中国农业科学院油料作物研究所研究团队构建首个油菜基因转录数据库

近日， 中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病性改良创新团队破译了油菜基因组的全转录信息密码，构建了油菜十万余个基因的转录全景图，使得油菜基因功能研究第1 次有了标准的可参考的基因转录数据库， 将有力支撑油菜功能基因的相关研究。 该项研究成果在线发表在《The Plant Journal》（植物学报）上。

据团队首席科学家刘胜毅研究员介绍，油菜基因组包含约12 亿个碱基和十余万个基因，如何解读这些海量的基因组信息成为功能基因研究的重要任务。根据中心法则，基因通过转录形成mRNA 再翻译成蛋白质。 由于基因的转录通常存在多种可变的剪切方式，因此一个基因可形成许多种不同的mRNA。此前，由于技术和资源的限制，缺乏油菜全基因组水平所有基因的转录mRNA 数据库，因此导致油菜基因功能研究缺乏可查询、参考的基因注释信息。 为了突破这一瓶颈，该团队采用最新的三代测序技术，准确测定了油菜全长转录组，并自主开发了一套用于多倍体油菜复杂基因组的分型方法，绘制油菜基因组的转录全景图，构建油菜标准的参考转录本数据库。 该研究得到国家重点研发计划项目、国家自然科学基金项目和中国农科院科技创新工程等项目资助。