41份木槿种质资源的AFLP遗传多样性分析

2021-08-31 05:54陈俊强董章凯段正洪
山东林业科技 2021年4期
关键词:亲缘木槿多态性

窦 霄,陈俊强,董章凯,刘 红,段正洪

(1.山东省林木种苗和花卉站,山东济南250014;2.山东省林业科学研究院,山东济南250014;3.滕州市国有西岗苗圃,山东滕州277519)

木槿(Hibiscus syriacus)为锦葵科木槿属小乔木或灌木,是我国园林绿化和庭院绿化中常用的观赏植物,可做花篱式绿篱,孤植和丛植均可[1]。木槿开花量大,花色、花型多变,花期可由6月维持至10月,抗逆性较强,具备一定的吸附有害气体和滞尘功能[2]。木槿种质资源丰富,栽培历史悠久,分布范围广泛。但是目前我国对木槿的繁育栽培技术和园林应用研究较多[3-7],对其遗传背景、亲缘关系尚未开展深入系统的研究。国内方面,肖芬等[8]通过对27 个木槿品种进行ISSR-PCR 分子鉴定,聚类分析结果与形态分类和孢粉学分析的结果具有较强的一致性。赵艺璇等[9-10]使用SRAP 法扩增了39 个木槿品种的DNA 条带,通过UPGMA 法进行聚类分析,得出了不同木槿变型及变种之间的遗传距离较远,不同木槿品种之间遗传距离相对较近,木槿亲缘关系远近与木槿表型性状之间存在一定联系。此外,还对22 个木槿品种进行了花粉形态和分类研究,通过扫描电镜进行形态特征及外壁纹饰观测,然后使用R 型聚类分析和主成分分析等方法,得出木槿种内蓝紫色单瓣品种之间亲缘关系相对较近,半重瓣品种之间亲缘关系相对较近,白色单瓣品种之间亲缘关系相对较近。国际方面,Sang Hoon Kim 等[11]用AFLP 分子标记及形态学评价对127 个木槿品种进行分类,并分析了品种间的亲缘关系。截至目前,只有少量木槿品种的遗传多样性和亲缘关系比较清晰,尚有大量木槿品种的遗传多样性和亲缘关系有待研究。本研究旨在对41 份木槿品种进行AFLP 分析,准确了解其遗传多样性及亲缘关系,为今后进一步挖掘优良木槿种质、培育新优品种和开展木槿育种研究提供有益参考和物质基础。

1 材料与方法

1.1 材料与来源

供试材料于2020年8月取自浙江省嘉善县、江苏省沭阳县和山东省临邑县,共计种质41 份(见表1)。采集其健康、无病虫害的嫩叶,于低温下保存、运输,并立即提取其基因组DNA。

表1 供试材料Table 1 Materials used in the experiment

1.2 研究方法

1.2.1 DNA 提取

采用Murray 和Thompson 的CTAB 法[12]从幼叶中提取DNA。提取后的DNA 用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测质量,剩余材料-80℃超低温保存。

1.2.2 AFLP 分析

利用北京鼎国生物技术公司生产的AFLP 试剂盒(EcoR I/Mse I 型)及其操作指南进行,分析41 份木槿种质间的亲缘关系。

1.2.2.1 限制性酶切及连接反应

限制性酶切及连接反应体系为20 μL,在0.5 mL离心管中依次加入对照模板DNA 4 μL (50 ng/μL),Adapter 1 μL,EcoR I/Mse I 2 μL,10×Reaction buffer 2.5 μL,ATP (10 mM) 2.5 μL,T4 Ligase 1 μL,ddH2O 7 μL。将混合液在离心管中混匀离心数秒,混匀离心数秒,37℃保温5 h,8℃保温4 h,4℃过夜。

1.2.2.2 预扩增反应

预扩增反应体系为25 μL,在0.2 mL 离心管中依次加入模板DNA 2 μL,Pre-ampmix 1 μL,dNTPs 1 μL,10×PCR buffer2.5 μL,Taq DNA polymerase 0.5 μL,ddH2O 18 μL。离心数秒,按照下列参数进行PCR扩增循环30 轮:94℃变性2 min;94 ℃变性30 s,56℃复性30 s,72℃延伸80 s;72℃延伸5 min。预扩增产物稀释20 倍,- 80℃保存备用。

1.2.2.3 选择性扩增反应

从64 对EcoRⅠ/MseⅠ引物对中筛选出带型清晰且多态性带较好的引物对9 对(表2)。扩增体系为25 μL,其中预扩增产物稀释后的DNA 样品2.0 μL,10 × PCR buffer 2.5 μL,EcoRI 引物和MseI 引物各1.0 μL (各8 种),dNTPs 0.5 μL,TaqDNA 聚合酶0.5 μL,ddH2O 17.5 μL。以上混匀,离心数秒,进行PCR 循环。第1 轮扩增参数:94℃30 s,65℃30 s,72℃80 s,以后每轮循环温度递减0.7℃,扩增12轮。接着按下列参数扩增23 轮:94℃30 s,55℃30 s,72℃80 s,最后延伸5 min。

1.2.3 数据处理与分析

使用ABI377 自动测序仪对扩增产物进行电泳分离检测,DNA 测序仪将自动保存胶图。运用GENESCAN 3.1 分析软件打开胶图,对胶图进行数据提取。运用NTSYSpc2.1 软件,将原始数据转变为“0,1”矩阵(根据记录带的有无,有带的记为“1”,无带的记为“0”)。使用POPGEN 32 软件计算标记位点的多态性条带(PPB)、多态信息量(PIC)和有效等位基因数(Ne)。运用NTSYSpc2.1 软件,并根据相似性系数对41 份木槿种质采用非加权配对类平均法(UPGMA)进行聚类分析。

2 结果与分析

2.1 AFLP 扩增结果分析

从64 对AFLP 引物组合中筛选出9 对带型清晰稳定、呈多态性的引物,对41 份木槿种质的DNA进行选择性扩增(见表2),获得了较好的扩增效果。共扩增出733 条DNA 条带,多态性条带699 条,多态性位点平均95%,表明不同木槿种质之间存在一定的遗传差异。9 对引物中,扩增位点最多的是EACG/M-CAA 组合,为162 个;最少的是E-AGG/MCTT 组合,为114 个。扩增的多态性位点比率最高的是E-ACG/M-CAA,为100%;最低的是E-AGC/M-CAA 组合,为92%。

表2 木槿AFLP 分析结果Table 2 Results of AFLP analysis of Hibiscus syriacus

2.2 遗传多样性分析

Nei′s 基因多样性指数(H)和Shannon 信息指数(I)是度量遗传多样性水平的常用指标。41 份木槿种质的Nei′s 基因多样性指数为1.1801~1.2515,平均1.2076;Shannon 信息指数为0.1863~0.2445,平均0.2035,表明供试木槿种质有较高的遗传多样性。

2.3 遗传相似性分析

采用Nei- Li 相似系数(GS)对扩增结果进行计算,得到41 份木槿种质的遗传相似性矩阵。通过AFLP 检测结果分析,41 份木槿种质的遗传相似系数的变异范围为0.702~0.932。通过相似系数矩阵看出,在供试的木槿种质中,其中38(双丰4)和40(双丰6)的遗传相似系数最大,为0.932,且两者均位于山东省临邑县,其遗传距离最小,亲缘关系最近;20(红心)与34(小木槿)的遗传相似系数最小,为0.702,且两者分别位于浙江省嘉善县和江苏省沭阳县,其遗传距离最大,亲缘关系最远。

2.4 聚类分析

在遗传相似性系数基础上,通过UPGMA 法对41 份木槿种质进行聚类分析并绘制树状图(图1)。以相似系数0.87 为界,可将供试材料分为5 大类:第1 类仅含1 份种质,为1(柔粉红心重瓣),来源于浙江省嘉善县;第2 类有29 份种质,包括2(粉色雪纺)、3(木桥)、31(紫色绒球)、4(紫色法国酒馆)、9(牡丹)、24(千丝绊)、25(雪纺)、26(中国雪纺)、28(长苞重瓣紫粉)、5 (蓝莓冰沙)、15 (白花单瓣木槿)、7(雅致)、18(粉红巨人)、8(薰衣草雪纺)、10(紫柱)、11(花叶木槿)、14(薄荷)、21(紫玉)、6(玫瑰)、16(胭脂红)、17(单瓣紫通紫粉)、22(蓝色雪纺)、23(马丽娜)、13(阿芙罗狄)、20(红心)、27(白花重瓣木槿)、30(夏威夷)、12(树莓冰沙)、19(汉帛),其中25 份种质来源于浙江省嘉善县,4 份种质来源于江苏省沭阳县;第3 类仅含1 份种质,为29(红色法国酒馆),来源于浙江省嘉善县;第4 类有9份种质,包括32(紫裙)、36(双丰2)、38(双丰4)、40(双丰6)、39(双丰5)、37(双丰3)、41(双丰7)、35(双丰1)、33(星光雪纺),其中7 份种质来源于山东省临邑县,2 份种质来源于江苏省沭阳县;第5 类仅含1 份种质,为34(小木槿)。从聚类分析结果可以看出,41 份木槿种质资源的分类与其地理分布位置关系较大,同一来源地的木槿种质具有较高的遗传相似性,亲缘关系较近。

图1 41 份木槿样品的AFLP 分子聚类图Figure 1 The dendrogram of 41 Hibiscus syriacus samples by clustering analysis with AFLP fingerprint

3 结论与讨论

遗传多样性是生物生存、发展和进化的前提,是物种长期进化产生的结果[13]。本研究采用AFLP分子标记技术,获得了41 份供试木槿种质间的遗传变异情况及亲缘关系等信息。结果显示,41 份木槿种质间的遗传相似系数(GS) 为0.702~0.932,多态性位比率、Nei 基因多样性指数、Shannon 信息指数、遗传多样性的平均值分别为95%、1.2076、0.2035 和0.1282,表明41 份木槿种质资源具有较高的遗传多样性。同时,通过聚类分析得出,在遗传相似系数0.87 处可以将供试木槿种质划分为5 大类,且大部分来源于同一地区的木槿种质基本处于同一类,表明从浙江省嘉善县、江苏省沭阳县、山东省临邑县收集的木槿种质资源,在遗传多样性及亲缘关系方面与地理分布有着较为明显的关系。此外,34(小木槿)与其他木槿种质的亲缘关系均较远,是否与其他供试种质属于同一品种群还有待进一步试验证明。

木槿作为我国常用的园林绿化植物,具备花期长、花色艳、抗性强等特点,其资源的种类和数量繁多,分布范围广泛。本研究在分子水平上研究分析了木槿种质资源的遗传多样性,为木槿品种选育、良种保护等方面提供了参考依据。但是本研究所收集的41 份木槿种质资源仅涉及浙江、江苏、山东的3 个县,收集范围相对集中,因此研究结果在取材范围上有着一定的局限性。今后,还需进一步明确木槿种质资源的分布情况,扩大资源收集范围,并结合分子标记、形态学、孢粉学等鉴定方法,更加全面、准确地研究木槿种质资源的遗传多样性。

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