肉制品中狗、狐、貂源性成分DNA检测试剂盒的制备

2021-09-17 11:48贾慧建王天添赵远宋顺佳邵学超艾金霞孙丽媛
肉类研究 2021年8期
关键词:狗肉试剂盒

贾慧建 王天添 赵远 宋顺佳 邵学超 艾金霞 孙丽媛

摘 要:为快速检测肉制品中狗、狐、貂3 种常见犬型总科动物源性DNA成分,应用分子生物学技术分析种属基因组序列差异,建立并优化多重聚合酶链式反应检测体系,开发快速检测试剂盒。结果表明:快速检测试剂盒特异性良好,与常见肉类动物(猪、牛、羊、马、驴、鸡、鸭)源性DNA成分皆无交叉反应;灵敏度高,3 种靶标样品DNA质量浓度同时降至10-4 ng/?L,仍可准确检测;阳性条带经切胶回收、克隆转化、测序比对,与GenBank已登记的狗(MH105046.1)、狐(LT560065.1)、貂物种(KU145464.1)相似性为100%;对30 份模拟混合肉样进行鉴别检测,检测结果与预设混合情况完全相符;50 份市售样品中,狗肉样品中3 份出现掺假现象。

关键词:狗肉;狐肉;貂肉;DNA;试剂盒

Development of DNA Detection Kit for Dog, Fox and Mink-Derived Components in Adulterated Meat Products

JIA Huijian, WANG Tiantian, ZHAO Yuan, SONG Shunjia, SHAO Xuechao, AI Jinxia, SUN Liyuan*

(School of Medical Technology, Beihua University, Jilin 132013, China)

Abstract: In order to rapidly detect DNA derived from the common Canidae animals dog, fox and mink in adulterated meat products, molecular biology technology was applied to analyze the differences in the genomic sequence of various species, and a multiplex polymerase chain reaction system was establish and optimized to develop rapid detection kits. The results showed that the developed kit had good specificity without cross-reaction with common food-producing animal-derived DNA components (pigs, cattle, sheep, horses, donkeys, chickens and ducks), as well as high sensitivity. When the DNA concentration of the three target samples decreased to 10-4 ng/?L at the same time, they still could be accurately detected using the kit. The positive bands were excised, cloned and sequenced, showing 100% similarity to the dog (MH105046.1), fox (LT560065.1) and mink (KU145464.1) sequences deposited in the GenBank database. This kit correctly identified 30 simulated mixed meat samples with 100% accuracy. Of 50 commercially available samples, three dog meat samples were found to be adulterated.

Keywords: dog meat; fox meat; mink meat; DNA; kit

DOI:10.7506/rlyj1001-8123-20210311-064

中图分类号:TS251.7                                        文献标志码:A 文章编号:1001-8123(2021)08-0048-06

引文格式:

贾慧建, 王天添, 赵远, 等. 肉制品中狗、狐、貂源性成分DNA检测试剂盒的制备[J]. 肉类研究, 2021, 35(8): 48-53. DOI:10.7506/rlyj1001-8123-20210311-064.    http://www.rlyj.net.cn

JIA Huijian, WANG Tiantian, ZHAO Yuan, et al. Development of DNA detection kit for dog, fox and mink-derived components in adulterated meat products[J]. Meat Research, 2021, 35(8): 48-53. DOI:10.7506/rlyj1001-8123-20210311-064.

http://www.rlyj.net.cn

狐、貂与狗同属犬型总科动物,携带多种病毒,贸然食用易对食用者身体健康造成潜在威胁[1-2]。新型冠状病毒肺炎的全球性肆虐,也在警醒食用野生動物的危险性[3-5]。为更好避免潜在的病毒威胁,我国对此作出了一系列举措。2020年2月24日,全国人大委员会通过了关于革除滥食野生动物陋习的相关决定。同年3月31日,深圳市正式立法,狗肉缺席“白名单”[6],狐、貂仅作为药用。因此,亟需建立一种快速准确检测狗、狐、貂源性成分的方法,为立法后的监管提供便利。

肉质成分检测多以形态学[7]、代谢学[8-9]、蛋白质学[10-11]和基因学差异[12-14]作为切入点。目前,分子生物学技术是肉及制品检测的常用技术[15]。近年来,频频爆出肉类掺假的新闻,肉类质量安全监管变得愈加迫切。

史莹莹等[16]应用实时荧光定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)法鉴定肉制品中牛源性成分。Li Tingting等[17]建立了一种基于对照引物的实时荧光定量PCR方法,用于猪肉中掺假山羊肉的定量检测。张秀平等[18]应用微滴数字PCR定量检测鸭源性成分。以上方法可以完成定量检测,但对于快速定性检测无疑增加了成本。多重PCR方法可以同时检测多个核酸片段,适合肉制品中动物源性成分鉴定[19],利于市场监管,有更广泛的市场应用价值。Li Xinnan等[20]应用多重PCR技术建立三重、四重PCR体系,检测牛羊肉中的狐、貂及浣熊源性成分。Qin Panzhu等[21]基于侧向流动条带平台及PCR准确鉴别掺假鸭肉。Liu Wanwan等[22]建立基于通用引物的多重PCR检测系统,确定羊肉中是否含有来自大鼠、狐狸和鸭子的非突变成分。Xu Rusu等[23]建立多重TaqMan锁定核酸实时PCR检测方法,用于同时检测鸭肉、猪肉、牛肉和鸡肉。任易婕等[24]基于多重PCR与膜芯片技术实现对牛、羊、牦牛及驴源性肉类食品的鉴别及检测。本研究从监管角度出发,基于多重PCR技术,开发3 种常见犬型总科动物(狗、狐、貂)DNA成分检测试剂盒,旨在为市场监管提供有利技术支持。

1 材料与方法

1.1 材料与试剂

标准品肉样(狗肉、狐肉、貂肉)和其他检测肉样(猪肉、牛肉、羊肉、马肉、驴肉、鸡肉、鸭肉)由长春食品药品检测中心提供,模拟混合肉样由标准品肉样按质量比混合而成,如表1所示。市售肉样分别购自农贸市场、狗肉馆及线上销售。

组织/细胞/血液基因组DNA提取试剂盒、大肠杆菌DH5α感受态细胞、普通琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒、pGM-T连接试剂盒、质粒小提试剂盒、100 bp DNA Marker、2×Taq PCR MasterMix 北京天根生化科技有限公司;其他试剂均为国产分析纯。

1.2 仪器与设备

TC9600-G多功能梯度PCR仪 美国Labnet公司;JY300E通用型电泳仪 北京君意东方电泳设备有限公司;UV WHITE-2020D紫外凝胶成像分析仪 美国Bio-Rad公司;NanoDrop One微量核酸蛋白测定仪 美国Thermo公司。

1.3 方法

1.3.1 肉样DNA提取

称取待测样品约0.05 g,分别置于洁净EP管中,0.9 g/100 mL NaCl溶液浸泡、冲洗,去血水;每管加入150 μL 0.9 g/100 mL NaCl,匀浆器处理为细胞悬液,12 000 r/min离心1 min;弃上清,依次加入P1溶液500 μL、P2溶液30 μL、P3溶液15 μL,颠倒混匀,56 ℃水浴振荡1 h(每15 min颠倒混匀1 次,至溶液变清亮即可);加入P4溶液500 μL,充分混匀,12 000 r/min离心5 min;取上清液转移至另一洁净EP管,加入等体积P5溶液,-20 ℃放置5 min,12 000 r/min离心5 min;弃上清液,加入体积分数70%冰冻乙醇溶液500 μL,混匀,12 000 r/min离心5 min,弃上清液(重复该步骤1 次);室温晾干后(约15 min即可),加入P6溶液50 μL溶解DNA(可二次洗脱),即得肉样DNA溶液。

P1溶液:1 mol/L Tris-HCl、0.5 mol/L乙二胺四乙酸、0.9 g/100 mL NaCl;P2溶液:10 g/100 mL十二烷基硫酸钠;P3溶液:蛋白酶K;P4溶液:饱和乙酸钠;P5溶液:异丙醇;P6溶液:ddH2O。下同。

1.3.2 引物设计

靶基因序列选取:狗种属基因(序列ID:KU291093.1)、狐狸种属基因(序列ID:LT560065.1)、貂种属基因(序列ID:KU146454.1);采用Primer 5.0软件设计并选取理想种属特异性引物(表2),

由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。所有引物经NCBI-Nucleotide BLAST预分析PCR产物片段特异性。

1.3.3 多重PCR反应体系的建立

1.3.3.1 多重PCR反应体系

反应体系(30 μL):2×Taq PCR Master Mix 15 μL、Can-481F、R(浓度均为1.55 ?mol/L)、Vul-393F、R(2.0 ?mol/L)、Mar-289F、R(10.0 ?mol/L)、各物种DNA模板(5 ng/μL)0.5 μL,共计1.5 μL,无菌ddH2O补足。

反应参数:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,58 ℃退火45 s,72 ℃延伸55 s,30 个循环;72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。

PCR产物检测:1.5%琼脂糖凝胶,85 V/cm电泳85 min。紫外凝胶成像分析仪观察,狗肉、狐肉、貂肉应分别在481、393、289 bp处有单一明亮条带。

1.3.3.2 克隆与测序

紫外灯下,刀片切取特异性目的条带(取自1.3.3.1节电泳凝胶),普通琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒回收、纯化;pGM-T连接试剂盒连接产物DNA于pGM-T載体;转化至大肠杆菌DH5α感受态细胞,SOC培养基增菌培养,LB固体培养基(添加5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-gal)、异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG))蓝白斑筛选阳性克隆;LB液体培养基增菌,质粒小提试剂盒提取质粒DNA;微量核酸蛋白测定仪测定质粒DNA质量浓度。

取1.5 μL质粒DNA原液,分别配制PCR反应体系。每个反应体系含1.5 μL质粒DNA原液、1.5 μL引物混合液(Can-481F、R(1.55 ?mol/L)、Vul-393F、R(2.0 ?mol/L)、Mar-289F、R(10.0 ?mol/L))、15 μL 2×Taq PCR Master Mix、12 μL无菌ddH2O。以最佳反应参数扩增,进行琼脂糖凝胶电泳,紫外凝胶成像分析仪观察结果。

质粒DNA原液经分装密封,送至生工生物工程(上海)股份有限公司测序,NCBI-Nucleotide BLAST分析比对。

1.3.4 犬型总科动物(狗、狐、貂)DNA检测试剂盒组装与评价

1.3.4.1 DNA检测试剂盒组装

DNA提取体系:加入P1、P2、P3溶液破坏细胞膜、核膜,去除蛋白质;加入P4、P5溶液沉淀核酸;最后加入P6溶液溶解DNA。

PCR反应体系:1.5 μL引物混合液(Can-481F、R(1.55 ?mol/L)、Vul-393F、R(2.0 ?mol/L)、Mar-289F、R(10.0 ?mol/L))、15 μL 2×Taq PCR Master Mix、12 μL无菌ddH2O。

标准质粒作为阳性对照,ddH2O作为阴性对照。

1.3.4.2 试剂盒特异性评价

按肉样DNA提取方法分别提取标准样品(狗肉、狐肉、貂肉、猪肉、牛肉、羊肉、马肉、驴肉、鸡肉、鸭肉)DNA,微量核酸蛋白测定仪测定DNA质量浓度及纯度,并稀释至5 ng/μL。制备DNA混合液(含各物种DNA各1 μL),彻底混匀。使用1.3.3.1节反应条件进行PCR扩增,进行1.5%琼脂糖凝膠电泳,紫外凝胶成像分析仪观察结果。

1.3.4.3 试剂盒灵敏度评价

标准品DNA模板(狗/狐/貂)经无菌ddH2O稀释,制备梯度混悬液,质量浓度102~10-5 ng/μL。引物混合液:含1.55 ?mol/L Can-481F、R,2.0 ?mol/L Vul-393F、R,10.0 ?mol/L Mar-289F、R。参照1.3.3.1节配制反应体系,每个反应体系含1.5 μL DNA混合液(102~

10-5 ng/μL)、1.5 μL引物混合液、15 μL 2×Taq PCR Master Mix、12 μL无菌ddH2O。使用1.3.3.1节反应条件进行PCR扩增,进行1.5%琼脂糖凝胶电泳,紫外凝胶成像分析仪观察结果。

1.3.5 模拟混合样品检测

考虑实际生活中各掺假情况出现的可能性,制备模拟混合肉样,每种模拟混合肉样制备2 份,与标准品肉样共计30 份样品。随机抽样10 份,编号分别为A1/A3(狗、狐、貂质量比1∶6∶3)、A2(狗、貂质量比9∶1)、A4(狗、狐质量比9∶1)、A5(狗)、B1(狗、狐质量比9∶1)、B2(狗、貂质量比9∶1)、B3(狗)、B4(狗、狐、貂质量比3∶6∶1)、B5(狗、狐质量比1∶9)。提取肉样DNA,微量核酸蛋白测定仪测定DNA质量浓度,稀释至

5 ng/μL。以标准品DNA模板(狗/狐/貂)为阳性对照,根据1.3.3.1节多重PCR反应体系、反应参数进行扩增,进行1.5%琼脂糖凝胶电泳,紫外凝胶成像分析仪观察。

1.3.6 市售样品检测

选取农贸市场、狗肉馆及线上销售3 种购买来源,获取50 份市售样品。检测方法同1.3.5节。

1.4 数据处理

采用Primer 5.0软件设计并选取种属特异性引物,所有引物经NCBI-Nucleotide BLAST预分析PCR产物片段特异性。克隆后的序列结果经NCBI-Nucleotide BLAST分析,与GenBank中已登记的序列进行比对验证。

2 结果与分析

2.1 狗、狐、貂DNA检测试剂盒特异性评价

由图1可知,在多种DNA模板(狗肉、狐肉、貂肉、猪肉、牛肉、羊肉、马肉、驴肉、鸡肉、鸭肉)存在情况下,泳道1按1.3.4.1节引物比例加入狗、狐、貂的引物混合液,泳道2、3、4分别加入狗、狐、貂的引物,电泳条带出现情况与相应检测体系中目的条带相符,无非特异性干扰,无交叉干扰,背景干净,条带清晰,狗、狐、貂的引物特异性较好。初步表明本研究所制备的试剂盒特异性良好,常见食用肉猪肉、牛肉、羊肉、马肉、驴肉、鸡肉、鸭肉的DNA成分于本检测体系无非特异性扩增,3 种特异性引物检测肉质成分于本检测体系无交叉干扰。

泳道M. 100 bp DNA Ladder;泳道1. 狗、狐、貂混合物;泳道2. 狗;泳道3. 狐;泳道4. 貂;泳道N. 空白对照。

2.2 狗、狐、貂DNA检测试剂盒灵敏度评价

泳道M. 100 bp DNA Ladder;泳道1~8. DNA模板质量浓度102、101、100、10-1、10-2、10-3、10-4、10-5 ng/?L;泳道N. 空白对照。

由图2可知:标准品DNA模板质量浓度处于102~

10-4 ng/μL时,可见3 条特异性条带(狗:481 bp,狐:393 bp,貂:289 bp),条带清晰无拖尾,背景干净;标准品DNA模板质量浓度降至10-5 ng/μL时,条带消失;空白对照无非特异性条带。表明本研究所制备的试剂盒灵敏度高,最低检测限为10-4 ng/μL。

2.3 狗、狐、貂PCR产物克隆与测序

特异性目的条带经切胶回收,连接转化并提取质粒DNA后,进行测序比对。由图3可知,序列经NCBI-Nucleotide BLAST分析,与GenBank中已登记的狗/狐/貂序列相似性为100%,证明本研究所选取靶基因序列可作为种属特异性检测序列,间接证明多重PCR检测体系特异性实验结果的准确性。

泳道M. 100 bp DNA Ladder;泳道1~2. 狗;泳道3~4. 狐;泳道5~6. 貂;泳道N. 空白对照。

质粒DNA原液经PCR扩增后,进行琼脂糖凝胶电泳。由图4可知,泳道1~6皆见明亮特异性条带,条带大小与原切取条带大小相符(泳道1~2:481 bp,泳道3~4:393 bp,泳道5~6:289 bp),背景干净无杂带,空白对照无非特异性条带,为测序结果作进一步佐证。

2.4 狗、狐、貂模拟混合样品检测

10 份随机抽取的模拟混合样品经DNA提取、多重PCR检测体系扩增后,得到琼脂糖凝胶电泳图谱。

由图5可知,条带有无及明暗情况与各样品原模拟混合方式大致相符。阳性对照组条带清晰且亮度均一,阴性对照组无非特异性扩增,表明该多重PCR检测体系特异性良好,3 种特异性成分比例变化不影响检测准确性,可满足掺假肉的日常检测。

泳道M. 100 bp DNA Ladder;泳道1. 阳性对照;泳道N. 空白对照;图A泳道2~6. 样品A1~A5;图B泳道2~6. 样品B1~B5。

2.5 狗、狐、貂市售样品检测

对50 份市售样品,包括猪肉、牛肉、羊肉、马肉、驴肉、鸡肉、鸭肉各3 份、狗肉29 份进行检测,结果发现:21 份非狗肉样品中均未检测到狗/狐/貂源性成分;29 份狗肉样品中,2 份出现貂特异性条带,1 份出现狐特异性条带,其余皆为狗肉。

3 讨论

近年来多重PCR技术迅速发展,具有简单、快速、灵敏度和准确性高等优点[25],可以同时分析多个样品,应用前景非常广阔[26-29]。本研究根据狗、狐、貂动物基因序列的位点差异设计狗、狐、貂特异性引物,进行多重PCR檢测。结果表明,所设计的引物只有在相应狗、狐、貂物种模板DNA存在的情况下才会发生反应,产生特异性目的条带,而且3 种物种之间DNA模板均无交叉反应,狗、狐、貂引物特异性好,而且其灵敏度可以达到10-4 ng/μL;经克隆测序分析证明所选取靶基因序列可作为种属特异性检测序列,用于犬型总科动物(狗、狐、貂)DNA成分检测。该方法的建立与应用为打击肉类产品市场违法违规行为提供了技术保障,对于政府部门的监督管理工作具有极其重要的意义。

4 结 论

本研究建立的多重PCR检测试剂盒可精准鉴别肉制品中狗、狐、貂源性成分,最低检测限可达10-4 ng/?L,特异性、灵敏度良好,具有较显著的现实意义和应用价值。对50 份市售样品进行检测,结果皆与长春食品药品检测中心鉴定结果相符,进一步证实本研究所建立多重PCR检测体系准确性良好。相较于荧光定量PCR检测技术[30],该试剂盒不受标准曲线及背景荧光的影响,无需额外设计探针及购买昂贵的检测仪器,更经济便捷,节省实验材料,为操作者提供便利,保证检测效率的同时维持检测的低成本,可广泛应用于常见犬型总科动物(狗、狐、貂)DNA成分检测。

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