李婷婷 陈石 陈明会 孔祥阳(通讯作者)
(昆明理工大学医学院疾病与药物遗传实验室 云南 昆明 650500)
慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)是由于气道中的一组气流受限并且持续存在,呈现进行性发展,与此同时一些气道和肺慢性炎症反应疾病会伴随发生,且还可引起由有害颗粒或气体导致的全身性不良效应。COPD患者有严重的呼吸困难症状,生活质量较差[1]。其主要特点是慢性低度全身炎症和肺部老化(炎症),据研究这与有害颗粒或气体介导的氧化应激引起的类固醇抵抗有关。从目前看来,COPD是一种不可治愈但可预防的呼吸道疾病,具有极高发病率,对人类健康有着极大的威胁。据分析估计,至2020年COPD将成为全球第三大最常见死亡疾病。
表观遗传学是指在外源刺激下改变基因组功能的不同种过程总称,同时也提供了一种使基因表达能稳定遗传给下一代细胞的分子机制。表观遗传修饰可通过多种机制发生,例如DNA甲基化、翻译后组蛋白修饰、非编码RNA等,并根据基因内的位置而抑制或激活转录。DNA甲基化也是一种共价化学修饰,以S腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,由DNA甲基化转移酶(DNMTs)催化,将胞嘧啶核苷酸的嘧啶环第五位碳原子甲基化,并与其3’端鸟嘌呤形成甲基化的CpG岛,进而导致基因表达发生变化。迄今为止,DNA甲基化仍是研究最多的表观遗传学修饰。因此本章就COPD与DNA甲基化之间的关系进行讨论。
据报道COPD与很多甲基化遗传位点有很大关联,而甲基化位点具有遗传功能,其可通过DNA的复制来实现,这一过程是借助甲基化酶来完成的。甲基化转移酶有两种:(1)持续性DNA甲基化转移酶——DNMT1,其在DNA双链其中一条链甲基化时才发挥作用,将DNA双链完全甲基化,而且还能对接下来DNA复制后的新链的甲基化产生影响;其还能阻断转录,而这一过程则需要组蛋白去乙酰基转移酶的配合;(2)从头甲基转移酶——DNMT3a、DNMT3b,这种酶作用于CpG岛,先使其一半甲基化,之后逐渐全甲基化。
研究显示,DNA的高甲基化对COPD患者的病情有很大的影响,并发现某些基因的启动子区域高甲基化会导致COPD患者肺功能降低。同时大规模的分析表明,DNA甲基化可能是COPD的生物标记物,可以作为突显COPD发病机理的新途径。
COPD是一种呼吸道疾病,特点是持续性气流受限,这主要是由于香烟烟雾和空气中的颗粒物所致,所以环境因素对其影响巨大。目前证据表明,香烟烟雾是COPD的主要危险因素,其他环境因素包括大气污染、室内环境污染和职业环境暴露等[1]。
在世界范围内,吸烟都是最常见的危险因素。而其他的环境污染虽不是主要原因但其对COPD也有一定影响。COPD和空气污染的关系在发达国家早已被评估,很多国家评估了COPD和空气污染间的关系,发现空气污染是COPD的一个危险因素[2]。
COPD是一种以遗传和表型异质性为特征的吸烟相关疾病,目前吸烟是COPD极为重要的并且可预防的危险因素。研究者在对患有COPD的吸烟者淋巴母细胞和肺泡巨噬细胞中观察时发现DNA甲基化现象,同时芳香烃受体阻遏物协调变化,这表明香烟烟雾介导的表观遗传效应对COPD发生有影响。香烟烟雾中含有1015种自由基和4700种不同化学成分,估计约有15%~20%的吸烟者发展成为COPD。这是由于香烟烟雾直接或间接影响某些易感基因的DNA甲基化,而对吸烟者造成影响,故而其患COPD风险很高。另一方面,香烟烟雾介导的表观遗传学变化,导致转录因子、辅酶和聚合酶DNA可达性的改变,从而导致转录基因激活,引发炎症。现有证据表明DNA甲基化异常会导致炎症,这是由于DNA的低甲基化使得炎症基因表达的上调。而炎症反应又增加活性氧的产生,肺部则成为活性氧和自由基损伤的直接靶点。几项研究表明,活性氧参与了生理和病理条件下的DNA甲基化反应。事实上,活性氧过度生产可能会影响表观遗传机制。故而促进COPD相关的病理生理变化并增加肺癌发展的风险。
综上,发现COPD中发生DNA甲基化与香烟烟雾导致的炎症反应关系密切。近年来有证据表明,在不同类型的炎症反应中,DNA甲基化对炎症反应都有调控作用。而同时炎症反应又会导致甲基化异常,某些炎症因子可促进DNMTs的表达并增加其活性,引起DNA的异常甲基化。因此,在DNA甲基化和香烟烟雾相互作用下会影响COPD患者肺部各种细胞和生理、病理过程,并加重病情。
3.2.1 大气污染
随着环境污染的日益严重,污染物质会附着在大气颗粒物表面。大气颗粒物的组成成分十分的复杂,包含许多组分,例如物理、化学、生物等。截止2014年,我国城市尤其是北部大气颗粒物为首要污染物,经分析后发现这些污染物以PM2.5为主。人体通过呼吸将这些颗粒物吸入,由各种循环系统进入各种器官,而颗粒物表面同时附着许多的氧化物,可引起机体产生氧自由基,从而形成氧化应激反应,对人体造成越来越大的影响。而全基因组DNA甲基化的改变与氧化应激有关,COPD的其中一个特点就是氧化应激增加。
氧化应激引起多种激酶信号通路,从而导致染色质改变(组蛋白乙酰化/去乙酰化和组蛋白甲基化/去甲基化),进而导致了炎症、衰老等发生。而组蛋白和DNA甲基化的表观遗传标记之间又存在交叉,烟雾和氧化剂都可改变组蛋白乙酰化/去乙酰化和甲基化/去甲基化,从而增强炎症反应的基因表达[3]。在本文中我们体会了炎症反应与DNA甲基化之间的关系,在两者相互作用下诱导了COPD的发生。
3.2.2 室内与工作环境污染
我国COPD流行率是8.2%(男性12.4%,女性5.1%),室内环境污染可能对女性影响较大,其污染物主要来源于生物燃料和烟雾(多数源于烹饪)。室内生物燃料暴露已经成为COPD的独立危险因素,因此认为生物燃料所产生的室内空气污染与吸烟有协同作用,长时间暴露于烟雾中,可引起体内氧化应激反应。
工作中的环境污染物主要是粉尘,多环芳烃、重金属等。已证实多环芳烃暴露能提高呼吸系统疾病的发病风险,包括哮喘、COPD和肺癌等;重金属是影响DNA甲基化的主要因素之一,可导致COPD的发生。
越来越多的研究显示,多个基因联合检测甲基化情况可以显著提高非小细胞肺癌的检出率,可达到80%以上,这对非小细胞肺癌的诊断具有非常重要的价值。故而可以将这种联合多基因运用到COPD中,希望能够对COPD早期诊断起重要作用。