2013版SNOMED CT顶层概念调整及属性关系*

2014-11-16 10:49董燕贾李蓉朱彦李敬华高博
中国医学创新 2014年3期
关键词:子类亚类概念模型

董燕 贾李蓉 朱彦 李敬华 高博

SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms,医学系统命名法-临床术语)是结构化的临床术语集,每个概念有基于含义的逻辑表示,并有唯一标示的代码。概念的逻辑定义通过建立概念间的“关系”来实现。“关系”包括了:“|IS-A|关系”与“属性关系”。而这些“关系”归于“连接概念(Linkage concept)”下。SNOMED CT的顶层概念根据研究发展而调整。了解分类结构变化以及“关系”和概念定义,可为构建中医临床术语系统的提供参考和借鉴。

1 SNOMED CT顶层概念的调整

2010年1月时,在技术预览中提出了“元数据层级”[1]。2013年公布的SNOMED CT新增的顶层概念是“SNOMED CT模型组件”(SNOMED CT Model Component),调整后的顶层概念仍是19个[2],见表1。之前顶层概念“连接概念”以及“特殊概念”的亚类“命名空间概念”被移到“SNOMED CT模型组件”下作为亚类,

新增的“SNOMED CT模型组件”也被称为“顶层元数据(Top Level Metadata)”,其下又包含 4个亚类:“核心元数据概念”(Core metadata concept)、“基础元数据概念”(Foundation metadata concept)、“连接概念”(Linkage concept)、“命名空间概念”(Namespace concept)。

“核心元数据概念”的子类可提供支持国际发布数据的结构信息。支持信息包括枚举值集,这些枚举值用于概念、描述和关系属性。“基础元数据概念”的子类为包括参考集在内的派生结构提供支撑元数据和结构信息。“命名空间概念”每个子类概念有一个整数术语,是一种分配扩展名称空间标识符。“连接概念”用于连接两个或两个以上的概念来表达组合含义。所有能被用来作为“关系类型”的概念都收在“连接概念”中。

表1 SNOMED CT(2013)19个顶层概念名称

2 连接概念

“连接概念”将两个概念连起来,形成一个可以表达明确意义的短句,也就是说多个概念通过“连接概念”相连即可形成一个概念表达充分的医学语句。批准使用的即为“概念模型属性”。

“连接概念”下有两个亚类:“连接声明”(Link assertion)和“属性关系”(Attribute)。“连接声明”下有7个子类;“属性关系”下的4个子类,见表2。其中“概念历史属性”下含7个子类,“概念模型属性”下共含65个子类,“事实角色”下含1个子类,“未批准属性”下共含196个子类。

“连接声明”亚类允许SNOMED CT概念用于HL7语句之间的关系维护。目前,该内容支持英国国家卫生服务部(NHS)卫生联络机构为在英国实施HL7版本3的关系编码要求。

“属性”亚类的概念用于SNOMED CT概念间的关系构建,也称为概念间的“关系类型”。一些“属性”(即“关系类型”)可用来逻辑地定义一个概念,这称为“定义属性”。定义属性示例:(1)“| is a |关系”。(2)|概念模型属性 |(Concept model attribute):|偏侧性 |(Laterality),|操作部位 |(Procedure site),|发现部位 |(Finding site),|相关形态学 |(Associated morphology)。

“属性”下还包括“非定义属性”,非定义属性示例:(1)|未批准属性 |(Unapproved attribute):|因……缓解 |(Relieved by),|评估 |(Has assessment)。(2)|概念历史属性 |(Concept history attribute) :|被……替代|(REPLACED BY),|与……相同|(SAME AS)。“概念模型属性”下共含65个子类,不属于“定义属性”有6个[3]:|一般认为|(Commonly considered)、|有生活环境 |(Has life circumstance)、|有生理状态 |(Has physiologic state)、|包括子标本 |(Includes sub-specimen)、|部分|(Part of)、|信息主题|(Subject of information)。

表2 连接概念的二级、三级子类

3 定义属性

“定义属性”(即“关系类型”)用来逻辑地定义一个“概念”。SNOMED CT目前使用60个“定义属性”来构建概念定义模型:“|is a|关系”(也称为“父-子关系”或“上下位关系”)和“概念模型属性”中的59个“关系类型”。

每个“定义属性”通常属于一个层级,有少数属于多个层级,一个属性可以应用的层级被称为属性的“域”(domain)。也就是说,“域”是特定的“关系类型”可应用的层级,例如:“临床发现”是|相关形态学|的“域”。每个属性可以被赋予一组有限的值,这个值域集被称为属性的“值域(范围)”(range)。例如,|相关形态学|的“值域(范围)”是|形态异常结构(形态学异常)|及其子类;|发现部位|的“值域(范围)”是|身体结构|层级结构下的|解剖或获得身体结构(身体结构)|及其子类。

同一个“关系类型”可以用于不同的“域”。“概念模型属性”中的59个“关系类型”应用的“域”的情况:“临床所见”16个,“操作”23个,“操作”6个,“具有明确语境”6个,“事件”5个,“标本”5个,“药物/生物制品”2个,“身体结构”1个,“物理性物体”1个。其中,应用于“事件”概念类的5个“关系类型”同时也用于 “临床所见”;“has active ingredient”同时用于“物理性物体”和“药品/生物制品”。

图1 肺炎|发现部位|肺组织

4 关系与概念定义

SNOMED CT中每个概念都有逻辑定义,通过“关系”与其他概念连接。“|is a|关系”和“定义属性关系”被称为SNOMED CT概念的定义性特征,通过与其他概念建立“关系”,在逻辑上代表一个概念。

除了“根概念”,每个活跃概念至少有一个“|is a|关系”与其父概念关联。“|is a|关系”是SNOMED CT的层次结构的基础,见图2。一个概念可以有不止一个“|is a|关系”与其他概念相连。在同一顶层结构下,一个概念可有多个父概念,子类型关系可以多层级化,见图3。

图2 “|IS A|关系”层级关系

图3 “|IS A|关系”

“属性关系”是两个“概念”之间的关联关系,用于指定某个概念的“定义特征”(源关系)。每个“属性关系”有名称(关系类型)和值(目标关系)。

“|is a|关系”和“属性关系”(即“关系类型”)组合通过表述某一“概念”的逻辑定义与该“概念”相关联。逻辑概念定义包括一个或多个“上位类型”(由“|is a|关系”描述)和一组“定义属性”,以区别于其他概念定义。完全定义概念|细菌性肺炎(疾病)|表示见图4,每一行表示一个有值的“定义属性”。图5则是用图形的方式来说明部分关系。

图4 |细菌性肺炎(疾病)|的定义

图5 “定义关系”属性图解

5 小结

SNOMED CT(2013)的顶层概念19个,新增一个顶层概念“SNOMED CT模型组件”,“连接概念”为其亚类。“连接概念”用来连接两个概念,形成对某一概念的表达。每个概念是逻辑定义,通过“关系”与其他概念连接:“|is a|关系”用于连接一个“概念”与同类型的更一般的概念;“属性关系”(例如|发现部位|和|病原体|)用于连接“概念”与其他子类型中的相关值。需要特别注意,对“连接概念”的使用是非标准的,是探索性和试验性的。

SNOMED CT的体系构建的原则与工作方法,适用于“中医临床术语集”的构建[4]。“中医临床术语集”经过几年的建设,目前也面临着结构调整的需要,研究SNOMED CT的结构调整和概念间“关系”,将为中医临床术语系统的完善提供有力的参考和借鉴。

[1]董燕,崔蒙,贾李蓉.SNOMED CT层次结构与标识符[J].中国数字医学,2012,7(2):68-72.

[2]IHTSDO.SNOMED CT Technical Implementation Guide January 2013 International Release (US English)[OL][2013-01].http://ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[3]IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release(US English)[OL][2013-01].http://ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].

[4]郭玉峰,刘保延,姚乃礼,等.基于SNOMED CT核心构架研究的中医临床术语集标准化特征要素初探[J].中国中医药信息杂志,2008,15(9):96-97.

猜你喜欢
子类亚类概念模型
基于草原综合顺序分类法的中国山地草地亚类分类研究
网络服装虚拟体验的概念模型及其量表开发
卷入Hohlov算子的某解析双单叶函数子类的系数估计
Java面向对象编程的三大特性
基于“认知提升”的体系作战指挥概念模型及装备发展需求
Java类的继承
免疫球蛋白G亚型检测在小儿反复呼吸道感染中的应用
商业模式创新与企业竞争优势间的内在机理分析
某高校团委信息管理系统构建研究
系统性硬化症患者血清IgG亚类特点