雅点六齿小蠹的SS—COI技术鉴定

2014-05-30 10:48张总泽陈艳林阳武李敏
安徽农业科学 2014年9期
关键词:检测

张总泽 陈艳 林阳武 李敏

摘要 [目的] 采用SSCOI技术鉴定雅点六齿小蠹。[方法]采用基于线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基I(mtDNA COI)基因序列的种特异性(speciesspecific COI,SSCOI)PCR方法,设计雅点六齿小蠹SSCOI引物ipsc1和ipsc2。[结果] 该引物特异性强,能扩增出清晰、单一的长度为594bp的特异性条带,与白云杉齿小蠹(Ips perturbatus)、黑条木小蠹(Trypodendron lineatum)、橡胶材小蠹(Xyleborus affini)、欧洲根小蠹(Hylastes ater)、咖啡果小蠹(Hypothenemus hampei)、长林小蠹(Hylurgus ligniperda)进行对照,均无条带出现。[结论]建立的雅点六齿小蠹PCR鉴定方法在实际检疫工作中得到验证和应用,表明该方法特异、灵敏、稳定,可以应用于口岸检疫鉴定工作。

关键词雅点六齿小蠹;SSCOI;PCR;检测

中图分类号S433.5文献标识码A文章编号05176611(2014)09-02588-02

基金项目福建检验检疫局科技计划项目(FK201159,FK201224);质检公益性行业科研专项(201410076)。

作者简介张总泽(1984- ),男,内蒙古牙克石人,农艺师,从事昆虫检疫鉴定工作。

雅点六齿小蠹Ips concinnus Mannerheim,又名粒点六齿小蠹、西特喀云杉齿小蠹,属于鞘翅目(Coleoptera)、小蠹科(Scolytidae)、齿小蠹属(Ips),分布于美国(阿拉斯加、加利福尼亚、俄勒冈、华盛顿)和加拿大(不列颠哥伦比亚),为害西特喀云杉Picea sitchensis (Bong.) Carrière,是我国进境植物检疫性有害生物。该虫属于初期性害虫,以幼虫和成虫侵害健康树木,取食寄主的有机成分,造成寄主大面积死亡。我国是木材进口大国,近年来,随着国际贸易的不断增长,进口木材和木质包装量也日益增加,特别是一些口岸直接进口未经处理的北美原木,使该虫入侵的风险极大,我国口岸曾多次截获该虫[1-2]。由于该虫在我国尚未分布,所以,加强检疫是防治该虫最为重要的技术措施。

雅点六齿小蠹的鉴定主要基于成虫的形态特征,包括额面特征、前胸背板刻点、鞘翅末端的齿、雄虫生殖器等[3]。而对于口岸检验检疫工作中常截获到的幼虫,则无法用常规的形态学手段鉴定,给快速通关和贸易便利化造成困难。近年来,应用分子生物学方法鉴定有害生物越来越广泛,特别是PCR方法,由于具有快速、微量、灵敏等显著优点,在各口岸检验检疫部门已经普及。笔者采用基于线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)细胞色素C氧化酶亚基I(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因序列的种特异性PCR(speciesspecific COI,SSCOI)方法[4],设计了雅点六齿小蠹的特异性引物,对该方法进行了技术验证,为快速准确鉴定该虫提供技术保障。

1材料与方法

1.1供试虫源雅点六齿小蠹(Ips concinnus)、白云杉齿小蠹(Ips perturbatus)、黑条木小蠹(Trypodendron lineatum)、橡胶材小蠹(Xyleborus affinis)、欧洲根小蠹(Hylastes ater)、咖啡果小蠹(Hypothenemus hampei)、长林小蠹(Hylurgus ligniperda)均为福建口岸近年检疫截获的小蠹科昆虫标本,所有试虫均为成虫,经形态学鉴定后用于研究。

1.2DNA提取采用生工磁珠法动物基因组DNA抽提试剂盒(上海生工生物工程有限公司)提取试虫DNA。具体步骤:取单头小蠹成虫,去除鞘翅后置于-20 ℃冷冻10 min,取出后迅速放入1.5 ml离心管中[5],加入裂解液(400 μl Buffer MACL,200 μl Buffer MCL和20 μl Proteinase K),用塑料研磨棒充分研磨虫体,然后按说明书步骤操作,提取的DNA置于-20 ℃保存备用。

1.3引物设计登录Genebank,查询下载小蠹虫COI基因序列(Genebank登录号见表1)。利用Primer 5和Oligo 6软件,根据引物设计原则[6-7],设计1对雅点六齿小蠹SSCOI引物:上游引物ipsc1 5′ATGTGGATACACGAGCATACTTTACC3′;下游引物ipsc2 5′GTAATCATTCAATAGAGGC3′。引物由上海生工生物工程有限公司合成。

1.4PCR扩增PCR反应体系为25 μl,其中2×Taq PCR Master Mix(天根生化科技有限公司)12.5 μl,上下游引物各1 μl(10 pmol/L),模板DNA 1 μl,ddH2O 9.5 μl。经预试验优化,PCR反应程序:94 ℃预变性5 min;35个循环:94 ℃ 40 s,55.5 ℃ 40 s,72 ℃ 50 s;最后72 ℃延伸10 min。取10 μl PCR扩增产物,在1.5%琼脂糖凝胶上以90 V电泳分离30 min,染色后在凝胶成像仪上观察结果。

1.5特异性及灵敏度试验

1.5.1特异性试验。选取6种小蠹虫成虫,经形态学鉴定后按照“1.2”的方法提取DNA,以雅点六齿小蠹为阳性对照。先用小蠹虫通用引物C1J2183和C1N2611进行PCR扩增[8],以验证DNA提取质量。然后用SSCOI引物ipsc1和ipsc2进行PCR扩增,以检验该引物的种特异性。

1.5.2灵敏度试验。将提取的雅点六齿小蠹DNA按10-1、10-2、10-3、10-4、10-5倍梯度稀释,用SSCOI引物ipsc1和ipsc2进行PCR扩增,以检验该检测方法的灵敏度。

1.6PCR方法的验证与应用用口岸截获的小蠹科昆虫DNA为模板,以雅点六齿小蠹为阳性对照,用特异性引物ipsc1和ipsc2进行PCR扩增,以检验该方法的准确性和稳定性。

2结果与分析

2.1DNA提取质量检验利用小蠹虫通用引物C1J2183和C1N2611对提取的7种小蠹虫DNA模板进行PCR扩增,电泳结果显示,7种小蠹蟲均能扩增出清晰单一的目的片段,长度约为470 bp(图1)。说明所提取的DNA模板纯度较高,能满足试验需求。

3讨论

准确的物种鉴定是检疫工作的首要任务和基本前提。口岸检验检疫部门对于截获的幼虫,一般情况下要将其在室内饲养至成虫,但受检测周期长、小蠹虫的饲养难度大等限制,不能满足快速通关的要求。近年来,利用分子生物学技术快速鉴定昆虫种类已经成为趋势,在mtDNA COI基因序列分析技术基础上发展起来的SSCOI引物鉴定技术,由于具有重现性好且条带单一等优点,在昆虫快速鉴定中得到广泛应用。

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