原子坐标及热参数见表1,化合物参数(键角和键长)见表2,化合物氢键(键长和键角)见表3。
图2 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑盐酸盐单晶结构
表1 化合物非氢原子坐标及热参数(Å)
续表1
表2 化合物键角(º)和键长(Å)
表3 化合物氢键(键长Å和键角º)
化合物分子结构如图3所示,晶胞堆积如图4所示。
图3 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑分子结构图
图4 2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑晶胞堆积图
以4-硝基苯二胺为原料通过取代反应,加成反应,水解反应三步单元反应制备2-氨基-6-硝基-1H-苯并咪唑,产率高,操作简单易行,通过X-衍射确定产物属单斜晶系,空间群为C2/C,晶胞参数a=13.969(3)Å、b=7.806 4(19)Å、c=16.490(4)Å、β=91.303(3)°、V=1 797.7(7) Å3、Z=8,晶胞密度(计算值)为1.586 Mg·m3。晶体结构中,分子内的C-H…Cl 和N-H…Cl及分子间的N-H…Cl作用力使分子形成比较稳定的二面体网状结构。
参考文献:
[1] Allen F H, Kennard O, Watson D G, et al. Table of bond lengths determined by X-ray and neutron diffraction[J]. J Chem Soc Perkin Trans, 1987, 2(12): 1-19.
[2] 陈小明, 蔡继文. 单晶结构分析原理与实践[M]. 北京: 科学出版社, 2003, 41-45.
[3] Sheldrick G M SHELXS 97. Program for Crystal Structure Solution[M]. University of Göttingen, Germany: 1997.
[4] Sheldrick G M SHELXL 97. Program for Crystal Structure Refinement[M]. University of Göttingen, Germany: 1997.
中图分类号:R972
文献标识码:A
文章编号:1009-220X(2016)03-0049-04
DOI:10.16560/j.cnki.gzhx.20160309
Synthesis and Crystal Structure of 2-Amino-6-Nitro-1H-Benzoimidazol-3-Ium Chloride
Chen You-sheng
(School of Pharmaceutical Engineering, Guangdong Food and Drug Vocational College, Guangzhou 510520, China)
Absrtact: The compound 2-amino-6-nitro-1H-benzoimidazol-3-ium chloride was prepared with 4-nitro -phenylenediamine、BrCN and NH4OH by substitution reaction、additive reaction、hydrolysis reaction. Its structure had been determined by X-ray diffraction method. The crystal crystallize in monmclinic system, space group C2/C with C7H7N4O2+·Cl-, Mr=214.62, cell parameters: a=13.969(3)Å,b=7.806 4(19)Å,c= 16.490(4)Å,β=91.303 (3)º,V=1 797.7(7) Å3,Dc=1.586 Mg·m3,Z=8,R=0.035,ωR=0.096。The molecules were formed to be a 3-D network through hydrogen bong.
Key words:2-amino-6-nitro-1H-benzoimidazol-3-ium chloride; X-ray diffraction; crystal structure