转化医学研究的引文分析

李宁,马路,黄芳

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转化医学研究的引文分析

李宁,马路,黄芳

转化医学是近年来医学研究的一个热门领域,如何从当前丰富的研究成果中快速把握该领域的研究脉络、热门课题和研究趋势,成为从事该领域研究人员的难题。本研究运用引文分析的方法,利用Web of Science的文献数据,采用HistCite软件对当前国外的转化医学的研究成果做了有关其学科分布、核心期刊、核心文献、研究热点等的实证分析。

转化医学;引文分析;Web of Science数据库

转化医学 (Translational medicine)也称转化研究 (Translational research)。“转化研究”一词的提出,源于 1993年[1]。当时人们建议,将在实验室发现的乳腺癌易感基因 (BRCA1)和其他癌基因,作为癌症早期检测和治疗的可能性标志和靶点,于是将实验室得到的研究成果作为临床治疗的参考和工具,“转化研究”应运而生。而“转化医学”一词包括了“转化研究”各个领域,很多人用“从实验台到病床”(From the bench to the bedside)或者用 “连接缺口” (Bridging the gap)来形容“转化医学”[2]。

本研究尝试采用 Web of Science (WoS)数据库中的引文数据,综合运用文献分析、引文分析和可视化技术的方法,分析文献数量、期刊分布、关键词、著者等相关数据,力图快速、直观明了地揭示转化医学研究领域中的理论发展历程、核心文献、核心期刊以及当前研究热点和前沿领域,为相关学者的研究提供参考。

1 数据来源与研究方法

本研究主要运用引文分析方法对转化医学研究进行实证分析。

1.1 数据来源 美国科学信息所提供的WoS是国际权威的科学技术文献的索引工具,共收录各领域学术期刊 10 000多种,更新及时,并提供了详实的引文回溯数据。WoS提供的引文数据和检索机制可以轻松回溯或追踪学术文献,超越学科与时间的局限,迅速地发现在不同学科、不同年代所有相关的重要文献。

笔者使用WoS进行了精确检索,设定检索表达式为 TI= ("Translational medicine"OR" Translational research")查找所有年限,共检索出 886条文献[3],并将包含参考文献的详细文献题录保存到文本文档以备分析。在这 886篇文献中,共涉及 2 568位著者,474种期刊,被引文献 (Cited References)记录 21 977条,关键词 2 177条,发表年代分布在 1994—2010年。

1.2 主要研究方法 本文应用当前主流的可视化引文分析方法 Garfield的引文时序图法 Historiography[4]。引文时序图分析首先选择一组重要的具有代表性的引文,然后以每篇论文或著者作为节点,按时间先后标以序号,连接这些节点并以引用次数或其被引率为权值,构成引文时序图。引文时序图通过对文献引用过程的可视化,直观展示出某个研究主题的论文渊源、重要著者及发展历程,进而可以发现该主题领域中的研究规律和发展趋势。

本研究使用的软件工包为 HistCite 9.8.24[5],HistCite是 SCI创始人 Garfield最早于 2001年推出的一套强有力的文献分析工具。

2 文献量与期刊分析

2.1 学科分布分析 从学科分布上来看,根据WoS的学科分类体系,共有 103个学科不同程度地参与了转化医学相关的研究,图 1列出了前 10个相关学科的分布情况。转化医学领域的研究与基础医学和临床医学都有明显的学科交叉特性,涉及心理学、病理学、分子生物学等多个领域,尤其与肿瘤学、药理学、研究与实验医学领域的交叉最深,反映转化医学的研究成果主要集中于这三个领域并对这三个学科的创新发展具有贡献。从交叉的广度上来看,转化医学的研究对其他学科的渗透也很强,反映其研究成果对内科学、神经科学、细胞生物学等诸多学科的发展起到了支撑作用,应用范围比较广泛。

2.2 文献数量和引文频次分析 表 1是按年代划分的文献数量和引用情况的统计。在 HistCite软件中,LCS(Local Citation Score)表示该文献在当前文献集合中的引用频次,GCS(Global Citation Score)表示该文献在WoS中的引用频次,两者的总和分别用 TLCS和 TGCS表示。WoS中收录的转化医学领域的文献数量在1994—2010年间基本呈上升态势,尤其从 2004年开始,文献数量倍增。其中, 2000—2009年是引用比较密集的年份。

2.3 核心期刊分析 本研究从发文数量和被引频次两个指标综合分析,能够更加准确地判断核心期刊的分布。本研究主要按照发文数量确定选取了 10种期刊 (见表 2),这些期刊基本构成了本研究领域核心期刊的雏形,是转化医学研究的重要信息源。从表中可以看到转化医学的专业期刊 “JOURNAL OF TRANSLAT IONAL MED I C INE”位列其中,但就引文频次TGCS的数据来看期 刊 “CL IN I CAL CANCER RESEARCH”发表有关转化医学的文章影响力最大,总被引频次达到了257次。

表1 文献数量与引用频次表Table 1 Literature number and Citation frequency

图1 转化医学相关研究的学科分布Figure 1 Subject distribution of the Literatures on translationalmedicine

表2 转化医学领域核心期刊分布Table 2 Key journal distribution of the documents on translationalmedicine

2.4 核心文献分析 按 GCS排名第一的是 2000年由Archer S和 Rich S发表在期刊 CIRCULAT ION上题为“Pr imary pulmonary hypertension-A vascular biology and translational research work in progress”的文章,这篇文章的 GCS达到了 168次,具有很高的影响力,排名第二、三位的分别是 2000年由Lee JJ等发表在期刊CL INICAL CANCER RESEARCH上题为“Predicting cancer development in oral leukoplakia:Ten years of translational research”的文章 (GCS157)和 2008年由 Woolf SH发表在期刊 JOURNAL OF THE AMER ICAN MED I CAL ASSOC IAT ION上题为“The meaning of translational research and why itmatters”的文章 (GCS133)。可见影响力高的文章都没有发表在转化医学的专业期刊上。

2.5 时间序列图 本研究中以LCS对文献记录排序,阀值 80,即选取前 80条记录,根据时间先后顺序生成引文时序图,以圆形的大小代表文献被引频次的多少,以带箭头的连线代表文献节点之间的引用关系,箭头指向的文献是被引用的文献,圆形内所标数字指明该节点文献在文献集合中的序号 (见图 2),在 HistCite软件界面中点击即可看到详细文献记录。

从引文时序图上可以看出,1996—2008年,很多文献得到了广泛引用,特别是 2008年的文献 487,Woolf SH撰写的题为 “The meaning of translational research and why it matters”的文章节点面积最大,说明最关键的文献产生于这一阶段。从图上还可以看出 1994—2000年文献节点稀少,说明这段时间转化医学的研究还处在开创阶段。从 2001年以后节点数目有明显增加,其中出现了 56、577、487这样有较大影响力的文献,说明转化医学的研究进入活跃期,大量有价值的研究成果开始涌现。通过调整阀值还可以更全面的了解转化医学领域的研究状况。

3 讨论

进行学术趋势研究的方法有很多种,同传统的学者个人归纳、访谈调查等主观研究方法相比,引文 (Citation)分析法有着不可比拟的优越性和独到之处。引文分析最大的优势是它的客观性、分类原则的科学性和数据的有效性。作为文献计量学研究中的一个重要组成部分,自从Garfield创立引文索引数据库以来,引文分析法越来越多地被用来进行科学结构分析、科学技术史及其发展规律研究、科研成果及人员绩效评价等方面[6],在临床医学的各个领域也有很多应用[7-10]。

本研究在转化医学领域从文献的学科类别作统计,可以了解该领域研究成果的学科分布状况,对研究论文的期刊分布情况进行分析,可以确定该领域的核心期刊,对在这些核心期刊发表的研究成果进行跟踪和分析可以帮助我们更准确地了解该领域的研究状况,同时也为从事转化医学研究的科研人员选择了合适的投稿期刊。

文献被引频次反映了该文献被其他研究者关注的程度,被引频次越高,说明此文献在该研究领域中越重要,可被认为是核心文献。对这些文献的分析可以反映出当前研究的重点。在 HistCite中把该领域文献按照引用频次指标LCS和 GCS的大小对文献记录进行排序,从而可以识别出一批核心文献。

图2 转化医学领域1994—2009年关键文献的引文时序图Figure 2 Historiography of key literatures on translationalmedicine from 1994 to 2009

本研究通过引文时序图不但可以观察到该研究领域主题发展的沿革和继承关系,还有可能发现这一领域研究在一段时间内的发展状况。运用引文分析法节省了研究人员的大量精力,能够让研究人员对研究主题领域的核心文献、核心期刊分布和研究发展规律有一个快速、直观地了解,并为进一步深入研究和分析提供了良好的开端,对判断研究趋势和选取研究主题也很有帮助。

本研究所采用的引文分析法和引文时序图法不仅可以用于转化医学这样的基础与临床的交叉研究领域,还可以用于临床医学的各个领域,目前国际上的科学计量研究主要应用的是 SCI数据库,客观上要求适度地鼓励中国的科学家在 SCI的期刊上多发表论文,对于临床医生来说,他们做实验的时间少,没有大量的时间搞科研,但他们如果注意收集整理临床领域或者与临床医学相交叉的相关领域的文献,熟悉掌握引文分析法,并结合统计学方法,可以较容易地找到合适的研究热点,并在 SCI的期刊上发表相关的文章。

1 Adams JU.Building the bridge from bench to bedside[J]. Nature,2008,7 (6):463 -464.

2 Aronson JK,Cohen A,Lewis LD.Clinical phar macology-providing tools and expertise for translational medicine[J].British JournalofClinicalPharmacology,2008,65 (2):154-157.

3 Web of Science.http://apps.isiknowledge.com/[2010-8-14].

4 Garfield E,Sher IH,Torpie RJ.The use of citation data in writing the history of science [J]. Philadelphia: Institute for Science Infor mation,1964:6.

5 HistCite Home.http://www.histcite.com/ [2010-8-14].

6 邱均平.信息计量学 (九):第九讲文献信息引证规律和引文分析法 [J].情报理论与实践,2001,24(3):236-240.

7 Akpinar EM,Karcaaltincaba.Analysis of scientific papers in the field of radiology andmedical imaging included in science citation index expanded and published by turkish authors [J].Diagnostic and InterventionalRadiology, 2010,16(3):175-178.

8 Calo WA,Suarez-Balseiro C,Suarez E, et al.Assessing the scientific research productivity of puerto rican cancer researchers:bibliometric analysis from the science citation index[J]. Puerto Rico Health Sciences Journal,2010,29(3s.SI):250-255.

9 SiebeltM,Siebelt T,Pilot P,et al.Citation analysis of orthopaedic literature;18 major orthopaedic journals compared for impact factor and scimago[J].BMC Musculoskeletal Disorders,2010,11:4.

10 Chou CY,Chew SS,PatelDV,et al.Publication and citation analysis of the australian and New Zealand Journal of ophthalmology and clinical and experimental ophthalmology over a 10-year period: the evolution of an ophthalmology journal[J].Clinical and Experimental Ophthalmology,2010,37 (1): 89-89.

C itation Analysis of TranslationalM edic ine

LI N ing,MA Lu,HUANG Fang.Capital M edical University L ibrary,Beijing 100069,China

Translationalmedicine has became a hot topic in recent years.However,it is challenging for researchers to quickly find the research history,hot topics,and research trendsof this new subject.Using the methodology of citation analysis, the literatures collected from theWeb of Science,and the software of HistCite,the authors analyzed the discipline distribution, core journals,core literatures,and research focuses of translationalmedicine.

Translationalmedicine;Citation analysis;Web of science

R-3

A

1007-9572(2010)12-4052-03

2010-09-20;

2010-11-10)

(本文编辑:赵跃翠)

首都医科大学哲学社会科学基金资助项目 (2009sk07)

100069北京市首都医科大学图书馆

马路,100069北京市首都医科大学图书馆;E-mail:malulib@ccmu.edu.cn